Job Description P76503 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 12:23:40 GMT 2012 Rank 38 Aligned Residues 268 % Identity 22% Template c1tqyD_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:actinorhodin polyketide putative beta-ketoacyl synthase 2; PDBTitle: the actinorhodin ketosynthase/chain length factor Resolution 2.00 Å

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		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60					.	.	.	.	.	.	.	.	.																											70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	D	L	G	K	M	V	V	G	E	L	L	A	R	S	E	I	P	A	E	V	I	E	.	.	.	.	Q	L	V	F	G	Q	V	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	E	A	P	N	I	A	R	E	I	V	L	G	T	G	M
Query Conservation																										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	T	R	L	A	L	T	A	A	D	W	A	L	Q	D	A	K	A	D	P	E	S	L	T	D	Y	D	M	G	V	V	T	A	N	A	C	G	G	F	D	F	T	H	R	E	F	R	K	L	W	S	E	G	P	K	S	V	S	V	Y	E	S	F	A	W	F	Y	A	V	N	T	G	Q	I	S	I	R	H	G	M
Template Known Secondary structure																	T	T			G	G	G	S		G	G	G								S	S		S														T		G	G	G	S		T	T					S	S	T	T											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	V	H	T	D	A	Y	S	V	S	R	A	C	A	T	S	F	Q	A	V	A	N	V	A	E	S	L	M	A	G	T	I	R	A	G	I	A	G	G	A	D	S	S	S	V	L	P	I	G	V	S	K	K	L	A	R	V	L	V	D	V	N	K	A	R	T	M	S	Q	R	L	K	L	F	S	R	L	R	L	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.																													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	R	G	P	S	S	A	L	V	A	E	Q	A	G	G	L	D	A	L	G	H	A	R	R	T	I	R	R	G	.	T	P	L	V	V	S	G	G	V	D	S	A	L	D	P	W	G	W	V	S	Q	I	A	S	G	R	I	S	T	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.		S	S							G	G	G															T	T	.		S												S									T	T	S		B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	M	P	V	P	P	A	V	A	E	Y	S	T	G	L	R	M	G	D	T	A	E	Q	M	A	K	T	Y	G	I	T	R	E	Q	Q	D	A	L	A	H	R	S	H	Q	R	A	A	Q	A	W	S	D	G	K	L	K	E	E	V	M	T	A	F	I	P	P	Y	K	Q	P	L	V	E	D	N	N	I	R	G
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.																.
Query SS confidence																																																			.																.
Query Sequence		N	S	S	L	A	D	Y	A	K	L	R	P	A	F	D	R	K	H	G	T	V	T	A	A	N	S	T	P	L	T	D	G	A	A	A	V	I	L	M	T	E	S	R	A	K	E	L	G	L	.	V	P	L	G	Y	L	R	S	Y	A	F	T	A	I	D	.	V	W	Q	D	M	L	L	G	P	A	W	S	T	P
Query Conservation																																																			.																.
Alig confidence		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.																						.																.
Template Conservation		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	P	D	R	A	Y	L	P	F	D	E	R	A	A	G	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	P	G	E	G	G	A	I	L	V	L	E	D	S	A	A	A	E	A	R	G	R	H	D	A	Y	G	E	L	A	G	C	A	S	T	F	D	P	A	P	G	S	G	R	P	A	G	L	E	R	A	I	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		G	G	G	S			T	T	S	T	T				B		.	.	.	.	.	.	.	B	B																	T	T					S														T	T						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.								.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.					.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.																																										.
Query SS confidence																										.	.	.	.																																										.
Query Sequence		L	A	L	E	R	A	G	L	T	M	S	D	L	T	L	I	D	M	H	E	A	F	A	A	.	.	.	.	Q	T	L	A	N	I	Q	L	L	G	S	E	R	F	A	R	E	A	L	G	R	A	H	A	T	G	E	V	D	D	S	K	F	N	V	L	G	G	S	I	A	.	Y	G	H	P	F	A	A	T	G	A
Query Conservation																										.	.	.	.																																										.
Alig confidence																										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.								.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Sequence		L	A	L	N	D	A	G	T	G	P	E	D	V	D	V	V	F	A	D	G	A	G	V	P	E	L	D	A	A	E	A	R	A	I	G	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	R	E	G	V	.	P	V	T	V	P	K	T	T	T	G	R	L	Y	S	G	G	G	P
Template Known Secondary structure								T			G	G	G										S	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T		S	.					G	G	G	G	T		B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	320	.		.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	M	I	T	Q	T	L	H	E	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	G	G	G	F	G	L	V	T	A	C	A	A	G	G	L	G	A	A	M	V	L	E	A
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	V	V	T	A	L	M	S	L	R	E	G	V	I	A	P	T	A	G	V	T	S	V	P	R	E	Y	G	I	D	L	V	L	G	E	P	R	S	T	A	P	R	T	A	L	V	L	A	R	G	R	W	G	F	N	S	A	A	V	L	R	R
Template Known Secondary structure														T	S	B			B		S						G	G	G						B	S	S		B														T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.