Job Description P17444 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:36:11 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 328 % Identity 23% Template d3coxa1 SCOP info FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain FAD-linked reductases, N-terminal domain Resolution 1.80

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	D	Y	I	I	I	G	A	G	S	A	G	N	V	L	A	T	R	L	T	E	D	P	N	T	S	V	L	L	L	E	A	G	G	P	D	Y	R	F	D	F	R	T	Q	M	P	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	P	L	Q	G	K	R	Y	N	W
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.
Template Sequence		R	V	P	A	L	V	I	G	S	G	Y	G	G	A	V	A	A	L	R	L	T	Q	.	A	G	I	P	T	Q	I	V	E	M	G	R	S	W	D	T	P	G	S	D	G	K	I	F	C	G	M	L	N	P	D	K	R	S	M	W	L	A	D	K	T	D	Q	P	V	S	N	F	M	G	F	G	I	N	K	S	I
Template Known Secondary structure											S													.	T	T								S	S			S		S			T	T	S		S	S			S	S	S			T	T	S	B	B	S		S	B				S	S		S	B	T	T	B	S				B
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Y	E	T	E	P	E	P	F	M	N	N	R	R	M	E	C	G	R	G	K	G	L	G	G	S	S	L	I	N	G	M	C	Y	I	R	G	N	A	L	D	L	D	N	W	A	Q	E	P	G	L	E	N	W	S	Y	L	D	C	L	P	Y	Y	R	K	A	E	T	R	D	M	G	E	N	D	Y	H	G	G	D
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.
Template Sequence		D	R	Y	V	G	V	L	D	S	E	R	F	S	G	I	K	V	Y	Q	G	R	G	V	G	G	G	S	L	V	N	G	G	M	A	V	T	P	K	R	N	Y	F	E	E	I	L	P	S	V	.	.	.	.	D	S	N	E	M	Y	N	K	Y	F	P	R	A	N	T	G	L	G	V	N	N	I	D	Q	A	W	F
Template Known Secondary structure					B		S							S	S								S	T	T	G	G	G	G	T	S			B														T	T	S	.	.	.	.								T										T		B
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.					.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180														.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	P	V	S	V	T	T	S	K	P	G	V	N	P	L	F	E	A	M	I	E	A	G	V	Q	A	G	Y	P	R	T	D	D	L	N	G	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	G	F	G	P	M	D	R	T	V	T	P	Q	G	R	R	A	S	T	A	R	G	Y	L	D	Q	A	K
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																										.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	S	T	E	W	Y	K	F	A	R	T	G	R	K	T	A	Q	R	S	G	F	T	T	A	F	V	P	N	V	Y	D	F	E	Y	M	K	K	E	A	A	G	Q	V	T	K	S	G	L	G	G	E	V	I	Y	G	N	N	.	A	G	K	K	S	L	D	K	T	Y	L	A	Q	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.				G	G	G													T	T								B	S	B										T	T	S	S			S	T	T	T	T		S	T	T			S	.	S	S	B			G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																										.
Template SS confidence
									166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.				.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.
Query Sequence		S	R	P	N	L	T	I	R	T	H	A	M	T	D	H	I	I	F	D	G	K	R	A	V	G	V	E	W	L	E	G	D	.	.	.	S	T	I	P	T	R	A	T	A	N	K	E	V	L	L	C	A	G	A	I	A	S	P	Q	I	L	Q	R	S	G	V	G	N	A	E	L	L	A	E	F	D	I	P	L	V
Query Conservation																																		.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	G	K	L	T	I	T	T	L	H	R	V	T	K	V	A	P	A	T	G	S	G	Y	S	V	T	M	E	Q	I	D	E	Q	G	N	V	V	A	T	K	V	V	T	A	D	R	V	F	F	A	A	G	S	V	G	T	S	K	L	L	V	S	M	K	A	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	P
Template Known Secondary structure			T	T							S										S	S	S	S										T	T	S																	S															T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.										.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	E	L	P	G	V	G	E	N	L	Q	D	H	L	E	M	Y	L	Q	Y	E	C	K	E	P	V	S	L	Y	P	A	L	Q	W	W	N	Q	P	K	I	G	A	E	W	L	F	G	G	T	G	V	G	A	S	N	H	F	E	A	G	G	F	I	R	S	R	E	E	F	A	W	P	N	I	Q	Y	H	F	L	P
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	S	S	Q	V	G	E	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S		T	T	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	I	N	Y	N	G	S	N	A	V	K	E	H	G	F	Q	C	H	V	G	S	M	R	S	P	S	R	G	H	V	R	I	K	S	R	D	P	H	Q	H	P	A	I	L	F	N	Y	M	S	H	E	Q	D	W	Q	E	F	R	D	A	I	R	I	T	R	E	I	M	H	Q	P	A	L	D	Q	Y	R	G	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	S	P	G	V	E	C	Q	T	D	E	Q	L	D	E	F	V	R	N	H	A	E	T	A	F	H	P	C	G	T	C	K	M	G	Y	D	E	M	S	V	V	D	G	E	G	R	V	H	G	L	E	G	L	R	V	V	D	A	S	I	M	P	Q	I	I	T	G	N	L	N	A	T	T	I	M	I	G	E	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	L	L	N	K	.	.	.	.	A	T	D	N	F	G	R	L	P	E	Y	P	G	L	Y	V	V	D	G	S	L	V	P	G	N	V	G	V	N	P	F	V	T	I	T	A	L	A	E	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T	.	.	.	.	T	S		T	T	S	B		T	T	S	T	T					S	G	G	G	S		S			S	S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Template SS confidence
																																451	.	.	.	.	.					.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		527	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	D	M	I	R	G	Q	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	M	D	K	I	I	S	S	D
Template Known Secondary structure										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		497	.	.	500	.	.	.	.	.