Job Description P0A6U8 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:03:56 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 374 % Identity 16% Template c2iyfA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:oleandomycin glycosyltransferase; PDBTitle: the crystal structure of macrolide glycosyltransferases: a2 blueprint for antibiotic engineering Resolution 1.7 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	L	H	V	C	S	E	M	F	P	L	L	K	T	G	G	L	A	D	V	I	G	A	L	P	A	A	Q	I	A	D	G	V	D	A	R	V	L	L	P	A	F	P	D	I	R	R	G	V	T	D	A	Q	V	V	S	R	R	D	T	F	A	G	H	I	T	L	L	F	G	H	Y	N	G	V	G	I	Y	L
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		H	I	A	M	F	S	I	.	.	.	.	.	.	A	A	H	G	H	V	N	P	S	L	E	V	I	R	E	L	V	A	R	G	H	R	V	T	Y	A	I	P	P	V	F	A	D	K	V	A	A	T	G	P	R	P	V	L	Y	H	S	T	L	P	G	P	D	A	D	P	E	A	W	G	S	T	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	S						G	G	G										T	T									G	G	G						T	T	S										S			T	T	S		G	G	G	G		S	S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.							.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	P	H	L	Y	D	R	P	G	S	P	Y	H	D	T	N	L	F	A	Y	T	D	N	V	L	R	F	A	L	L	G	W	V	G	A	E	M	A	S	G	L	D	P	F	W	R	P	D	V	V	H	A	H	D	W	H	A	G	L	A	P	A	Y	L	A	A	R	G	R	P	A	K	S	V	F	T	V	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	D	N	V	E	P	F	L	N	D	A	I	Q	A	L	P	Q	L	A	D	A	Y	A	D	D	I	P	D	L	V	L	H	D	I	T	.	.	.	S	Y	P	A	R	V	L	A	R	R	W	G	V	P	A	V	S	L	S	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								T	T	S			S						T	T	.	.	.												T								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Template SS confidence
																							77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.				.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	A	Y	Q	G	M	F	Y	A	H	H	M	N	D	I	Q	L	P	W	S	F	F	N	I	H	G	L	E	F	N	G	Q	I	S	F	L	K	A	G	L	Y	Y	A	D	H	I	T	A	V	S	P	T	Y	A	R	E	I	T	E	P	Q	F	A	Y	G	M	E	G	L	L	Q	Q	R	H	R	E	G	R	L
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Sequence		N	L	V	A	W	K	G	Y	E	E	E	V	A	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	W	R	E	P	R	Q	T	E	R	G	R	A	Y	Y	A	R	F	E	A	W	L	K	E	N	G	I	T	E	H	P	D	T	F	A	S	H	P	.	.	P	R	S	L
Template Known Secondary structure		S					T	T					T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S																	T	T			S										.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template SS confidence
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.			.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	V	L	N	G	V	D	E	K	I	W	S	P	E	T	D	L	L	L	A	S	R	Y	T	R	D	T	L	E	D	K	A	E	N	K	R	Q	L	Q	I	A	M	G	L	K	V	D	D	K	V	P	L	F	A	V	V	S	R	L	T	S	Q	K	G	L	D	L	V	L	E	A	L	P	G	L	L	E	Q	G
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	I	P	K	A	L	Q	P	H	A	D	R	V	D	E	D	V	Y	T	F	V	G	A	C	Q	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	R	P	A	G	A	E	K	V	V	L	V	S	L	G	S	A	F	T	Q	P	A	F	Y	R	E	C	V	R	A	F	G	N	L	P
Template Known Secondary structure				S		G	G	G	S	T	T	G	G	G	S		T	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T		S								T	T	T															T	T		T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.																.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		G	Q	L	A	L	L	G	A	G	D	P	V	L	Q	E	G	F	L	A	A	A	A	E	Y	P	G	Q	V	G	V	Q	I	G	Y	H	E	A	F	S	H	R	I	M	G	G	A	D	V	I	L	V	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	G	L	K	Y	G	T	L	P	L	V	R	R	T	G	G	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.											.	.	.	.																								.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.											.	.	.	.
Template Sequence		G	W	H	L	V	L	Q	I	G	T	P	A	E	.	.	.	.	.	.	.	L	G	E	L	P	D	N	V	E	V	H	D	W	V	P	Q	L	A	I	.	.	.	L	R	Q	A	D	L	F	V	T	H	.	.	.	.	A	G	A	G	G	S	Q	E	G	L	A	T	A	T	P	M	I	A	V	P	Q	A	V	D
Template Known Secondary structure		T										G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	G		S			T	T					S	S							.	.	.		T	T		S						.	.	.	.												T	T									S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.											.	.	.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.								.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.				.	.	.	.	.	.	.	300	.	.					.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
					401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.			.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																												.	.
Query SS confidence		.	.	.																												.	.
Query Sequence		.	.	.	L	A	D	T	V	S	D	C	S	L	E	N	L	A	D	G	V	A	S	G	F	V	F	E	D	S	N	.	.	A	W	S	L	L	R	A	I	R	R	A	F	V	L	W	S	R	P	S	L	W	R	F	V	Q	R	Q	A	M	A	M	D	F	S	W	Q	V	A	A	K	S	Y	R	E	L
Query Conservation		.	.	.																												.	.
Alig confidence		.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template Sequence		Q	F	G	N	A	D	M	L	Q	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	A	R	K	L	A	T	E	E	A	T	A	D	L	L	R	E	T	A	L	A	L	V	D	D	P	E	V	A	R	R	L	R	R	I	Q	A	E	M	A	Q	E	.	G	G	T	R	R	A	A	D	L	I	E	A	E
Template Known Secondary structure												T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S								.																																		.												T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template SS confidence
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340										.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.		.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.