Job Description P39452 Confidence 94.98% Date Thu Jan 5 12:00:51 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 256 % Identity 17% Template d1hk8a_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes Class III anaerobic ribonucleotide reductase NRDD subunit Resolution 2.45

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		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.		.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.																																						.	.	.
Query SS confidence																																									.																																						.	.	.
Query Sequence		D	F	F	Q	R	L	A	E	I	Q	F	E	S	G	Y	P	Y	I	M	Y	E	D	T	V	N	R	A	N	P	I	A	G	R	I	N	M	S	N	L	.	C	S	E	I	L	Q	V	N	S	A	S	E	Y	D	E	N	L	D	Y	T	R	T	G	H	D	I	S	C	N	L	G	S	L	N	I	A	H	.	.	.
Query Conservation																																									.																																						.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.			.																					.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.																								.	.	.	.
Template Sequence		D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	R	M	Y	P	D	I	I	S	A	K	N	N	K	A	I	T	G	S	S	V	P	V	.	.	.	S	P	M	G	C	R	S	F	L	S	V	W	K	D	S	T	G	N	E	I	L	D	G	.	.	.	.	R	N	N	L	G	V	V	T	L	N	L	P	R	I	A	L
Template Known Secondary structure																														T		S	S			.	.	.			B	T	T	T	B						B		T	T	S		B			T	T	.	.	.	.		B
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.				.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.					.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
								425	.	.					.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.		.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	T	M	D	.	.	.	.	S	P	D	F	A	R	T	V	E	T	A	V	R	G	L	T	A	V	S	D	M	S	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	V	P	S	I	E	A	G	N	A	A	S	H	A	I	.	G	L	G	Q	M	N	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.				.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	Y	I	G	T	Q	F	N	E	Q	K	F	V	E	L	F	N	E	R	M	D	L	C	F	E	A	L	M	C	R	I	S	S	L	K	G	V	K	A	T	V	A	P	I	L	Y	Q	E	G	A	F	G	V	R	L	K	P	D	D	D	I	I	E	L	F	K	N	G	R	S	S	V	S	L	G	Y	I	G	I
Template Known Secondary structure		T	T			T	T																													T	T	T		B	G	G	G						T	S	S	T	T	S	S				T	T	S	B	T					T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	G	Y	L	A	R	E	G	I	A	Y	G	S	P	E	A	L	D	F	T	N	L	Y	F	Y	A	I	T	W	H	A	L	R	T	S	M	L	L	A	R	E	R	G	E	T	F	A	G	F	K	Q	S	R	Y	A	S	G	E	Y	F	S	Q	Y	L	Q	G	N	W	Q	P	K	T	A	K	V	G	E	L	F	T
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	E	L	N	I	L	V	G	R	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	E	I	L	T	K	M	N	A	H	L	.	.	.	.	K	Q	W	T	E	R	T	G	F	A	F	S	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	S			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.								S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.									.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.					.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		R	S	G	I	T	L	P	T	R	E	M	W	A	Q	L	R	D	D	V	M	R	Y	G	I	Y	N	Q	N	L	Q	A	V	P	P	T	G	S	I	S	Y	I	N	H	A	T	S	S	I	H	P	I	V	A	K	V	E	I	R	K	E	G	K	T	G	R	V	Y	Y	P	A	P	F	M	T	N	E	N	L	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	S	T	P	A	E	N	L	C	Y	R	F	C	K	L	D	T	E	K	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	D	V	T	D	K	G	W	Y	T
Template Known Secondary structure		.	.	.					T	T																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
				633	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																						.
Query SS confidence		.	.																																						.
Query Sequence		.	.	A	L	Y	Q	D	A	Y	E	I	G	A	E	K	I	I	D	T	Y	A	E	A	T	R	H	V	D	Q	G	L	S	L	T	L	F	F	P	D	.	T	A	T	T	R	D	I	N	K	A	Q	I	Y	A	W	R	K	G	I	K	T	L	Y	Y	I	R	L	R	Q	M	A	L	E	G	T	E	I	E	G	C
Query Conservation		.	.																																						.
Alig confidence		.	.																																						.																		.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	F	H	V	S	V	E	E	N	I	T	P	F	E	K	I	S	R	E	A	P	Y	H	F	I	A	T	G	G	H	I	S	Y	V	E	L	P	D	M	K	N	N	L	K	G	L	E	A	V	W	D	Y	A	A	Q	H	.	.	.	L	D	Y	F	G	V	N	M	P	V	D	K	.	.	.	.	.	.	.	C
Template Known Secondary structure			T	T				T	T	S																T	T		T	T	B											T	T																.	.	.		S											.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530				.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.								.
		710	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	C
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	T	C
Template Known Secondary structure		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		544	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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