Job Description P39452 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:00:51 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 523 % Identity 19% Template d1l1la_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes B12-dependent (class II) ribonucleotide reductase Resolution 1.75

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	Y	D	E	S	V	L	N	R	Y	S	R	D	F	V	I	T	L	F	T	H	A	H	T	S	G	F	R	F	Q	T	F	L	G	A	W	K	F	Y	T	S	Y	T	L	K	T	F	D	G	K	R	Y	L	E	D	F	A	D	R	V	T	M	V	A	L	T	L	A	Q	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Sequence		S	L	S	A	E	F	I	D	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	S	V	K	P	H	W	G	K	L	G	W	V	T	Y	K	R	T	Y	A	R	W	L	P	E	K	G	R	S	.	E	N	W	D	E	T	V	K	R	V	V	E	G	N	I	N	L	D	P	R	L	Q	D	S	P	S	L
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T							T	T	T					T	T	T	T			.																T	T		G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.													.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.		.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
								142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.						.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.																.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	E	T	L	A	L	Q	L	T	D	E	M	L	S	G	R	F	Q	P	A	T	P	T	F	L	N	C	G	K	Q	Q	R	G	E	.	.	.	.	.	L	V	S	C	F	L	L	R	I	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	E	S	I	G	R	A	V	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																													.					.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		E	L	K	Q	S	L	T	E	E	A	E	R	L	Y	K	L	I	Y	G	L	G	A	T	P	S	G	R	N	L	W	I	S	G	T	.	D	Y	Q	R	R	T	G	D	S	L	N	N	C	W	F	V	A	I	R	P	Q	K	Y	G	D	S	K	I	V	P	S	Y	L	G	K	Q	E	K	A	V	S	M	P	F	S
Template Known Secondary structure																				T	T	S											T	T	S	.					T	S	T	T	T	T									S						S		S				T	T	S		S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.		.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	L	Q	L	S	K	R	G	G	G	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	L	F	D	E	L	M	K	G	G	G	V	G	F	S	V	A	R	S	N	I	S	Q	I	P	R	V	D	F	A	I	D	L	Q	L	V	V	D	E	T	S	E	S	Y	D	A	S	V	K	V	G	A	V	G	K	N	E	L	V	Q	D	A	D	S	I	Y	Y	R	L	P	D	T	R	E	G	W	V	L	A	N
Template Known Secondary structure									T	T													T	T	S															T	T	S	T	T							T	T		B		T	T	T					T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
																						209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	L	S	N	L	R	E	A	G	A	P	I	K	R	I	E	N	Q	S	S	G	V	I	P	V	M	K	M	L	E	D	A	F	S	Y	A	N	Q	L	G	A	R	Q	G	A	G	A	V	Y	L	H	A	H	H	P	D	I	L	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	L	I	D	L	H	F	A	Q	T	N	P	D	R	K	Q	K	L	I	L	D	L	S	D	I	R	P	Y	G	A	E	I	H	G	F	G	G	T	A	S	G	P	M	P	L	I	S	M	L	L	D	V	N	E	V	L	N	N	K	A	G	G	R	L	T	A	V	D	A	A	D	I	C	N	L	I	G	K	A
Template Known Secondary structure							T	T	S	G	G	G		T	T										T	T	S			T	T		B		T	T	S	S	S	B				S																T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	D	T	K	R	E	N	A	D	E	K	I	R	I	K	T	L	S	L	G	V	V	I	P	D	I	T	F	H	L	A	K	E	N	A	Q	M	A	L	F	S	P	Y	D	V	E	R	V	Y	G	K	P	F	A	D	V	A	I	S	Q	H	Y	D	E	L	V	A	D	E	R	I	R	K	K	Y	L	N	A	R
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	A	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	L	A	L	G	S	N	D	D	Q	D	F	I	S	M	K	Q	D	Q	E	K	L	M	H	H	R	W	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	S	V	A	V	D	S	A	F
Template Known Secondary structure				T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T							G	G	G								T	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.											.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.									.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	F	Q	R	L	A	E	I	Q	F	E	S	G	Y	P	Y	I	M	Y	E	D	T	V	N	R	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	A	G	R	I	N	M	S	N	L	C	S	E	I	L	Q	V	N	S	A	S	E	Y	D	E	N	L	D	Y	T	R	T	G	H	D	I	S	C	N	L	G	S	L
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	Y	Q	P	I	A	A	G	I	R	E	N	G	E	P	G	I	V	N	L	D	L	S	K	N	Y	G	R	I	V	D	G	Y	Q	A	G	I	D	G	D	V	E	G	T	N	P	C	G	E	I	S	L	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	P	C	N	L	F	E	V
Template Known Secondary structure															S														S	S	G	G	G				T	T	T	T	T	T						T	T			S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	420	.	.	.	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		N	I	A	H	T	M	D	S	P	.	D	F	A	R	T	V	E	T	A	V	R	G	L	T	A	V	S	D	M	S	H	I	R	S	V	P	S	I	E	A	G	N	A	A	S	H	A	I	G	L	G	Q	M	N	L	H	G	Y	L	A	R	E	G	I	A	Y	G	S	P	E	A	L	D	F	T	N	L	Y	F	Y
Query Conservation											.
Alig confidence											.																			.				.
Template Conservation																														.				.
Template Sequence		F	P	L	I	A	E	E	Q	G	W	D	L	Q	E	V	F	A	L	A	A	R	Y	A	K	R	V	T	F	.	S	P	Y	.	D	W	E	I	S	R	E	I	I	Q	K	N	R	R	I	G	I	S	M	S	G	I	Q	D	W	L	L	T	R	L	G	N	R	V	V	T	G	F	K	D	D	F	D	P	E	T	H
Template Known Secondary structure									T	T																		T	T	.	S			.	S																				S										S	S		S										T	T	T
Template Predicted Secondary structure																														.				.
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.		.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	T	W	H	A	L	R	T	S	M	L	L	A	R	E	R	G	E	T	F	A	G	F	K	Q	S	R	Y	A	S	G	E	Y	F	S	Q	Y	L	Q	G	N	W	Q	P	K	T	A	K	V	G	E	L	F	T	R	S	G	I	T	L	P	T	R	E	M	W	A	Q	L	R	D	D	V	M	R	Y	G	I	Y
Query Conservation
Alig confidence																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	I	K	V	P	V	Y	D	K	R	A	I	K	M	V	D	Q	.	L	Y	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	A	D	Q	D	Y	S	K	T	L	G	C	N
Template Known Secondary structure																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T
Template Predicted Secondary structure																				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		580	.	.		.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								620	.	.	.	.	.		.	.	.	.	630	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Query SS confidence					.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Query Sequence		N	Q	N	.	L	Q	A	V	P	P	T	G	S	I	S	Y	I	N	H	A	T	S	S	I	H	P	I	V	A	K	V	E	I	R	K	E	G	K	T	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Y	Y	P	A	P	.	F	M	T	N	E	N	L	A	L
Query Conservation					.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Alig confidence					.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Conservation
Template Sequence		E	S	I	K	H	T	T	V	K	P	S	G	T	V	A	K	L	A	G	A	S	E	G	M	H	F	H	Y	G	A	Y	L	I	Q	R	I	R	F	Q	D	S	D	P	L	L	P	A	L	K	A	C	G	Y	R	T	E	A	D	I	Y	T	E	N	T	T	C	V	E	F	P	I	K	A	V	G	A	D	N	P	N
Template Known Secondary structure				S					B											T				T	T			B	S		S										T	T		T								T	T							S	S	S	T	T											T	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.		.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.			690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.																																			.	.
Query SS confidence																							.																																			.	.
Query Sequence		Y	Q	D	A	Y	E	I	G	A	E	K	I	I	D	T	Y	A	E	A	T	R	.	H	V	D	Q	G	L	S	L	T	L	F	F	P	D	T	A	T	T	R	D	I	N	K	A	Q	I	Y	A	W	R	K	G	I	K	.	.	T	L	Y	Y	I	R	L	R	Q	M	A	L	E	G	T	E
Query Conservation																							.																																			.	.
Alig confidence																							.																.															.				.	.
Template Conservation																																							.															.
Template Sequence		F	A	S	A	G	T	V	S	I	A	E	Q	F	A	T	Q	A	F	L	Q	T	Y	W	S	D	N	A	V	S	C	T	I	T	F	Q	D	S	.	E	G	D	Q	V	E	S	L	L	R	Q	Y	R	F	.	I	T	K	S	T	S	L	L	P	Y	F	G	G	S	L	Q	Q	A	P	K	E
Template Known Secondary structure				B	T	T	T	S																T		S	S		B								G	G	.	G	G	G	G								T	T	T	.	T		S													T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																							.															.
Template SS confidence
		620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.		.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670		.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.