Job Description P00968 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:25 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 332 % Identity 20% Template c2qf7A_ PDB info PDB header:ligase Chain: A: PDB Molecule:pyruvate carboxylase protein; PDBTitle: crystal structure of a complete multifunctional pyruvate carboxylase2 from rhizobium etli Resolution 2.00 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.																.	70
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	I	K	S	I	L	I	L	G	A	G	P	I	V	I	G	Q	A	C	E	F	D	Y	S	G	A	Q	A	C	K	A	L	R	E	E	G	Y	R	V	I	L	V	N	S	N	P	A	T	I	M	T	D	P	E	M	A	D	A	T	Y	I	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	H
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	S	K	I	L	V	A	N	R	S	E	I	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	F	R	A	A	N	E	L	G	I	K	T	V	A	I	W	A	E	E	D	K	L	A	L	H	R	F	K	A	D	E	S	Y	Q	V	G	R	G	P	H	L	A	R	D	L	G	P	I	E	S	Y	L	S
Template Known Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T									G	G	G	T	T						S	S	S	S					S		S	T	T	S	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.												.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	E	V	V	R	K	I	I	E	K	E	R	P	D	A	V	L	P	T	M	G	G	Q	T	A	L	N	C	A	L	E	L	E	R	Q	G	V	L	E	E	F	G	V	T	M	I	G	A	T	A	D	A	I	D	K	A	E	D	R	R	R	F	D	V	A	M	K	K	I	G	L	E	T	A	R	S	G	I	A	H
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.												.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.												.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	E	V	I	R	V	A	K	L	S	G	A	D	A	I	H	P	G	Y	G	.	.	.	L	L	S	E	S	P	E	F	V	D	A	.	.	C	N	K	A	G	I	I	F	I	G	P	K	A	D	T	M	R	Q	L	G	N	K	V	A	A	R	N	L	A	I	S	V	G	V	P	V	V	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T		S						S	S	.	.	.	T	T	T	T								.	.				T	T				S	S											S											T	T			B		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.												.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.				.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.			.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	M	E	E	A	L	A	V	A	A	D	V	G	F	P	C	I	I	R	P	S	F	T	M	G	G	S	G	G	G	I	A	Y	N	R	E	E	F	E	E	I	C	A	R	G	L	D	L	S	P	T	K	E	L	L	I	D	E	S	L	I	G	W	K	E	Y	E	M	E	V	V	R	D	K	N	D	N	C	I	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	V	E	R	A	R	H	V	E	S	Q	I	L	G	D	T	H	G	N	V	V	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S												T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																											209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	C	S	I	E	N	F	D	A	M	G	I	H	T	G	D	S	I	T	V	A	P	A	Q	T	L	T	D	K	E	Y	Q	I	M	R	N	A	S	M	A	V	L	R	E	I	G	V	E	T	G	G	S	N	V	Q	F	A	V	N	P	K	N	G	R	L	I	V	I	E	M	N	P	R	V	S	R	S	S	A	L
Query Conservation
Alig confidence				.	.																																													.
Template Conservation				.	.																																													.
Template Sequence		L	F	.	.	E	R	D	C	S	V	Q	R	R	N	Q	K	V	V	E	R	A	P	A	P	Y	L	S	E	A	Q	R	Q	E	L	A	A	Y	S	L	K	I	A	G	A	T	N	Y	I	.	G	A	G	T	V	E	Y	L	M	D	A	D	T	G	K	F	Y	F	I	E	V	N	P	R	I	Q	V	E	H	T	V
Template Known Secondary structure				.	.									T	T								S		T	T																				T	T			.											T	T	T	T										S			T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.																																													.
Template SS confidence
		232	.			.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.		.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Query Sequence		A	S	K	A	T	G	F	P	I	A	K	V	A	A	K	L	A	V	G	Y	T	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	M	N	D	I	T	G	G	R	T	P	A	S	F	E	P	S	I	D	Y	V	V	T	K	I	P	R	F	N	F	E	K	F	A	G	A	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.
Template Sequence		T	E	V	V	T	G	I	D	I	V	K	A	Q	I	H	I	L	D	G	A	A	I	G	T	P	Q	S	G	V	P	N	Q	E	D	I	R	L	N	G	H	A	L	Q	C	R	V	T	T	E	D	P	E	H	N	F	I	P	D	Y	G	.	.	.	.	R	I	T	A	Y	R	S	A	S	G	F	G	I	R	L	D
Template Known Secondary structure																			T	T			T	T	S	G	G	G	T				G	G	G					S									S			T	T	T	T	T						.	.	.	.											T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.					.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
								371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.		.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.		.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.												.																										.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.												.																										.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	N	D	R	L	T	T	Q	M	K	S	V	.	G	E	V	M	A	I	G	R	T	Q	Q	E	S	L	Q	K	A	L	R	G	L	E	V	G	A	.	T	G	F	D	P	K	V	S	L	D	D	P	E	A	L	T	K	I	R	R	E	L	K	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.												.																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.												.																										.										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	T	S	Y	S	G	A	I	I	T	R	Y	Y	D	P	L	L	V	K	V	T	A	W	A	P	N	P	L	E	A	I	S	R	M	D	R	A	L	R	E	F	R	I	R	G	V	A	T	N	L	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	A	I	I	G	H	P
Template Known Secondary structure				S			T	T					S	S	S												S	S																			S	S			S				.	.	.	.	.	.	.	.						T	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.									.	.	440	.	.	.	.	.