Job Description P0A959 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:09:27 GMT 2012 Rank 133 Aligned Residues 350 % Identity 15% Template c3bcxA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cdp-6-deoxy-l-threo-d-glycero-4-hexulose-3- PDBTitle: e1 dehydrase Resolution 2.40 Å

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		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.			.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.
Query SS confidence																																					.	.
Query Sequence		I	R	G	P	V	L	K	E	A	K	R	L	E	E	E	G	N	K	V	L	K	L	N	I	G	N	P	A	P	F	G	F	D	A	P	.	.	D	E	I	L	V	D	V	I	R	N	L	P	T	A	Q	G	Y	C	D	S	K	G	L	Y	S	A	R	K	A	I	M	Q	H	Y	Q	A	R	G	M	R	D	V	T
Query Conservation																																					.	.
Alig confidence																																					.	.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	Q	Q	I	A	E	L	V	A	Q	Y	A	E	T	A	M	A	P	K	P	F	E	A	G	K	S	V	V	P	P	S	G	K	V	I	G	T	K	E	L	Q	L	M	V	E	A	S	L	D	G	.	W	L	T	T	G	R	F	N	D	A	F	E	K	K	L	G	E	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure																		T							T	T	T	S		B		S																				T	.			B	S																.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.									.
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.										.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	D	I	Y	I	G	N	G	V	S	E	L	I	V	Q	A	M	Q	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	G	D	E	M	L	V	P	A	P	D	Y	P	L	W	T	A	A	V	S	L	S	S	G	K	A	V	H	Y	L	C	D	E	S	S	D	W	F	P	D	L	D	D	I	R	A	K	I
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		V	P	Y	V	L	T	T	T	S	G	S	S	A	N	L	L	A	L	T	A	L	T	S	P	K	L	G	V	R	A	L	K	P	G	D	E	V	I	T	V	A	A	G	F	P	T	T	V	N	P	T	I	Q	N	G	L	I	P	V	F	V	D	V	D	I	P	T	.	Y	N	V	N	A	S	L	I	E	A	A	V
Template Known Secondary structure			S						S													T	T		G	G	G	G	G	G	S			T	T							S	S	S											T	T								B		T	T	T	.		S	B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.		.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	R	T	R	G	I	V	I	I	N	P	N	N	P	T	G	A	V	Y	S	K	E	L	L	M	E	I	V	E	I	A	R	Q	H	N	L	I	I	F	A	D	E	I	Y	D	K	I	L	Y	D	D	A	E	H	H	S	I	A	P	L	A	P	D	L	L	T	I	T	F	N	G	L	S	K	T	Y	R	V	A
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.									.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.									.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	K	T	K	A	I	M	I	A	.	.	.	H	T	L	G	N	L	F	D	.	.	.	L	A	E	V	R	R	V	A	D	K	Y	N	L	W	L	I	E	D	C	C	D	A	L	G	S	T	Y	D	G	K	M	.	.	.	.	.	.	A	G	T	F	G	D	I	G	T	V	S	F	Y	P	A	H	H	I	T
Template Known Secondary structure			S	S								.	.	.		G	G	G					.	.	.												T								T	T		T	T				T	T			.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S	S							S	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.									.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.				.	.	.	.	170	.	.	.				.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.							.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	R	Q	G	W	M	V	L	N	G	P	K	K	H	A	K	G	Y	I	E	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	M	L	A	S	M	R	L	C	A	N	V	P	A	Q	H	A	I	Q	T	A	L	G	G	Y	Q	S	I	S	E	F	I	T	P	G	G	R
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	G	E	G	G	A	V	F	T	Q	S	A	E	L	K	S	I	I	E	S	F	R	D	W	G	R	D	C	Y	C	L	G	S	L	P	F	G	Y	D	H	K	Y	T	Y	S	H	L	G	Y	N	L	K	I	T	D	M	Q	A	A	C	G	L	A	Q	L	E	.	.	.	.	.	.	R	I	E	E	F	V	E	K
Template Known Secondary structure			S	S							S													B	T	T	B										T	T			G	G	G		B		S				B				B													.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.							290	.	.	.	.	.	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330									.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Y	E	Q	R	N	R	A	W	E	L	I	N	D	I	P	G	V	S	C	V	K	P	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	Y	M	F	P	K	I	D	A	K	R	F	N	I	H	D	D	Q	K	M	V	L	D	F	L	L	Q	E	K	V	L	L	V	Q	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	A	N	F	K	Y	L	K	D	A	L	Q	S	C	A	D	F	I	E	L	P	E	A	T	E	N	S	D	P	S	W	F	G	F	P	I	T	L	K	E	D	S	G	V	.	.	.	.	.	S	R	I	D	L	V	K	F	L	D	E	A	K	V	G	T	R	L	L	F	A	G	N	L	T	R	Q	P	Y	F
Template Known Secondary structure													G	G	G	G	T	T	T								T	T						S	S							G	G	G	S	S	.	.	.	.	.												T	T	B			B			T	T	S	S	G	G	G	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.						.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		370	.	.	.															.	.	.	.	.	.	380	.	.			.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Query Sequence		N	W	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	H	F	R	I	V	T	L	.	.	P	R	V	D	D	I	E	L	S	L	S	K	F	A	R	F	L
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	D	V	K	Y	R	V	V	G	E	L	T	N	T	D	R	I	M	N	Q	T	F	W	I	G	I	Y	P	G	L	T	H	D	H	L	D	Y	V	V	S	K	F	E	E	F	F
Template Known Secondary structure		T	T							S																		S	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.