Job Description P76503 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:23:40 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 297 % Identity 21% Template c3o04A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:beta-keto-acyl carrier protein synthase ii; PDBTitle: crystal structure of the beta-keto-acyl carrier protein synthase ii2 (lmo2201) from listeria monocytogenes Resolution 1.85 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.		20	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.																.	40	.	.	.
Predicted Secondary structure												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Q	G	D	R	I	A	I	V	S	.	G	L	R	T	P	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	A	T	A	F	H	G	I	P	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	G	K	M
Query Conservation												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	D	K	R	R	V	V	V	T	G	I	G	A	V	T	P	I	G	N	D	A	E	T	S	W	E	N	A	K	K	G	V	N	G	V	A	K	X	T	R	L	N	P	D	D	F	P	V	K	I	A	A	E	L	K	D	F	D	V	E	K	Y	L	E	K	K	E	A	R	K	X	D	R	F	T	H	Y	A	I	A
Template Known Secondary structure																B	T	T	B	S	S										T	T									S	S		G	G	G	S	S								S	S			G	G	G	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60					.	.	.	.	.	.	.	.	.	70																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	G	E	L	L	A	R	S	E	I	P	A	E	V	I	E	.	.	.	.	Q	L	V	F	G	Q	V	V	Q	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	A	P	N	I	A	R	E	I	V	L	G	T	G	M	N	V	H	T	D	A	Y
Query Conservation																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		S	A	E	X	A	V	Q	D	S	G	L	V	I	D	D	S	N	A	N	R	V	G	V	W	I	G	S	G	I	G	G	X	E	T	F	E	T	Q	Y	E	I	F	L	N	R	G	H	R	R	V	S	P	F	F	V	P	X	X	I	P	D	X	G	S	G	Q	V	S	I	R	F	G	A	.	.	K	G	I	N	S
Template Known Secondary structure											T					T	T	T	G	G	G								S	S																		T	T	T	S		T	T						S	T	T											T		.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.			.	.	.	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	S	R	A	C	A	T	S	F	Q	A	V	A	N	V	A	E	S	L	M	A	G	T	I	R	A	G	I	A	G	G	A	D	S	S	S	V	L	P	I	G	V	S	K	K	L	A	R	V	L	V	D	V	N	K	A	R	T	M	S	Q	R	L	K	L	F	S	R	L	R	L	R	D	L	M	P	V	P	P
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	V	T	A	C	A	T	A	T	N	S	I	G	D	A	F	K	V	I	E	R	G	D	A	D	A	X	I	T	G	G	A	E	A	P	I	T	K	X	S	L	A	G	F	T	A	N	K	A	L	S	L	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G															T	T	S		S												S										T	T		B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	A	E	Y	S	T	G	L	R	M	G	D	T	A	E	Q	M	A	K	T	Y	G	I	T	R	E	Q	Q	D	A	L	A	H	R	S	H	Q	R	A	A	Q	A	W	S	D	G	K	L	K	E	E	V	M	T	A	F	I	P	P	Y	K	Q	P	L	V	E	D	N	N	I	R	G	N	S	S	L	A	D	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																															214	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.					.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.
Query Sequence		A	K	L	R	P	A	F	D	R	K	H	G	T	V	T	A	A	N	S	T	P	L	T	D	G	A	A	A	V	I	L	M	T	E	S	R	A	K	E	L	G	L	V	P	L	G	Y	L	R	S	Y	A	F	T	A	I	D	V	.	.	.	.	W	Q	D	M	L	L	G	P	A	W	S	T	P	L	A	L	E	R
Query Conservation																																																												.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	C	R	P	F	D	K	D	R	D	G	F	I	.	.	.	.	.	.	.	I	G	E	G	A	G	I	V	I	L	E	E	Y	E	H	A	K	A	R	G	A	K	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	G	D	A	Y	H	I	T	A	P	A	P	N	G	E	G	A	A	R	A	X	K	X	A	I	D	D
Template Known Secondary structure		T	S			T	T	B	T	T			S	B		.	.	.	.	.	.	.	B	B																		T																	S		S	S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230								.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.					350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.																															.											.
Query SS confidence																						.	.	.	.																															.											.
Query Sequence		A	G	L	T	M	S	D	L	T	L	I	D	M	H	E	A	F	A	A	Q	.	.	.	.	T	L	A	N	I	Q	L	L	G	S	E	R	F	A	R	E	A	L	G	R	A	H	A	T	G	E	V	D	D	S	.	K	F	N	V	L	G	G	S	I	A	.	Y	G	H	P	F	A	A	T	G	A	R	M	I	T
Query Conservation																						.	.	.	.																															.											.
Alig confidence																						.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.											.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	L	T	P	D	K	V	D	Y	I	N	A	H	G	T	S	T	P	Y	N	D	E	Y	E	T	Q	A	I	K	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	E	H	A	K	K	L	A	I	S	S	T	K	S	X	T	G	H	T	L	G	A	S	G	G	I	E	A	I
Template Known Secondary structure			T			G	G	G																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	T	T	T	S					T						B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		404	.	.	.	.	.	410																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	T	L	H	E	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	G	G	G	F	G	L	V	T	A	C	A	A	G	G	L	G	A	A	M	V	L	E	A
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	L	L	T	I	R	D	N	I	I	A	P	T	I	H	L	K	N	Q	D	E	V	C	D	L	D	Y	V	P	N	E	A	R	E	A	N	V	N	V	V	I	S	N	S	F	G	F	G	G	H	N	A	T	L	V	F	K	R
Template Known Secondary structure										T					B	T	T			S	B		S	S			S				B	S	S																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410