Job Description P00452 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:38 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 546 % Identity 20% Template c1xjeA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:ribonucleotide reductase, b12-dependent; PDBTitle: structural mechanism of allosteric substrate specificity in a2 ribonucleotide reductase: dttp-gdp complex Resolution 1.90 Å

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		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.											.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	M	D	T	F	I	D	H	D	R	D	M	T	F	S	Y	A	A	V	K	Q	L	E	G	K	Y	L	V	Q	N	R	V	T	G	E	I	Y	E	S	A	Q	F	L	Y	I	L	V	A	A	C	L	F	S	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	E	T	R	L	Q	Y	V	K	R	F	Y	D	A
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	S	D	L	I	S	R	W	I	D	V	E	P	S	K	N	A	Q	I	I	L	R	D	R	Y	F	M	K	D	L	D	G	N	Y	L	E	T	K	W	E	D	V	A	R	R	V	A	R	V	V	A	T	A	E	L	L	N	P	S	Y	K	K	N	E	K	L	D	R	I	K	E	W	E	D	I	F	F	R	V
Template Known Secondary structure												T															T	S		B		T	T			B	S			S														G	G	G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	S	T	F	K	I	S	L	P	T	P	I	M	S	G	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	T	R	Q	F	S	S	C	V	L	I	E	C	G	D	S	L	D	S	I	N	A	T	S	S	A	I	V	K	Y	V	S	Q	R	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	A	R	L	F	I	P	N	S	P	T	L	F	N	A	G	L	G	V	K	H	D	L	L	W	K	P	I	D	Q	M	T	L	E	D	Y	E	E	I	Y	R	S	R	N	H	L	H	M	L	S	A	C	F	V	V	P	V	G	D	S	I	E	E	I	F	E	A	V	K	E	Y	A	L	I	T	K	V	G	G
Template Known Secondary structure				T	T	S											T	T	T	T	S						S	S		G	G	G															T	T													S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	G	I	N	A	G	R	I	R	A	L	G	S	P	I	R	G	G	E	A	F	H	T	G	C	I	P	F	Y	K	H	F	Q	T	A	V	K	S	C	S	Q	G	G	V	R	G	G	A	A	T	L	F	Y	P	M	W	H	L	E	V	E	S	L	L	V	L	K	N	N	R	G	V	E	G	N	R	V	R	H
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	G	S	N	F	S	E	L	R	P	K	G	S	F	V	A	G	T	H	G	K	A	S	G	P	V	S	F	M	H	V	F	N	S	A	I	S	V	V	K	Q	G	S	R	R	R	G	A	L	M	G	I	L	N	I	N	H	P	D	I	E	E	F	I	D	A	K	K	.	.	.	.	.	.	.	V	L	N	F
Template Known Secondary structure								T	T	S			T	T				T	T	T	T																		T	T				T	T	T											T	T	S	T	T						T	S			.	.	.	.	.	.	.			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230								.	.	.	.
		333	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.
Query Sequence		M	D	Y	G	V	Q	I	.	.	.	N	K	L	M	Y	T	R	L	L	K	G	E	D	I	T	L	F	S	P	S	D	V	P	G	L	Y	D	A	F	F	A	D	Q	E	E	F	E	R	L	Y	T	K	Y	E	K	D	D	S	I	R	K	Q	R	V	K	A	V	E	L	F	S	L	M	M	Q	E	R	A	S	T
Query Conservation									.	.	.
Alig confidence									.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	L	S	V	G	F	P	M	D	K	K	E	I	L	K	L	Y	E	E	D	G	E	L	E	L	S	H	P	R	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	K	K	V	K	I	R	E	L	F	R	K	I	A	T	N	A	W	K	S
Template Known Secondary structure										S											T	T								T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.						.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	R	I	Y	I	Q	N	V	D	H	C	N	T	H	S	P	F	D	P	A	I	A	P	V	R	Q	S	N	L	C	L	E	I	A	L	P	T	K	P	L	N	D	V	N	D	E	N	G	E	I	A	L	C	T	L	S	A	F	N	L	G	A	I	.	.	.	.	.	N	N	L	D	E	L	E	E	L	A	I	L
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	P	G	L	A	F	L	G	E	M	N	K	Y	Y	P	L	.	Y	P	H	R	K	I	N	S	T	N	P	C	G	E	I	G	L	S	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	C	N	L	G	S	I	D	V	A	K	F	Y	N	N	G	F	V	D	L	E	A	L	Q	E	L	V	Q	I
Template Known Secondary structure		S													T		T	T	.	T	T	T	S							T	T	S						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										G	G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330													.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	R	A	L	D	A	L	L	D	Y	Q	D	Y	P	I	P	A	A	K	R	G	A	M	G	R	R	T	L	G	I	G	V	I	N	F	A	Y	Y	L	A	K	H	G	K	R	Y	S	D	G	S	A	N	N	L	T	H	K	T	F	E	A	I	Q	Y	Y	L	L	K	A	S	N	E	L	A	K	E	Q	G	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	V	R	F	L	D	N	V	I	D	V	N	V	F	P	I	D	K	I	T	K	A	V	K	E	S	R	R	L	G	L	G	I	M	G	F	A	D	L	L	Y	K	L	E	I	P	Y	N	S	Q	E	A	R	D	F	A	A	N	L	M	A	F	I	A	L	H	A	H	R	T	S	Y	E	L	G	K	E	K	G	N
Template Known Secondary structure																S	S																												T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	P	W	F	N	E	T	T	Y	A	K	G	I	L	P	I	D	T	Y	K	K	D	L	D	T	I	A	N	E	P	L	H	Y	D	W	E	A	L	R	E	S	I	K	T	H	G	L	R	N	S	T	L	S	A	L	M	P	S	E	T	S	S	Q	I	S	N	A	T	N	G	I	E	P	P	R	G	Y	V	S	I
Query Conservation
Alig confidence														.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	P	L	L	E	I	S	R	Y	R	T	E	.	D	N	F	V	P	F	A	M	G	M	S	N	Y	D	D	.	.	.	.	.	.	E	I	R	E	V	M	K	M	T	K	E	F	R	R	N	V	A	L	L	T	I	A	P	T	G	S	I	S	N	I	A	D	T	S	S	G	L	E	P	N	F	L	L	A	Y	T
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G	S					S	.	S	S			S	S				S		T	T			.	.	.	.	.	.									T	T	T			S		S			B		B				T	T					T	T	S			T	T				S		S
Template Predicted Secondary structure														.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.							.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
		645	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	S	K	D	G	I	L	R	Q	V	V	P	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	L	H	D	A	Y	E	L	L	W	E	M	P	G	N	D	G	Y	L	Q	L	V	G	I	M	Q	K	F	I	D
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		R	F	V	T	K	E	D	G	T	K	E	P	L	L	Y	V	N	Q	V	L	R	E	K	L	N	P	E	I	L	K	R	I	E	K	E	L	I	E	K	G	S	L	K	D	I	P	D	V	P	E	K	I	K	K	V	F	V	V	A	L	D	I	.	D	P	M	D	H	L	L	M	Q	D	A	F	Q	R	Y	V	D
Template Known Secondary structure							S	S	S																S																S	S	S	T	T		T	T	S								S			G	G	G	S	.														T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.		.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
		691	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	S	I	S	A	N	T	N	Y	D	P	S	R	F	P	S	G	K	V	P	M	Q	Q	L	L	K	D	L	L	T	A	Y	K	F	G	V	K	T	L	Y	Y	Q	N	T	R	D
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	N	I	S	K	T	I	N	M	.	.	.	.	.	.	P	Q	S	A	T	V	D	D	V	L	N	V	Y	L	E	A	L	R	T	N	V	R	G	I	T	V	Y	R	D	G	S
Template Known Secondary structure		S		B							.	.	.	.	.	.		T	T																S	S		S							T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		593	.	.	.	.	.	.	600	.							.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.