Job Description P00452 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:38 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 622 % Identity 30% Template c2wghA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:ribonucleoside-diphosphate reductase large PDBTitle: human ribonucleotide reductase r1 subunit (rrm1) in complex2 with datp and mg. Resolution 2.30 Å

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		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.				120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.
Query Sequence		L	A	A	R	L	A	I	F	H	L	R	K	K	A	Y	G	Q	F	E	P	P	A	L	Y	D	H	V	V	K	M	V	E	M	G	K	Y	D	N	H	L	.	.	.	L	E	D	Y	T	E	E	E	F	K	Q	M	D	T	F	I	D	H	D	R	D	M	T	F	S	Y	A	A	V	K	Q	L	E	G	K	Y	L
Query Conservation																																										.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	A	R	I	A	V	S	N	L	H	K	E	T	K	K	V	F	S	D	V	M	E	D	L	Y	N	Y	I	N	P	H	N	G	K	H	S	P	M	V	A	K	S	T	L	D	I	V	L	A	N	K	D	R	L	N	S	A	I	I	Y	D	R	D	F	S	Y	N	Y	F	G	F	K	T	L	E	R	S	Y	L
Template Known Secondary structure														T	S		S													B		T	T	T			B			S	S											T							T			G	G	G	G	G	G	S												T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		V	Q	N	R	V	T	G	E	I	Y	E	S	A	Q	F	L	Y	I	L	V	A	A	C	L	F	S	N	Y	P	R	E	T	R	L	Q	Y	V	K	R	F	Y	D	A	V	S	T	F	K	I	S	L	P	T	P	I	M	S	G	V	R	T	P	T	R	Q	F	S	S	C	V	L	I	E	C	.	G	D	S	L	D
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence					.	.																						.	.	.	.	.																																												.
Template Conservation					.	.																						.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	I	.	.	N	G	K	V	A	E	R	P	Q	H	M	L	M	R	V	S	V	G	I	H	K	.	.	.	.	.	E	D	I	D	A	A	I	E	T	Y	N	L	L	S	E	R	W	F	T	H	A	S	P	T	L	F	N	A	G	T	N	R	P	Q	L	S	S	C	F	L	L	S	M	K	D	D	S	I	E
Template Known Secondary structure					.	.	T	T																			T	.	.	.	.	.	T															T	S											T	T	S	S	S														S	S
Template Predicted Secondary structure					.	.																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.			160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180						.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.		.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		S	I	N	A	T	S	S	A	I	V	K	Y	V	S	Q	R	A	G	I	G	I	N	A	G	R	I	R	A	L	G	S	P	I	R	G	G	E	A	F	H	T	G	C	I	P	F	Y	K	H	F	Q	T	A	V	K	S	C	S	Q	G	G	.	V	R	G	G	A	A	T	L	F	Y	P	M	W	H	L	E	V	E
Query Conservation																																																															.
Alig confidence																																																															.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	Y	D	T	L	K	Q	C	A	L	I	S	K	S	A	G	G	I	G	V	A	V	S	C	I	R	A	T	G	S	Y	I	A	G	T	N	G	N	S	N	G	L	V	P	M	L	R	V	Y	N	N	T	A	R	Y	V	D	Q	G	G	N	K	R	P	G	A	F	A	I	Y	L	E	P	W	H	L	D	I	F
Template Known Secondary structure																T	T								T	T	S			T	T				G	G	G	T																				S		S	T	T	S	S											T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	L	V	L	K	N	N	R	G	V	E	G	N	R	V	R	H	M	D	Y	G	V	Q	I	N	K	L	M	Y	T	R	L	L	K	G	E	D	I	T	L	F	S	P	S	D	V	P	G	L	Y	D	A	F	F	A	D	Q	E	E	F	E	R	L	Y	T	K	Y	E	K	D	D	S	I	R	K	Q	R	V	K
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.	.																					.
Template Conservation																																																								.	.	.																					.
Template Sequence		E	F	L	D	L	K	K	N	T	G	K	E	E	Q	R	A	R	D	L	F	F	A	L	W	I	P	D	L	F	M	K	R	V	E	T	N	Q	D	W	S	L	M	C	P	N	E	C	P	G	L	D	E	V	W	.	.	.	G	E	E	F	E	K	L	Y	A	S	Y	E	K	Q	G	R	V	R	K	V	.	V	K
Template Known Secondary structure				T	T	T	T		S	S	S		G	G	G			T	T	S																T	T						B		T	T	T	S	T	T	G	G	G			.	.	.	T													T	T			S			.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.																					.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.				.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.		.	.
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		A	V	E	L	F	S	L	M	M	Q	E	R	A	S	T	G	R	I	Y	I	Q	N	V	D	H	C	N	T	H	S	P	F	D	P	A	I	A	P	V	R	Q	S	N	L	C	L	E	I	A	L	P	T	K	P	L	N	D	V	N	D	E	N	G	E	I	A	L	C	T	L	S	A	F	N	L	G	A	I	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																																	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	Q	L	W	Y	A	I	I	E	S	Q	T	E	T	G	T	P	Y	M	L	Y	K	D	S	C	N	R	K	S	N	.	Q	Q	N	L	G	T	I	K	C	S	N	L	C	T	E	I	V	E	Y	T	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	V	A	V	C	N	L	A	S	L	A	L	N	M	Y	V	T
Template Known Secondary structure																	S													T		T	.	T	G	G	G								T	T	S							B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B											G	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure																																	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.									.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
						473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	N	N	L	D	E	L	E	E	L	A	I	L	A	V	R	A	L	D	A	L	L	D	Y	Q	D	Y	P	I	P	A	A	K	R	G	A	M	G	R	R	T	L	G	I	G	V	I	N	F	A	Y	Y	L	A	K	H	G	K	R	Y	S	D	G	S	A	N	N	L	T	H	K	T	F	E	A	I	Q
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	E	H	T	Y	D	F	K	K	L	A	E	V	T	K	V	V	V	R	N	L	N	K	I	I	D	I	N	Y	Y	P	V	P	E	A	C	L	S	N	K	R	H	R	P	I	G	I	G	V	Q	G	L	A	D	A	F	I	L	M	R	Y	P	F	E	S	A	E	A	Q	L	L	N	K	Q	I	F	E	T	I	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S		B																										S	S																											T	T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	L	L	K	A	S	N	E	L	A	K	E	Q	G	A	C	P	W	F	N	E	T	T	Y	A	K	G	I	L	P	I	D	T	Y	K	K	D	L	D	T	I	A	N	E	P	L	H	Y	D	W	E	A	L	R	E	S	I	K	T	H	G	L	R	N	S	T	L	S	A	L	M	P	S	E	T	S	S	Q	I
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	A	L	E	A	S	C	D	L	A	K	E	Q	G	P	Y	E	T	Y	E	G	S	P	V	S	K	G	I	L	Q	Y	D	M	W	N	V	T	P	T	D	L	.	.	.	.	.	.	W	D	W	K	V	L	K	E	K	I	A	K	Y	G	I	R	N	S	L	L	I	A	P	M	P	T	A	S	T	A	Q	I
Template Known Secondary structure																			T	T		T	T	S	S	G	G	G	T							T	T					S	S	.	.	.	.	.	.	S															S		S			B						T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.							.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
		629	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.											650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	N	A	T	N	G	I	E	P	P	R	G	Y	V	S	I	K	A	S	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	L	R	Q	V	V	P	D	Y	E	H	L	H	D	A	Y	E	L	L	W	E	M	P	G	N	D	G	Y	L	Q	L	V	G	I	M	Q	K	F	I	D	Q	S	I	S	A	N	T	N
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																								.
Template Sequence		L	G	N	N	E	S	I	E	P	Y	T	S	N	I	Y	Q	I	V	N	P	H	L	L	K	D	L	T	E	R	G	L	G	S	I	Q	S	I	P	E	I	P	D	D	L	K	Q	L	Y	K	T	V	W	E	I	.	S	Q	K	T	V	L	K	M	A	A	E	R	G	A	F	I	D	Q	S	Q	S	L	N	I	H
Template Known Secondary structure			T				T	T						S	B				B												T					T	T		S	S	S								T			T	T	S	S	.														T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																								.
Template SS confidence
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.		.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.		.	730	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		Y	D	P	S	R	F	P	S	G	K	V	P	M	Q	Q	L	L	K	D	L	L	T	A	Y	K	F	G	V	K	T	.	L	Y	Y	Q	N	T	R
Query Conservation																																.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.		.																						.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.		.
Template Sequence		I	.	.	.	.	.	.	A	.	E	P	N	Y	G	K	L	T	S	M	H	F	Y	G	W	K	Q	G	L	K	T	G	M	Y	Y	L	R	T	R
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	S	.	S																T	T		S				S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.		.
Template SS confidence
		712							.		.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.