Job Description P76503 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:23:40 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 305 % Identity 23% Template c2qo3A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:eryaii erythromycin polyketide synthase modules 3 and 4; PDBTitle: crystal structure of [ks3][at3] didomain from module 3 of 6-2 deoxyerthronolide b synthase Resolution 2.59 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.										40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60					.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Query Sequence		P	L	V	T	R	Q	G	D	R	I	A	I	V	S	G	L	R	T	P	F	A	R	Q	A	T	A	F	H	G	I	P	A	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	K	M	V	V	G	E	L	L	A	R	S	E	I	P	A	E	V	I	E	.	.	.	.	Q	L	V	F	G	Q	V	V	Q	M	P	E
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	P	D	N	P	G	T	S	Y	V	D	K	G	G	F	L	D	D	A	A	G	F	D	A	E	F	F	G	V	S	P	R	E	A	A	A	M	D	P	Q	Q	R	L	L	L	E	T	S	W	E	L	V	E	N	A	G	I	D	P	H	S	L	R	G	T	A	T	G	V	F	L	G	V	A	K	F	G	Y	G
Template Known Secondary structure		S		T	T	S	T	T		B	S					B			S		S	S								T								T	S																		T	T			G	G	G	G	T	T	B													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																	73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	N	I	A	R	E	I	V	L	G	T	G	M	N	V	H	T	D	A	Y	S	V	S	R	A	C	A	T	S	F	Q	A	V	A	N	V	A	E	S	L	M	A	G	T	I	R	A	G	I	A	G	G	A	D	S	S	S	V	L	P	I	G	V	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		E	D	T	A	D	V	E	G	Y	S	V	T	G	V	A	P	A	V	A	S	G	R	I	S	Y	T	M	G	L	.	.	E	G	P	S	I	S	V	D	T	A	C	S	S	S	L	V	A	L	H	L	A	V	E	S	L	R	K	G	E	S	S	M	A	V	V	G	G	A	A	V	M	A	T	P	G	V	F	V	D
Template Known Secondary structure		T	T				T	T						T	T														T	B	.	.		S								G	G	G															T	T	S		S	S										S	S	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	L	A	R	V	L	V	D	V	N	K	A	R	T	M	S	Q	R	L	K	L	F	S	R	L	R	L	R	D	L	M	P	V	P	P	A	V	A	E	Y	S	T	G	L	R	M	G	D	T	A	E	Q	M	A	K	T	Y	G	I	T	R	E	Q	Q	D	A	L	A	H	R	S	H	Q	R	A	A	Q	A	W
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	R	Q	R	A	L	A	A	D	G	R	S	K	A	F	G	A	G	A	D	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	T		B		S	S					T	T	B	T	T				B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	G	K	L	K	E	E	V	M	T	A	F	I	P	P	Y	K	Q	P	L	V	E	D	N	N	I	R	G	N	S	S	L	A	D	Y	A	K	L	R	P	A	F	D	R	K	H	G	T	V	T	A	A	N	S	T	P	L	T	D	G	A	A	A	V	I	L	M	T	E	S	R	A	K	E	L	G	L	V	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	S	E	G	V	T	L	V	L	L	E	R	L	S	E	A	R	R	N	G	H	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B	B																	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																										264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.					.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.
Query Sequence		L	G	Y	L	R	S	Y	A	F	T	A	I	D	V	.	.	.	.	W	Q	D	M	L	L	G	P	A	W	S	T	P	L	A	L	E	R	A	G	L	T	M	S	D	L	T	L	I	D	M	H	E	A	F	A	A	Q	T	L	A	N	I	Q	L	L	G	S	E	R	F	A	R	E	A	L	G	R	A	H	A	T
Query Conservation																.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		L	A	V	V	R	G	S	A	L	N	Q	D	G	A	S	N	G	L	S	A	P	S	G	P	A	Q	R	R	V	I	R	Q	A	L	E	S	C	G	L	E	P	G	D	V	D	A	V	E	A	H	G	.	.	T	G	T	A	L	G	D	P	I	E	A	N	A	L	L	D	T	Y	G	R	D	R	D	A	D	R	P
Template Known Secondary structure															S		S	S	T	T																		T	T			G	G	G									.	.				T	T	T												T	S	S	S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.			.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	V	D	D	S	K	F	N	V	L	G	G	S	I	A	Y	G	H	P	F	A	A	T	G	A	R	M	I	T	Q	T	L	H	E	L	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	G	G	F	G	L
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	W	L	G	S	V	K	S	N	I	.	.	.	.	.	.	.	G	H	T	Q	A	A	A	G	V	T	G	L	L	K	V	V	L	A	L	R	N	G	E	L	P	A	T	L	H	V	E	E	P	T	P	H	V	D	W	S	S	G	G	V	A	L	L	A	G	N	Q	P	W	R	R	G	E	R	T	R	R	A	A
Template Known Secondary structure							T					.	.	.	.	.	.	.		B		G	G	G																T						S	S		S	S	B		T	T	S			S	S	S	S					S	S						S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.								.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	A	C	A	A	G	G	L	G	A	A	M	V	L	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	S	A	F	G	I	S	G	T	N	A	H	V	I	V	E
Template Known Secondary structure							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.