Job Description P0A6U8 Confidence 99.91% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 339 % Identity 17% Template d1f0ka_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Peptidoglycan biosynthesis glycosyltransferase MurG Resolution 1.90

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	L	H	V	C	S	E	M	F	P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	T	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y	L
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	M	V	M	A	G	.	.	.	.	.	.	G	T	G	G	H	V	F	P	G	L	A	V	A	H	H	L	M	A	Q	G	W	Q	V	R	W	L	G	T	A	D	R	M	E	A	D	L	V	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	I	E	I	D	F
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	S	S																T	T	T									T	T	S	T					G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.							.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	60
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	N	V	L	R	F	A	L	L	G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	R	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	P	A	K	S	V	F	T	V	H
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	R	I	S	G	L	R	G	K	G	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	I	A	A	P	L	R	I	F	N	A	W	R	Q	A	R	A	I	M	K	A	Y	K	P	D	V	V	L	G	M	G	G	Y	V	S	G	P	G	G	L	A	A	W	S	L	G	I	P	V	V	L	H	E	Q	N
Template Known Secondary structure								T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T																						S						S	S	T	T											T	T									S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.													.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	A	Y	Q	G	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	F	N	G	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T	A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	N	K	W	L	A	K	I	A	T	K	V	M	Q	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	A	F	P	N	A
Template Known Secondary structure		S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T		S					S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		129	130	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							150	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q	G
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	V	G	N	P	V	R	T	D	V	L	A	L	P	L	P	Q	Q	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	R	E	G	P	V	R	V	L	V	V	G	G	S	Q	G	A	R	I	L	N	Q	T	M	P	Q	V	A	A	K	L	G	D	S
Template Known Secondary structure														T	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			S	S								T	T	T																	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	A	E	Y	P	G	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R	T	G	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	I	W	H	Q	S	G	K	G	S	Q	Q	S	V	E	Q	A	Y	A	E	A	G	Q	P	Q	H	K	V	T	E	F	I	D	D	M	A	A	A	Y	A	W	A	D	.	.	.	.	.	.	.	V	V	V	C	R	S	G	A	L	T	V	S	E	I	A	A	A	G	L	P	A	L	F	V	P	F	Q	H	K
Template Known Secondary structure										T	T												T	T		T	T	S				S			S										S	.	.	.	.	.	.	.																		T											T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.								.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		402								.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.			.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.			.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																										.	.																															.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.																										.	.																															.	.
Query Sequence		A	.	.	.	.	.	.	.	D	T	V	S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	E	D	S	N	.	.	A	W	S	L	L	R	A	I	R	R	A	F	V	L	W	S	R	P	S	L	W	R	F	V	Q	R	Q	A	M	A	.	.	M	D	F	S	W	Q	V	A	A	K	S	Y	R
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.																										.	.																															.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.												.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	Q	Q	Y	W	N	A	L	P	L	E	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	A	K	I	I	E	Q	P	Q	L	S	V	D	A	V	A	N	T	L	A	G	W	.	.	.	.	.	S	R	E	T	L	L	T	M	A	E	R	A	R	A	A	S	I	P	D	A	T	E	R	V	A	N	E	V	S
Template Known Secondary structure		T													T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S						G	G	G												T		.	.	.	.	.															T			T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.										300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.						.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		471	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	Y	Y	R	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	V	A	R	A	L
Template Known Secondary structure					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.