Job Description P0A6U8 Confidence 98.85% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 263 % Identity 17% Template d2gj4a1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Oligosaccharide phosphorylase Resolution 1.60

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		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T	A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L	S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	M	A	H	L	C	I	A	G	S	H	A	V	N	G	V	A	R	I	H	S	E	I	L	K	K	T	I	F	K	D	F	Y	E	L	E	.	.	.	.	.	.	P	H	K	F	Q	N	K	T	N	G	I	T	P	R	R	W	L	V	L	C	N	P	G	L	A	E	I	I	A	E	R	I	G	E	E	Y	I	S
Template Known Secondary structure										T		S					S	S										T	T	T								.	.	.	.	.	.	G	G	G								B		T							T														S	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.							.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
														257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.								310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	.	.	.	.	.	.	.	V	L	E	A	L	P	G	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	D	Q	L	R	K	L	L	S	Y	V	D	D	E	A	F	I	R	D	V	A	K	V	K	Q	E	N	K	L	K	F	A	A	Y	L	E	R	E	Y	K	V	H	I	N	P	N	S	L	F	D	V	Q	V	K	R	I	H	E	Y	K	R	Q	L	L	N	C	L	H	V	I	T	L	Y	N	R	I	K	K	E
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	T	T																																	T	T	S							S				G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
		318	.	320				.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.															.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Query SS confidence					.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Query Sequence		L	E	Q	.	.	.	G	G	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	A	E	Y	P	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	.	.	F	E	P
Query Conservation					.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Alig confidence					.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	N	K	F	V	V	P	R	T	V	M	I	G	G	K	A	A	P	G	Y	H	M	A	K	M	I	I	K	L	I	T	A	I	G	D	V	V	N	H	D	P	V	V	G	D	R	L	R	V	I	F	L	E	N	Y	R	V	S	L	A	E	K	V	I	P	A	A	D	L	S	E	Q	I	S	T	A	G	T	E	A
Template Known Secondary structure		T	T	S															T	T																			T	T		T	T	T	G	G	G							T	T										G	G	G		S								T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R	T	G	G	L	A	D	T	V	S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	T	G	N	M	K	F	M	L	N	G	A	L	T	I	G	T	M	D	G	A	N	V	E	M	A	E	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	E	E	N	F	F	I	F	G	M	R	V	E	D	V	D	R	L	D	Q	R	G	Y	N	A	Q	E	Y	Y	D	R	I	P	E	L	R	Q	I	I	E	Q	L	S
Template Known Secondary structure				S								T	T							S		T	T										.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S				S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		674	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.								.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
									424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.			.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	D	S	N	A	W	S	L	L	R	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	A	F	V	L	W	S	R	P	S	L	W	R	F	V	Q	R	Q	A	M	A	M	.	.	D	F	S	W	Q	V	A	A	K	S	Y	R	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	F	F	S	P	K	Q	P	D	L	F	K	D	I	V	N	M	L	M	H	H	D	R	F	K	V	F	A	D	Y	E	E	Y	V	K	C	Q	E	R	V	S	A	L	Y	K	N	P	R	E	W	T	R	M	V	I	R	N	I	A	T	S	G	K	F	S	S	D	R	T	I	A	Q	Y	A	R
Template Known Secondary structure			T	T	T		T	T	S	T	T	T	T												T	T		T	G	G	G																T														T	T		G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		747	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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