Job Description P10902 Confidence 99.26% Date Thu Jan 5 11:32:21 GMT 2012 Rank 161 Aligned Residues 266 % Identity 18% Template c2v3aA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:rubredoxin reductase; PDBTitle: crystal structure of rubredoxin reductase from pseudomonas2 aeruginosa. Resolution 2.4 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.				.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.
Query Sequence		S	C	D	V	L	I	I	G	S	G	A	A	G	L	S	L	A	L	R	L	A	D	Q	H	.	.	.	Q	V	I	V	L	S	K	G	P	V	T	E	G	S	T	F	Y	A	Q	G	G	I	A	A	V	F	D	E	T	D	S	I	D	S	H	V	E	D	T	L	I	A	G	A	G	I	C	D	R	H	A	V	E
Query Conservation																										.	.	.
Alig confidence																										.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	P	L	V	I	I	G	T	G	L	A	G	Y	N	L	A	R	E	W	R	K	L	D	G	E	T	P	L	L	M	I	T	A	D	D	G	R	S	Y	S	K	P	M	L	S	T	G	F	S	K	N	K	D	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											S												T	T		S	S	S							S	S							G	G	G	G	G	G	T	T	T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	A	S	N	A	R	S	C	V	Q	W	L	I	D	Q	G	V	L	F	D	T	H	I	Q	P	N	G	E	E	S	Y	H	L	T	R	E	G	G	H	S	H	R	R	I	L	H	A	A	D	A	T	G	R	E	V	E	T	T	L	V	S	K	A	L	N	H	P	N	I	R	V	L	E	R	S	N	A	V	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	A	M	A	E	P	G	A	M	A	E	Q	L	N	A	R	I	L	T	H	T	R	V	T	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																								60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	V	S	D	K	I	G	L	P	G	T	R	R	V	V	G	A	W	V	W	N	R	N	K	E	T	V	E	T	C	H	A	K	A	V	V	L	A	T	G	G	A	S	K	V	Y	Q	Y	T	T	N	P	D	I	S	S	G	D	G	I	A	M	A	W	R	A	G	C	R	V	A	N	L	E	F	N	Q	F	H
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	P	G	H	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	W	I	G	E	E	E	V	R	Y	R	D	L	V	L	A	W	G	A	E	P	I	R	V	P	V	E	G	D	A	Q	D	A	L	Y	P	I	N	D	L	E	D	Y	A	R	F	R	Q	A	A	A	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T						S																B	S	T	T	T	T						S	S												T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.											.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.			.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		P	T	A	L	Y	H	P	Q	A	R	N	F	L	L	T	E	A	L	R	G	E	G	A	Y	L	K	R	P	D	G	T	R	F	M	P	D	F	D	E	R	G	E	L	A	P	R	D	I	V	A	R	A	I	D	H	E	M	K	R	L	G	A	D	C	M	F	L	D	I	S	H	K	P	.	.	A	D	F	I	R
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	V	L	L	L	G	A	G	L	I	G	C	E	F	A	N	D	L	S	S	G	G	Y	Q	L	D	V	V	A	P	C	E	Q	V	M	P	G	L	L	H	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S													T	T								S	S	S	S	S	S	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																								146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	H	F	P	M	I	Y	E	K	L	L	G	L	G	I	D	L	T	Q	E	P	V	P	I	V	P	A	A	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	G	G	V	M	V	D	D	H	G	R	T
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	A	K	A	V	Q	A	G	L	E	G	L	G	V	R	F	H	L	G	P	V	L	A	S	L	K	K	A	G	E	G	L	E	A	H	L	S	D	G	E	V	I	P	C	D	L	V	V	S	A	V	G	L	R	P	R	T	E	L	A	F	A	A	G	L	A	V	N	R	G	I	V	V	D	R	S	L	R	T
Template Known Secondary structure													T	T	T						S										T	T							T	T	S						S						S												T	T			B	S	S	S					T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	E	G	L	Y	A	I	G	E	V	S	Y	T	G	L	H	G	A	N	R	M	A	S	N	S	L	L	E	C	L	V	Y	G	W	S	A	A	E	D	I	T	R	R	M	P	Y	A	H
Query Conservation
Alig confidence														.																	.	.	.	.
Template Conservation														.																	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	A	N	I	Y	A	L	G	D	C	A	.	E	V	D	G	L	N	L	L	Y	V	M	P	L	M	A	C	.	.	.	.	A	R	A	L	A	Q	T	L	A	G	N	P	S	Q	V	A
Template Known Secondary structure		S	S	T	T					G	G	G		.			T	T	B				S								.	.	.	.									T	T
Template Predicted Secondary structure														.																	.	.	.	.
Template SS confidence
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.					.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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