Job Description P0A6U8 Confidence 98.60% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 54 Aligned Residues 396 % Identity 7% Template d2pq6a1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDPGT-like Resolution 2.10

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	L	H	V	C	S	E	M	F	P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	T	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y	L
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	V	V	M	I	P	Y	.	.	.	.	.	.	P	V	Q	G	H	I	N	P	L	F	K	L	A	K	L	L	H	L	R	G	F	H	I	T	F	V	N	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	H	K	R	L	L	D	F	N	F	E	S
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	S	S																	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.							.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		I	D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	N	V	L	R	F	A	L	L	G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	R	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	P	A	K	S	V	F	T	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	L	T	Q	D	V	P	T	L	C	Q	S	V	R	K	N	F	L	K	P	Y	C	E	L	L	T	R	L	N	H	S	T	N	V	P	P	V	T	C	L	V	S	D	C	C	M	S	F	T	I	Q	A	A	E	E	F	E	L	P	N	V	L	Y	F	S	S	S	A
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T	S	S													T		S	S	S										T	T		T									T	T									S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		71	.										.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
																																160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	N	L	A	Y	Q	G	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	F	N	G	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	S	L	L	N	V	M	H	F	R	S	F	V	E	R	G	I	I	P	F	K	D	E	S	Y	L	T	N	G	C	L	E	T	K	V	D	W	I	P	G	L	K	N	F	R	L	K	D	I	V	D	F	I	R	T	T	N	P	N	D	I	M	L	E	F	F	I	E	V	A	D	R	V	N	K	D	T	T	I	L
Template Known Secondary structure								T	T							T	T		S	S		S	S	G	G	G	G	T	S	S	G	G	G		B			S	S	T	T			S		B	G	G	G	S		G	G	G			S		T	T													T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L	S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	T	F	N	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	D	V	I	N	A	L	S	S	T	I	P	S	I	Y	P	I	G	P	L	P	S	L	L	K	Q	T	P	Q	I	H	Q	L	D	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	C	L	D	W	L	E	S	K	E	P
Template Known Secondary structure			S	S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G									T	T		T	T													T	S	T	T	G	G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S		T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.										.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	.	S	Q	K	G	L	D	L	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q	G	G	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	A	E	Y	P	G	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D
Query Conservation															.
Alig confidence															.																																																											.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		G	S	V	V	Y	V	N	F	G	S	T	T	V	M	T	P	E	Q	L	L	E	F	A	W	G	L	A	N	C	K	K	S	F	L	W	I	I	R	P	D	L	V	I	G	G	S	V	I	F	S	S	E	F	T	N	E	I	A	D	R	G	L	I	A	S	W	C	P	Q	D	K	V	.	L	N	H	P	S	I	G
Template Known Secondary structure		T									S	S	S																	T	T									G	G	G	S	T	T	T	G	G	G	S									T	T	T					S								.		T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.		.	.	.	370	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400						.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.																											.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.																											.
Query Sequence		V	I	L	V	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R	T	G	G	.	.	.	.	.	L	A	D	T	V	S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	E	D	S	.	N	A	W	S	L	L	R	A	I	R	R	A	F	V	L	W
Query Conservation																																		.	.	.	.	.																											.
Alig confidence					.	.	.	.																										.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation					.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	L	.	.	.	.	T	H	C	G	W	N	S	T	T	E	S	I	C	A	G	V	P	M	L	C	W	P	F	F	A	D	Q	P	T	D	C	R	F	I	C	N	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	G	M	E	I	D	T	N	V	K	R	E	E	L	A	K	L	I	N	E	V	I	A	G	D
Template Known Secondary structure					.	.	.	.															T									S	T	T											T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S															T	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		374	.	.					.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.										.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		443				.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.
Query SS confidence			.	.	.
Query Sequence		S	.	.	.	R	P	S	L	W	R	F	V	Q	R	Q	A	M	A	M	D	F	S	W	Q	V	A	A	K	S	Y	R	E	L	Y	Y	R	L
Query Conservation			.	.	.
Alig confidence			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	K	K	M	K	Q	K	A	M	E	L	K	K	K	A	E	E	N	T	R	P	G	G	C	S	Y	M	N	L	N	K	V	I	K	D	V
Template Known Secondary structure																					T	S	T	T														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.