Job Description P76503 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:23:40 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 301 % Identity 26% Template c3e60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein ] synthase ii; PDBTitle: crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl carrier protein)2 synthase ii from bartonella henselae Resolution 1.95 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.																																																					.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	R	I	A	I	V	S	.	G	L	R	T	P	F	A	R	Q	A	T	A	F	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	A	V
Query Conservation										.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	R	R	V	V	I	T	G	L	G	L	V	S	P	L	A	G	D	V	E	Y	S	W	K	R	L	L	E	G	K	S	G	V	R	R	I	T	E	F	D	V	S	D	L	S	C	Q	I	A	A	R	I	P	V	G	D	G	T	N	G	T	Y	N	A	D	L	H	M	E	S	K	E	Q	R	K	V	D	A	F	I
Template Known Secondary structure															S	S		S	S										T	T									S	S			T	T	S	S									B	S	S	S		T	T		B		G	G	G	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60						.	.	.	.	.	.	.																											.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	G	K	M	V	V	G	E	L	L	A	R	S	E	I	P	A	E	V	I	E	.	.	.	.	.	Q	L	V	F	G	Q	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	M	P	E	A	P	N	I	A	R	E	I	V	L	G	T	G	M	N
Query Conservation																								.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		V	Y	A	I	A	A	A	D	Q	A	L	A	D	A	E	W	F	P	K	S	D	E	D	Q	I	C	T	G	V	L	I	G	S	G	I	G	G	I	E	G	I	V	E	A	G	Y	T	L	R	D	K	G	P	R	R	I	S	P	F	F	I	P	G	R	L	I	N	L	A	S	G	Y	V	S	I	K	Y	G	L	.
Template Known Secondary structure																T					S						T								S	S		S																G	G	G	S		T	T	T	T	T	T	T		T	T											T		.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	H	T	D	A	Y	S	V	S	R	A	C	A	T	S	F	Q	A	V	A	N	V	A	E	S	L	M	A	G	T	I	R	A	G	I	A	G	G	A	D	S	S	S	V	L	P	I	G	V	S	K	K	L	A	R	V	L	V	D	V	N	K	A	R	T	M	S	Q	R	L	K	L	F	S	R	L	R	L	R	D
Query Conservation
Alig confidence		.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	R	G	P	N	H	S	V	V	T	A	C	S	T	G	A	H	A	I	G	D	A	A	R	L	I	A	L	G	D	A	D	V	M	L	A	G	G	T	E	S	P	I	N	R	I	S	L	A	G	F	S	A	C	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.		S								G	G	G															T	T	S		S												S										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	M	P	V	P	P	A	V	A	E	Y	S	T	G	L	R	M	G	D	T	A	E	Q	M	A	K	T	Y	G	I	T	R	E	Q	Q	D	A	L	A	H	R	S	H	Q	R	A	A	Q	A	W	S	D	G	K	L	K	E	E	V	M	T	A	F	I	P	P	Y	K	Q	P	L	V	E	D	N	N	I	R	G	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	S	T	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																													214	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.					.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.
Query Sequence		S	S	L	A	D	Y	A	K	L	R	P	A	F	D	R	K	H	G	T	V	T	A	A	N	S	T	P	L	T	D	G	A	A	A	V	I	L	M	T	E	S	R	A	K	E	L	G	L	V	P	L	G	Y	L	R	S	Y	A	F	T	A	I	D	V	W	.	.	.	.	Q	D	M	L	L	G	P	A	W	S	T
Query Conservation																																																																			.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	N	D	D	P	E	R	A	S	R	P	Y	D	V	D	R	D	G	F	V	.	.	.	.	.	.	.	M	G	E	G	A	A	I	V	V	L	E	E	L	E	H	A	K	K	R	G	A	R	I	Y	A	E	I	I	G	Y	G	L	S	G	D	A	Y	H	I	T	A	P	S	E	S	G	E	G	A	Q	R	S	M
Template Known Secondary structure			T	T	S	G	G	G	S			T	T	B	T	T			S	B		.	.	.	.	.	.	.	B	B																	T	T																	S		S	S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.								.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.
Query SS confidence																																																																				.
Query Sequence		P	L	A	L	E	R	A	G	L	T	M	S	D	L	T	L	I	D	M	H	E	A	F	A	A	Q	T	L	A	N	I	Q	L	L	G	S	E	R	F	A	R	E	A	L	G	R	A	H	A	T	G	E	V	D	D	S	K	F	N	V	L	G	G	S	I	A	.	Y	G	H	P	F	A	A	T	G	A	R	M	I
Query Conservation																																																																				.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	A	L	K	R	A	Q	V	N	V	S	E	L	D	Y	I	N	A	H	G	T	S	T	M	A	D	V	I	E	L	A	A	V	E	R	V	L	G	Y	Y	A	P	Q	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	M	S	S	T	K	S	S	I	G	H	L	L	G	A	A	G	A	A	E	A
Template Known Secondary structure									T			G	G	G										S	S	T	T													G	G	G	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T						B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.															.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	T	L	H	E	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	G	G	G	F	G	L	V	T	A	C	A	A	G	G	L	G	A	A	M	V	L	E	A
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	F	C	V	L	A	I	R	D	N	I	A	P	A	T	L	N	L	E	N	P	S	I	E	T	K	I	D	L	V	P	H	K	P	R	E	R	K	I	D	T	V	L	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	S	L	V	M	R	R
Template Known Secondary structure											T					B	T	T		S	S	B	S	S			S	S	B			B	S	S																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.