Job Description P0A6U8 Confidence 99.02% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 448 % Identity 17% Template d1ygpa_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Oligosaccharide phosphorylase Resolution 2.80

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	L	G	N	G	G	L	G	R	L	A	A	C	F	V	D	S	M	A	T	E	G	I	P	A	W	G	Y	G	L	R	Y	E	Y	G	I	F	A	Q	K	I	I	D	G	Y	Q	V	E	T	P	D	Y	W	L	N	S	G	N	P	W	E	I	E	R	N	E	V	Q	I	P	V	T	F	Y	G	Y	V	D	R
Template Known Secondary structure		B		S			S																T	T											S	S		S							T	T									T	T	T	T			T	T														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
											52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.																.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y	L	I	D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	T	L	S	A	S	Q	W	I	G	G	E	R	V	L	A	V	A	Y	D	F	P	V	P	G	F	K	T	S	N	V	N	N	L	R	L	W	Q	A	R	P	T	T	E	F	D	L	N	K	F	N	N	G	D	Y	K	N	S	V	A	Q	Q	Q	R	A	E	S	I	T	A	V	L	Y	P	N	D	N	F	A
Template Known Secondary structure				T	T	S							S															S	S															S		S								T	T						T												S	S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
							106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.									130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.															.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	N	V	L	R	F	A	L	L	G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	R	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	K	S	V	F
Query Conservation		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	K	E	L	R	L	K	Q	Q	Y	F	W	C	A	A	S	L	H	D	I	L	R	R	F	K	K	S	K	R	P	W	T	E	F	P	D	Q	V	A	I	Q	L	N	D	T	H	P	T	L	A	I	V	E	L	Q	R	V	L	V	D	L	E	K	L	D	W	H	E	A	W	D	I	V	T	K	T	F	A	Y
Template Known Secondary structure																														T			G	G	G											S	S	T	T	T													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.					.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Query Sequence		T	V	H	N	L	A	Y	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	F	N	G	.	.	.	.	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	H	T	V	M	Q	E	A	L	E	K	W	P	R	R	L	F	G	H	L	L	P	R	H	L	E	I	I	Y	D	I	N	W	F	F	L	E	D	V	A	K	K	F	P	K	D	V	D	L	L	S	R	I	S	I	I	E	E	N	S	P	E	R	Q	I	R	M	A	F	L	A	I	V	G	S	H	K	V	N
Template Known Secondary structure							S	G	G	G	S																																		S	T	T		T								S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L	S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	V	E	L	H	S	E	L	I	K	T	T	I	F	K	D	F	I	K	F	Y	G	.	.	.	.	.	P	S	K	F	V	N	V	T	N	G	I	T	P	R	R	W	L	K	Q	A	N	P	S	L	A	K	L	I	S	E	T	L	N	D	P	T	E	E	Y	L	L	D	M	A	K	L	T	Q	L	E	K	Y
Template Known Secondary structure			S	S										T	T	T									.	.	.	.	.	G	G	G								B						T	T	T	T												T	T		T	T		G	G	G	T		G	G	G	G	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.						.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
																		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.							.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																										.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																										.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	.	.	.	.	.	.	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	.	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																										.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																										.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	D	K	E	F	L	K	K	W	N	Q	V	K	L	N	N	K	I	R	L	V	D	L	I	K	K	E	N	D	G	V	D	I	I	N	R	E	Y	L	D	D	T	L	F	D	M	Q	V	K	R	I	H	E	Y	K	R	Q	Q	L	N	V	F	G	I	I	Y	R	Y	L	A	M	K	N	M	L	K	N	G	A
Template Known Secondary structure		G	G		T																								T	T	T	T				S		S	T	T	G	G	G								S				G	G	G	T																					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
												321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.													.	.	.	.	.			.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																													.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																													.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	Y	P	G	.	.	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		S	I	E	E	V	A	R	K	Y	P	R	K	V	S	I	F	G	G	K	S	A	P	G	Y	Y	M	A	K	L	I	I	K	L	I	N	C	V	A	D	I	V	N	N	D	E	S	I	E	H	L	L	K	V	V	F	V	A	D	Y	N	V	S	K	A	E	I	I	I	P	A	S	D	L	S	E	H	I	S	T	A
Template Known Secondary structure										S													T	T																			T	T		G	G	G	T	T	S							T	T										G	G	G		S								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence