Job Description P0A6U8 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 334 % Identity 10% Template c2x0dA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:wsaf; PDBTitle: apo structure of wsaf Resolution 2.28 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	Q	V	L	H	V	C	S	E	M	F	P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	T	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y
Query Conservation
Alig confidence																									.																																																							.	.
Template Conservation																									.																																																							.	.
Template Sequence		K	R	L	N	L	L	V	P	S	I	N	Q	E	H	X	F	G	G	I	S	T	A	L	.	K	L	F	E	Q	F	D	N	K	K	F	K	K	R	I	I	L	T	D	A	T	P	N	P	K	D	L	Q	S	F	K	S	F	K	Y	V	X	P	E	E	D	K	D	F	A	L	Q	I	V	P	F	N	D	R	.	.
Template Known Secondary structure									S				G	G	G		S								.				T	T	S		T	T	T								S	S									G	G	G	T	T	S					T	T						S							S			.	.
Template Predicted Secondary structure																									.																																																							.	.
Template SS confidence
		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	N	V	L	R	F	A	L	L	G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	R	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	P	A	K	S	V	F	T	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	R	T	I	P	V	A	K	H	D	I	F	I	A	T	A	W	W	T	A	Y	A	A	Q	R	I	V	S	W	Q	S	D	T	Y	G	I	P	P	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							T	T							S																			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																										124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	N	L	A	Y	Q	G	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	F	N	G	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T	A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	L	Y	I	I	Q	D	F	E	P	G	F	Y	Q	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	Y	V	L	A	E	S	T	Y	K	Y	R	G	P	Q	I	A	V	F	N	S	E	L	L	K	Q	Y	F	N	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	N	F	T	D
Template Known Secondary structure									S		G	G	G	G	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	S			S								S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180														.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.													.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Y	F	F	Q	P	K	I	N	T	T	L	K	N	Y	I	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	Q	K	E	K	I	I	L	V	Y	G	R	P	S	V	K	R	N	A	F	T	L	I	V	E	A	L	K	I	F	V	Q	K
Template Known Secondary structure															T	T	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S								T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		321	.				.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.
Query SS confidence				.	.	.
Query Sequence		G	G	.	.	.	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	A	E	Y	P	G	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R
Query Conservation				.	.	.
Alig confidence				.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	R	S	N	E	W	K	I	I	S	V	G	E	K	H	K	D	I	A	.	.	.	.	.	L	G	K	G	I	H	L	N	S	L	G	K	L	T	L	E	D	Y	A	D	L	L	K	R	S	S	I	G	I	S	L	X	I	S	P	H	P	S	Y	P	P	L	E	X	A	H	F	G	L	R	V	I	T	N	K
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G								S							.	.	.	.	.			T	T								S																					S	S	S	S			S								T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290						.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	G	L	A	D	T	V	S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	E	D	S	N	A	W	S	L	L	R	A	I	R	R	A	F	V	L	W	S	R	P
Query Conservation
Alig confidence		.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	Y	E	N	K	D	L	S	N	W	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	I	V	S	L	E	Q	L	N	P	E	N	I	A	E	T	L	V	E	L	C	X	S	F	N	E	S
Template Known Secondary structure		.	B	T	T	B		G	G	G	T	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					S	S		S															T
Template Predicted Secondary structure		.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			346	.	.	.	350	.	.	.	.	.										.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.