Job Description P0A6U8 Confidence 99.19% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 447 % Identity 17% Template d2atia1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Oligosaccharide phosphorylase Resolution 1.90

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	L	G	N	G	G	L	G	R	L	A	A	C	F	L	D	S	M	A	T	L	G	L	A	A	Y	G	Y	G	I	R	Y	E	Y	G	I	F	N	Q	K	I	R	D	G	W	Q	V	E	E	A	D	D	W	L	R	Y	G	N	P	W	E	K	S	R	P	E	F	M	L	P	V	H	F	Y	G	K	V	E	H
Template Known Secondary structure							S																T	T											S	B		S							T	T									T	T	T	T			T	T					G	G	G							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
										53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.												.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y	L	I	D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	L	R	F	A	L	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	T	G	T	K	W	I	D	T	Q	V	V	L	A	L	P	Y	D	T	P	V	P	G	Y	M	N	N	T	V	N	T	M	R	L	W	S	A	R	A	P	D	Y	I	Q	A	V	L	D	R	N	L	A	E	N	I	S	R	V	L	Y	P	N	D	N	F	F	E	G	K	E	L	R	L	K	Q	E	Y	F	V
Template Known Secondary structure			T	T						S																T	T	S	S																					T	T					G	G	G	T	B					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.										.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.															.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query Sequence		G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	S	V	F	T	V	H	N	L	A	Y	Q	G	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	A	T	L	Q	D	I	I	R	R	F	K	A	S	K	F	T	V	F	D	A	F	P	D	Q	V	A	I	Q	L	N	D	T	H	P	A	L	A	I	P	E	L	M	R	I	F	V	D	I	E	K	L	P	W	S	K	A	W	E	L	T	Q	K	T	F	A	Y	T	N	H	T	V	L	P	E	A	L	E	R
Template Known Secondary structure																S						T	T	G	G	G	T							S	S	T	T	T	T												T	S																							S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																								168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190				.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	.	.	.	F	N	G	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T	A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	P	V	D	L	V	E	K	L	L	P	R	H	L	E	I	I	Y	E	I	N	Q	K	H	L	D	R	I	V	A	L	F	P	K	D	V	D	R	L	R	R	M	S	L	I	E	E	E	G	S	K	R	I	N	M	A	H	L	C	I	V	G	S	H	A	V	N	G	V	A	K	I	H	S	D	I	V	K	T	K
Template Known Secondary structure																																		T	T										S				S	S	S												T		S					S	S										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	270	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L	S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	E
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	K	D	F	.	.	.	.	.	.	S	E	L	E	P	D	K	F	Q	N	K	T	N	G	I	T	P	R	R	W	L	L	L	C	N	P	G	L	A	E	L	I	A	E	K	I	G	E	D	Y	V	K	D	L	S	Q	L	T	K	L	H	S	F	L	G	D	D	V	F	L	R	E	L	A	K	V	K	Q	E
Template Known Secondary structure		T	T				.	.	.	.	.	.		T	T		T	T	T								B		T							T														S	G	G	G	T		G	G	G	G	G	G	G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		467	.	.	470	.							.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.								310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320				.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query Sequence		D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	.	.	.	.	.	.	.	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q	.	.	.	G	G	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	L	K	F	S	Q	F	L	E	T	E	Y	K	V	K	I	N	P	S	S	M	F	D	V	Q	V	K	R	I	H	E	Y	K	R	Q	L	L	N	C	L	H	V	I	T	M	Y	N	R	I	K	K	D	P	K	K	L	F	V	P	R	T	V	I	I	G	G	K	A	A	P	G	Y	H	M	A	K	M	I	I
Template Known Secondary structure														S	S					T	T	S							S				T	T	T	T																			T	T	S															T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
		342	.	.	.	.	.															.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		A	A	E	Y	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	.	.	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R	T	G	G	L	A	D	T	V
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	I	T	S	V	A	D	V	V	N	N	D	P	M	V	G	S	K	L	K	V	I	F	L	E	N	Y	R	V	S	L	A	E	K	V	I	P	A	T	D	L	S	E	Q	I	S	T	A	G	T	E	A	S	G	T	G	N	M	K	F	M	L	N	G	A	L	T	I	G	T	M	D	G	A	N	V	E	M	A
Template Known Secondary structure													T		T	T	T	G	G	G								S										G	G	G		S								T	T	T		S			S								T	T							S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	S	N	A	W	S	L	L	R	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	E	E	N	L	F	I	F	G	M	R	I	D	D	V	A	A	L	D	K	K	G	Y	E	A	K	E	Y	Y	E	A	L	P	E	L	K	L	V	I	D	Q	I	D	N	G	F	F	S	P	K	Q	P	D	L	F	K	D	I	I	N	M	L	F	Y	H	D	R	F	K	V
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S				S																																				T	S	S		S	S		T	T	T	T										S		T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		701	.	.	.								.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.
													436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.			.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	A	F	V	L	W	S	R	P	S	L	W	R	F	V	Q	R	Q	A	M	A	M	.	.	D	F	S	W	Q	V	A	A	K	S	Y	R	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	D	Y	E	A	Y	V	K	C	Q	D	K	V	S	Q	L	Y	M	N	P	K	A	W	N	T	M	V	L	K	N	I	A	A	S	G	K	F	S	S	D	R	T	I	K	E	Y	A	Q
Template Known Secondary structure																				T															T		G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		774	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.