Job Description P10902 Confidence 99.81% Date Thu Jan 5 11:32:21 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 278 % Identity 20% Template c2nvkX_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: X: PDB Molecule:thioredoxin reductase; PDBTitle: crystal structure of thioredoxin reductase from drosophila2 melanogaster Resolution 2.40 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.		.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	50	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	S	C	D	V	L	I	I	G	S	G	A	A	G	L	S	L	A	L	R	L	A	D	Q	H	.	Q	V	I	V	L	S	K	G	P	V	T	E	G	S	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	Q	G	G	I	A
Query Conservation																											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	Y	D	L	I	V	I	G	G	G	S	A	G	L	A	C	A	K	E	A	V	L	N	G	A	R	V	A	C	L	D	F	V	K	P	T	P	T	L	G	T	K	W	G	V	G	G	T	C	V	N	V	G	C	I	P	K	K	L	M	H	Q	A	S	L	L	G	E	A	V	H	E	A	A	A	Y	G	W	N
Template Known Secondary structure					S							S													T	T													T	T	T						S	S							S																					G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		55	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	F	D	E	T	D	S	I	D	S	H	V	E	D	T	L	I	A	G	A	G	I	C	D	R	H	A	V	E	F	V	A	S	N	A	R	S	C	V	Q	W	L	I	D	Q	G	V	L	F	D	T	H	I	Q	P	N	G	E	E	S	Y	H	L	T	R	E	G	G	H	S	H	R	R	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	D	K	I	K	P	D	W	H	K	L	V	Q	S	V	Q	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	K	S	V	N	W	V	T	R	V	D	L	R	D	K	K	V	E	Y	I	N	G	L	G	S	F	V	D	S	H	T	L	L	A	K	L	K	S	G	E	R	T	I	T	A	Q	T	F	V
Template Known Secondary structure				S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T													T	T							T	T	S							S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.													.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
																																																															129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	H	A	A	D	A	T	G	R	E	V	E	T	T	L	V	S	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	A	V	G	G	R	P	R	Y	P	D	I	P	G	A	V	E	Y	G	I	T	S	D	D	L	F	S	L	D	R	E	P	G	K	T	L	V	V	G	A	G	Y	I	G	L	E	C	A	G	F	L	K	G	L	G	Y	E	P	T	V	M	V	R	S	I	V	L	R	G	F	D	Q	Q	M	A	E	L	V	A	A
Template Known Secondary structure												S	S	T	T						B						T	T		S	S											S													T	T								S	S		S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	N	H	P	N	I	R	V	L	E	R	S	N	A	V	D	L	I	V	S	D	K	I	G	L	P	G	T	R	R	V	V	G	A	W	V	W	N	R	N	K	E	T	V	E	T	C	H	A	K	A	V	V	L	A	T	G	G	A	S	K	V	Y	Q	Y	T	T	N	P	D	I	S	S	G	D	G	I	A	M
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	M	E	E	R	G	I	P	F	L	R	K	T	V	P	L	S	V	E	K	Q	D	D	.	.	.	.	.	.	.	G	K	L	L	V	K	Y	K	N	V	E	T	G	E	E	S	E	D	V	Y	D	T	V	L	W	A	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T					T	T										T	T	.	.	.	.	.	.	.	S									S	S	S									S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.								.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	R	A	G	C	R	V	A	N	L	E	F	N	Q	F	H	P	T	A	L	Y	H	P	Q	A	R	N	F	L	L	T	E	A	L	R	G	E	G	A	Y	L	K	R	P	D	G	T	R	F	M	P	D	F	D	E	R	G	E	L	A	P	R	D	I	V	A	R	A	I	D	H	E	M	K	R	L	G	A	D
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.		.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		C	M	F	L	D	I	S	H	K	P	A	D	F	I	R	Q	H	F	P	M	I	Y	E	K	L	L	G	L	G	I	D	L	T	Q	E	P	.	V	P	I	V	P	A	A	H	Y	T	C	G	G	V	M	V	D	D	H	G	R	T	D	V	E	G	L	Y	A	I	G	E	V	S	Y	T	G	L	H	G	A	N	R
Query Conservation																																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.																																									.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	G	L	V	D	D	L	N	L	P	N	A	G	V	T	V	Q	K	D	K	I	P	V	D	S	Q	E	A	T	N	V	A	N	I	Y	A	V	G	D	I	I	Y	G	K	P	E	L	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	G	G	G		G	G	G	T	T				S	S	S	S	B				T	T	S	B		S	S	T	T					S	T	T	B	T	T	S				.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Template SS confidence
																															287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	S	N	S	L	L	E	C	L	V	Y	G	W	S	A	A	E	D	I	T	R	R	M	P	Y	A	H	D	I	S	T	L	P	P	W	D	E	S	R	V	E	N	P	D	E	R	V	V	I	Q	H	N	W	H	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	T	P	V	A	V	L	A	G	R	L	L	A	R	R	L	Y	G	G	S	T	Q	R	M	D	Y	K	D	V	A	T	T	V	F	T	P	L	E	Y	A	C	V	G	L	S	E	E	D	A	V	K	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																	S									S	S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.