Job Description P76503 Confidence 99.98% Date Thu Jan 5 12:23:40 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 299 % Identity 23% Template c2ix4B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase; PDBTitle: arabidopsis thaliana mitochondrial beta-ketoacyl acp2 synthase hexanoic acid complex Resolution 1.95 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		13	.	.	.	.	.	.		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	I	A	I	V	S	.	G	L	R	T	P	F	A	R	Q	A	T	A	F	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	V	V	V	T	G	L	G	M	V	T	P	L	G	R	G	V	E	T	T	W	R	R	L	I	D	G	E	C	G	I	R	G	L	T	L	D	D	L	K	M	K	S	F	D	E	E	T	K	L	Y	T	F	D	Q	L	S	S	K	V	A	A	F	V	P	Y	G	S	N	P	G	E	F	D	E	A	L	W	L
Template Known Secondary structure														T	T			S										T	T									S	G	G	G			T	T	S													S									B	S	S	S	T	T	S	B						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
							35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60					.	.	.	.	.	.	.	.	.	70																											.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																							.					.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																							.					.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	I	P	A	V	D	L	G	K	M	V	V	G	E	L	L	A	R	S	E	I	P	A	.	E	V	I	E	.	.	.	.	Q	L	V	F	G	Q	V	V	Q	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	A	P	N	I	A	R
Query Conservation		.	.	.	.	.																							.					.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																							.					.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	S	K	A	V	A	N	F	I	G	Y	A	V	C	A	A	D	E	A	L	R	D	A	E	W	L	P	T	E	E	E	E	K	E	R	T	G	V	S	I	G	G	G	I	G	S	I	C	D	I	V	E	A	A	Q	L	I	C	E	K	R	L	R	R	L	S	P	F	F	I	P	K	I	L	V	N	M	A	S	G
Template Known Secondary structure			S	T	T																			T	T					S						T								S	S															T	T		G	G	G			T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	V	L	G	T	G	M	N	V	H	T	D	A	Y	S	V	S	R	A	C	A	T	S	F	Q	A	V	A	N	V	A	E	S	L	M	A	G	T	I	R	A	G	I	A	G	G	A	D	S	S	S	V	L	P	I	G	V	S	K	K	L	A	R	V	L	V	D	V	N	K	A	R	T	M	S	Q	R	L	K
Query Conservation
Alig confidence										.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	V	S	M	K	Y	G	F	.	.	Q	G	P	N	H	A	A	V	T	A	C	A	T	G	A	H	S	I	G	D	A	T	R	M	I	Q	F	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	T	E	S	S	I	D	A	L	S	V	A	G	F	S	R	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T		.	.		S								G	G	G																T	S		S												S										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		191	.	.	.	.	.	.	.			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	S	R	L	R	L	R	D	L	M	P	V	P	P	A	V	A	E	Y	S	T	G	L	R	M	G	D	T	A	E	Q	M	A	K	T	Y	G	I	T	R	E	Q	Q	D	A	L	A	H	R	S	H	Q	R	A	A	Q	A	W	S	D	G	K	L	K	E	E	V	M	T	A	F	I	P	P	Y	K	Q	P	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.					.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.
Query Sequence		V	E	D	N	N	I	R	G	N	S	S	L	A	D	Y	A	K	L	R	P	A	F	D	R	K	H	G	T	V	T	A	A	N	S	T	P	L	T	D	G	A	A	A	V	I	L	M	T	E	S	R	A	K	E	L	G	L	V	P	L	G	Y	L	R	S	Y	A	F	T	A	I	D	V	.	.	.	.	W	Q	D
Query Conservation																																																																											.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	A	L	S	T	K	F	N	S	S	P	Q	E	A	S	R	P	F	D	C	D	R	D	G	F	V	.	.	.	.	.	.	.	I	G	E	G	S	G	V	I	V	L	E	E	Y	E	H	A	K	R	R	G	A	K	I	Y	A	E	L	C	G	Y	G	M	S	G	D	A	H	H	I	T	Q	P	P	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		B			T	T	T	T	S	G	G	G	S			T	T	B	T	T			S	B		.	.	.	.	.	.	.	B	B																	T	T																	S		S	S				T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.								.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.					.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.																																											.
Query SS confidence																																			.	.	.	.																																											.
Query Sequence		M	L	L	G	P	A	W	S	T	P	L	A	L	E	R	A	G	L	T	M	S	D	L	T	L	I	D	M	H	E	A	F	A	.	.	.	.	A	Q	T	L	A	N	I	Q	L	L	G	S	E	R	F	A	R	E	A	L	G	R	A	H	A	T	G	E	V	D	D	S	K	F	N	V	L	G	G	S	I	A	.
Query Conservation																																			.	.	.	.																																											.
Alig confidence																																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	K	G	A	V	L	A	M	T	R	A	L	R	Q	S	G	L	C	P	N	Q	I	D	Y	V	N	A	H	A	T	S	T	P	I	G	D	A	V	E	A	R	A	I	K	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	E	H	A	T	S	G	T	L	A	F	S	S	T	K	G	A
Template Known Secondary structure		T																T			G	G	G										S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	S		S					T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.																.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	H	P	F	A	A	T	G	A	R	M	I	T	Q	T	L	H	E	L	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	G	G	F	G	L	V	T	A	C	A	A	G	G	L	G	A	A	M	V	L	E	A
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	I	F	S	I	L	A	I	H	H	G	V	A	P	M	T	L	N	V	K	N	P	D	P	I	F	D	K	R	F	M	P	L	T	T	S	K	K	M	L	V	R	T	A	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	S	L	L	F	A	S
Template Known Secondary structure				B		G	G	G																T						S			S	S	B		T	T		B	T	T	B					S							S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460