Job Description P76503 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:23:40 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 303 % Identity 23% Template c2gp6B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2; PDBTitle: x-ray crystal structure of mycobacterium tuberculosis beta-2 ketoacyl acyl carrier protein synthase ii (mtkasb) Resolution 2.40 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.																																															.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	V	T	R	Q	G	D	R	I	A	I	V	S	.	G	L	R	T	P	F	A	R	Q	A	T	A	F	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	A	V
Query Conservation																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	V	T	G	K	A	F	P	Y	V	V	V	T	G	I	A	M	T	T	A	L	A	T	D	A	E	T	T	W	K	L	L	L	D	R	Q	S	G	I	R	T	L	D	D	P	F	V	E	E	F	D	L	P	V	R	I	G	G	H	L	L	E	E	F	D	H	Q	L	T	R	I	E	L	R	R	M	G	Y	L	Q
Template Known Secondary structure				T	T	T	T	S													S	S		S	S										T	T										T	T	T	T	T	T	T		S					B			S			S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60			.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	G	K	M	V	V	G	E	L	L	A	R	S	E	I	P	A	E	V	I	E	.	.	Q	L	V	F	G	Q	V	V	Q	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	P	N	I	A	R	E	I	V	L	G	T	G	M	N	V	H	T
Query Conservation																								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																																																																														.	.
Template Sequence		R	M	S	T	V	L	S	R	R	L	W	E	N	A	G	S	P	E	V	D	T	N	R	L	M	V	S	I	G	T	G	L	G	S	A	E	E	L	V	F	S	Y	D	D	M	R	A	R	G	M	K	A	V	S	P	L	T	V	Q	K	Y	M	P	N	G	A	A	A	A	V	G	L	E	R	H	A	.	.	K	A
Template Known Secondary structure															T	T						T	T	S							B	S	S		S	S								T	T	T	T	T	T		S	S	S	S		T	T						S	T	T										S			.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.			160	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	Y	S	V	S	R	A	C	A	T	S	F	Q	A	V	A	N	V	A	E	S	L	M	A	G	T	I	R	A	G	I	A	G	G	A	D	S	S	S	V	L	P	I	G	V	S	K	K	L	A	R	V	L	V	D	V	N	K	A	R	T	M	S	Q	R	L	K	L	F	S	R	L	R	L	R	D	L	M	P
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	M	T	P	V	S	A	C	A	S	G	A	E	A	I	A	R	A	W	Q	Q	I	V	L	G	E	A	D	A	A	I	C	G	G	V	E	T	R	I	E	A	V	P	I	A	G	F	A	Q	M	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							B		G	G	G																T	S		S																					T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	P	A	V	A	E	Y	S	T	G	L	R	M	G	D	T	A	E	Q	M	A	K	T	Y	G	I	T	R	E	Q	Q	D	A	L	A	H	R	S	H	Q	R	A	A	Q	A	W	S	D	G	K	L	K	E	E	V	M	T	A	F	I	P	P	Y	K	Q	P	L	V	E	D	N	N	I	R	G	N	S	S	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	M	S	T	N	N	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																										214	.	.	.	.	.	220	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.					.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.
Query Sequence		A	D	Y	A	K	L	R	P	A	F	D	R	K	H	G	T	V	T	A	A	N	S	T	P	L	T	D	G	A	A	A	V	I	L	M	T	E	S	R	A	K	E	L	G	L	V	P	L	G	Y	L	R	S	Y	A	F	T	A	I	D	V	W	.	.	.	.	Q	D	M	L	L	G	P	A	W	S	T	P	L	A
Query Conservation																																																																.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	A	G	A	C	R	P	F	D	R	D	R	D	G	F	V	.	.	.	.	.	.	.	F	G	E	G	G	A	L	L	L	I	E	T	E	E	H	A	K	A	R	G	A	N	I	L	A	R	I	M	G	A	S	I	T	S	D	G	F	H	M	V	A	P	D	P	N	G	E	R	A	G	H	A	I	T	R	A
Template Known Secondary structure		S	S	S	S	S			T	T	B	T	T						.	.	.	.	.	.	.	B	B																	T	T																	S		S	S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.								.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.					.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.
Query Sequence		L	E	R	A	G	L	T	M	S	D	L	T	L	I	D	M	H	E	A	F	A	.	.	.	.	A	Q	T	L	A	N	I	Q	L	L	G	S	E	R	F	A	R	E	A	L	G	R	A	H	A	T	G	E	V	D	D	S	K	F	N	V	L	G	G	S	I	A	Y	G	H	P	F	A	A	T	G	A	R	M	I
Query Conservation																							.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Q	L	A	G	L	A	P	G	D	I	D	H	V	N	A	H	A	T	G	T	Q	V	G	D	L	A	E	G	R	A	I	N	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	G	N	R	P	A	V	Y	A	P	K	S	A	L	G	H	S	V	G	A	V	G	A	V	E	S
Template Known Secondary structure					T	T			G	G	G										S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S								G	G	G	T	S		B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	T	L	H	E	L	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	G	G	F	G	L	V	T	A	C	A	A	G	G	L	G	A	A	M	V	L	E	A
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	T	V	L	A	L	R	D	Q	V	I	P	P	T	L	N	L	V	N	L	D	P	E	I	D	L	D	V	V	A	G	E	P	R	P	G	N	Y	R	Y	A	I	N	N	S	F	G	F	G	G	H	N	V	A	I	A	F	G	R
Template Known Secondary structure											T						T	T		S	S	B		T	T								S	S																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.