Job Description P10902 Confidence 99.36% Date Thu Jan 5 11:32:21 GMT 2012 Rank 150 Aligned Residues 312 % Identity 16% Template c2cduB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:nadph oxidase; PDBTitle: the crystal structure of water-forming nad(p)h oxidase from2 lactobacillus sanfranciscensis Resolution 1.8 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30			.		.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.		.
Query SS confidence																						.	.		.
Query Sequence		V	L	I	I	G	S	G	A	A	G	L	S	L	A	L	R	L	A	D	Q	.	.	H	.	Q	V	I	V	L	S	K	G	P	V	T	E	G	S	T	F	Y	A	Q	G	G	I	A	A	V	F	D	E	T	D	S	I	D	S	H	V	E	D	T	L	I	A	G	A	G	I	C	D	R	H	A	V	E	F	V	A
Query Conservation																						.	.		.
Alig confidence																						.	.		.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	V	V	G	C	T	H	A	G	T	F	A	V	K	Q	T	I	A	D	H	P	D	A	D	V	T	A	Y	E	M	N	D	N	I	S	F	L	S	G	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S															T	T								S	S	S			S	B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	A	R	S	C	V	Q	W	L	I	D	Q	G	V	L	F	D	T	H	I	Q	P	N	G	E	E	S	Y	H	L	T	R	E	G	G	H	S	H	R	R	I	L	H	A	A	D	A	T	G	R	E	V	E	T	T	L	V	S	K	A	L	N	H	P	N	I	R	V	L	E	R	S	N	A	V	D	L	I	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Y	L	G	K	E	I	K	N	N	D	P	R	G	L	F	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	E	E	L	S	N	L	G	A	N	V	Q	M	R	H	Q	V	T	N	V	D	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T		S	G	G	G		G	G	G	G	B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T						S								G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	K	I	G	L	P	G	T	R	R	V	V	G	A	W	V	W	N	R	N	K	E	T	V	E	T	C	H	A	K	A	V	V	L	A	T	G	G	A	S	K	V	Y	Q	Y	T	T	N	P	D	I	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	K	V	K	D	L	I	T	N	E	E	K	T	E	A	Y	D	K	L	I	M	T	T	G	S	K	P	T	V	P	P	I	P	G	I	D	S	S	R	V	Y	L	C	K	N	Y	N	D	A	K	K	L	F	E	E	A	P	K	A	K	T	I	T	I	I	G
Template Known Secondary structure		G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T									S														S		T	T	T	T	S	T	T					S	S											G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.	.											90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
							222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	G	D	G	I	A	M	A	W	R	A	G	C	R	V	A	N	L	E	F	N	Q	F	H	P	T	A	L	Y	H	P	Q	A	R	N	F	L	L	T	E	A	L	R	G	E	G	A	Y	L	K	R	P	D	G	T	R	F	M	P	D	F	D	E	R	G	E	L	A	P	R	D	I	V	A	R	A
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	Y	I	G	A	E	L	A	E	A	Y	S	N	Q	N	Y	N	V	N	L	I	D	G	H	E	R	V	L	Y	K	Y	F	D	K	E	F	T	D	I	L	A	K	D	Y	E	A	H	G	V	N	L	V	L	G	S	K	V	A	A	F	E	E	V	D	D	E	I	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S												T	T	T								S	S	S	S	T	T	T	T	T	S															T	T						S	S									T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	H	E	M	K	R	L	G	A	D	C	M	F	L	D	I	S	H	K	P	A	D	F	I	R	Q	H	F	P	M	I	Y	E	K	L	L	G	L	G	I	D	L	T	Q	E	P	V	P	I	V	P	A	A	H	Y	T	C	G	G	V	M	V	D	D	H	G	R	T	D	V	E	G	L	Y	A	I	G	E	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Sequence		.	.	.	.	.	K	T	L	D	G	K	E	I	K	S	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	L	C	I	G	F	R	P	N	T	E	L	L	K	.	G	K	V	A	M	L	D	N	G	A	I	I	T	D	E	Y	M	H	S	S	N	R	D	I	F	A	A	G	D	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.			T	T	S						S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S							G	G	G	T	.	T	T	S		B		T	T			B				T	T	S	B		S	S	T	T					G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template SS confidence
							227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.		.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.		.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		S	Y	T	G	L	H	G	A	N	R	M	A	S	N	S	L	L	E	.	C	L	V	Y	G	W	S	A	A	E	D	I	T	R	R	M	P	Y	A	H	D	I	S	T	L	P	P	W	D	E	S	R	V	E	N	P	D	E	R	V	V	I	Q	H	N	W	H	E
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	V	H	Y	N	P	T	N	S	N	A	Y	I	P	L	A	T	N	A	V	R	Q	G	R	L	V	G	L	N	L	T	E	D	K	V	K	D	M	G	T	Q	S	S	S	G	L	K	L	Y	G	R	T	Y	V	S	T	G	I	N	T	A	L	A	K	A	N
Template Known Secondary structure		B					G	G	G	T																					T	S	S	S								B									T	T																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350