Job Description P0A6U8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 366 % Identity 17% Template d2iw1a1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 1.5

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	H	V	C	S	E	M	F	P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	T	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y	L	I
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	F	C	L	Y	K	Y	F	P	F	.	.	.	G	G	L	Q	R	D	F	M	R	I	A	S	T	V	A	A	R	G	H	H	V	R	V	Y	T	Q	S	W	E	G	D	C	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	F	E	L	I	Q	V
Template Known Secondary structure							S				T	T	.	.	.																	T	T								S				S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.				.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	50	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	N	V	L	R	F	A	L	L	G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	R	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	P	A	K	S	V	F	T	V	H	N
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	K	S	H	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	R	N	A	E	Y	Y	A	W	V	Q	N	H	L	K	E	H	P	A	D	R	V	V	G	F	N	K	M	P	G	L	D	V	Y	F	A	A	D	V	C	Y	A	E	K	V	A	Q	E	K	G	F
Template Known Secondary structure						S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		S			S					S	S			T	T		S						S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		55	.	.	.	.	60	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	Y	Q	G	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	F	N	G	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T	A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L	S
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	R	Y	R	H	Y	A	A	F	E	R	A	T	F	E	Q	G	K	S	T	K	L	M	M	L	T	D	K	Q	I	A	D	F	Q	K	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	E	P	E	R	F	Q
Template Known Secondary structure					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S															S	T	T								S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		114	.	.	.																				.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.												.	.	.	.	160	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q	G	G
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	P	P	G	I	Y	P	D	R	K	Y	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	P	N	S	R	E	I	Y	R	Q	K	N	G	I	K	E	Q	Q	N	L	L	L	Q	V	G	S	D	F	G	R	K	G	V	D	R	S	I	E	A	L	A	S	L	P	E	S	L	R
Template Known Secondary structure									G	G	G	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T									T	T			T	T									S		T	T	T	T	T										T	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	A	E	Y	P	G	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R	T	G	G	L	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		H	N	T	L	L	F	V	V	G	Q	D	K	P	R	K	F	E	A	L	A	E	K	L	G	V	R	S	N	V	H	F	F	S	G	R	N	D	V	S	E	L	M	A	A	A	D	L	L	L	H	P	A	Y	Q	E	A	A	G	I	V	L	L	E	A	I	T	A	G	L	P	V	L	T	T	A	V	C	G	Y	A
Template Known Secondary structure			T							S	S	S													T		G	G	G					S			S										S							S			S	S											T							T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		D	T	V	S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	.	E	D	S	N	A	W	S	L	L	R	A	I	R	R	A	F	V	L	W	S	R	P	S	L	W	R	F	V	Q	R	Q	A	M	A	M	D	F	S	W	Q	V	A	A	K	S	Y	R	E	L	Y	Y
Query Conservation																							.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																																		.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Template Sequence		H	Y	I	A	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	C	G	T	V	I	A	E	P	F	S	Q	E	Q	L	N	E	V	L	R	K	A	L	T	Q	S	P	L	R	M	A	W	A	E	N	A	R	H	Y	A	.	D	T	Q	D	L	Y	S	L	P	E	K	A	A	D	I	I	T
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							S	S																																.			S			S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.										.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.