Job Description P39452 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:00:51 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 542 % Identity 27% Template c1xjeA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:ribonucleotide reductase, b12-dependent; PDBTitle: structural mechanism of allosteric substrate specificity in a2 ribonucleotide reductase: dttp-gdp complex Resolution 1.90 Å

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		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.																.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	F	T	H	A	H	T	S	G	F	R	F	Q	T	F	L	G	A	W	K	F	Y	T	S	Y	T	L	K	T	F	D	G	K	R	Y	L	E	D	F	A	D	R	V	T	M	V	A	L	T	L	A	Q	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	L	A	L	Q	L	T	D	E
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	S	D	L	I	S	R	W	I	D	V	E	P	S	K	N	A	Q	I	I	L	R	D	R	Y	F	M	K	D	L	D	G	N	Y	L	E	T	K	W	E	D	V	A	R	R	V	A	R	V	V	A	T	A	E	L	L	N	P	S	Y	K	K	N	E	K	L	D	R	I	K	E	W	E	D	I	F	F	R	V
Template Known Secondary structure												T															T	S		B		T	T			B	S			S														G	G	G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	L	S	G	R	F	Q	P	A	T	P	T	F	L	N	C	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	R	G	E	L	V	S	C	F	L	L	R	I	E	D	N	M	E	S	I	G	R	A	V	N	S	A	L	Q	L	S	K	R	G	G
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	A	R	L	F	I	P	N	S	P	T	L	F	N	A	G	L	G	V	K	H	D	L	L	W	K	P	I	D	Q	M	T	L	E	D	Y	E	E	I	Y	R	S	R	N	H	L	H	M	L	S	A	C	F	V	V	P	V	G	D	S	I	E	E	I	F	E	A	V	K	E	Y	A	L	I	T	K	V	G	G
Template Known Secondary structure				T	T	S											T	T	T	T	S						S	S		G	G	G															T	T													S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	A	F	L	L	S	N	L	R	E	A	G	A	P	I	K	R	I	E	N	Q	S	S	G	V	I	P	V	M	K	M	L	E	D	A	F	S	Y	A	N	Q	L	G	A	R	Q	G	A	G	A	V	Y	L	H	A	H	H	P	D	I	L	R	F	L	D	T	K	R	E	N	A	D	E	K	I	R	I	K	T
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	G	S	N	F	S	E	L	R	P	K	G	S	F	V	A	G	T	H	G	K	A	S	G	P	V	S	F	M	H	V	F	N	S	A	I	S	V	V	K	Q	G	S	R	R	R	G	A	L	M	G	I	L	N	I	N	H	P	D	I	E	E	F	I	D	A	K	K	.	.	.	.	.	.	.	V	L	N	F
Template Known Secondary structure								T	T	S			T	T				T	T	T	T																		T	T				T	T	T											T	T	S	T	T						T	S			.	.	.	.	.	.	.			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230								.	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.				.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.
Query Sequence		L	S	L	G	V	V	I	.	.	.	P	D	I	T	F	H	L	A	K	E	N	A	Q	M	A	L	F	S	P	Y	D	V	E	R	V	Y	G	K	P	F	A	D	V	A	I	S	Q	H	Y	D	E	L	V	A	D	E	R	I	R	K	K	Y	L	N	A	R	D	F	F	Q	R	L	A	E	I	Q	F	E	S	G
Query Conservation									.	.	.
Alig confidence									.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	L	S	V	G	F	P	M	D	K	K	E	I	L	K	L	Y	E	E	D	G	E	L	E	L	S	H	P	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	R	K	K	V	K	I	R	E	L	F	R	K	I	A	T	N	A	W	K	S	G
Template Known Secondary structure										S											T	T								T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																						S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.			380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.						.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	Y	I	M	Y	E	D	T	V	N	R	A	N	P	I	A	.	.	G	R	I	N	M	S	N	L	C	S	E	I	L	Q	V	N	S	A	S	E	Y	D	E	N	L	D	Y	T	R	T	G	H	D	I	S	C	N	L	G	S	L	N	I	A	H	T	M	.	.	.	.	.	D	S	P	D	F	A	R	T	V
Query Conservation																			.	.																																																.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	G	L	A	F	L	G	E	M	N	K	Y	Y	P	L	Y	P	H	R	K	I	N	S	T	N	P	C	G	E	I	G	L	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	A	C	N	L	G	S	I	D	V	A	K	F	Y	N	N	G	F	V	D	L	E	A	L	Q	E	L	V
Template Known Secondary structure														T		T	T	T	T	T	S							T	T	S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T										G	G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	A	V	R	G	L	T	A	V	S	D	M	S	H	I	R	S	V	P	S	I	E	A	G	N	A	A	S	H	A	I	G	L	G	Q	M	N	L	H	G	Y	L	A	R	E	G	I	A	Y	G	S	P	E	A	L	D	F	T	N	L	Y	F	Y	A	I	T	W	H	A	L	R	T	S	M	L	L	A	R	E
Query Conservation
Alig confidence																		.
Template Conservation																		.
Template Sequence		Q	I	A	V	R	F	L	D	N	V	I	D	V	N	V	F	.	P	I	D	K	I	T	K	A	V	K	E	S	R	R	L	G	L	G	I	M	G	F	A	D	L	L	Y	K	L	E	I	P	Y	N	S	Q	E	A	R	D	F	A	A	N	L	M	A	F	I	A	L	H	A	H	R	T	S	Y	E	L	G	K	E
Template Known Secondary structure																		.	S	S																												T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.		.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	E	T	F	A	G	F	K	Q	S	R	Y	A	S	G	E	Y	F	S	Q	Y	L	Q	G	N	W	Q	P	K	T	A	K	V	G	E	L	F	T	R	S	G	I	T	L	P	T	R	E	M	W	A	Q	L	R	D	D	V	M	R	Y	G	I	Y	N	Q	N	L	Q	A	V	P	P	T	G	S	I	S	Y	I
Query Conservation
Alig confidence				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	.	N	F	P	L	L	E	I	S	R	Y	R	T	E	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	P	F	A	M	G	M	S	N	Y	D	D	E	I	R	E	V	M	K	M	T	K	E	F	R	R	N	V	A	L	L	T	I	A	P	T	G	S	I	S	N	I
Template Known Secondary structure				.			T	T	G	G	G	S					S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S				S		T	T											T	T	T			S		S			B		B				T	T
Template Predicted Secondary structure				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		438	.		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	H	A	T	S	S	I	H	P	I	V	A	K	V	E	I	R	K	E	G	K	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	Y	Y	P	A	P	F	M	T	N	E	N	L	A	L	Y	Q	D	A	Y	E	I	G	A
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	T	S	S	G	L	E	P	N	F	L	L	A	Y	T	R	F	V	T	K	E	D	G	T	K	E	P	L	L	Y	V	N	Q	V	L	R	E	K	L	N	P	E	I	L	K	R	I	E	K	E	L	I	E	K	G	S	L	K	D	I	P	D	V	P	E	K	I	K	K	V	F	V	V	A	L	D	I	D	P
Template Known Secondary structure		T	T	S			T	T				S		S									S	S	S																S																S	S	S	T	T		T	T	S								S			G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
		644	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	I	I	D	T	Y	A	E	A	T	R	H	V	D	Q	G	L	S	L	T	L	F	F	P	D	T	A	T	T	R	D	I	N	K	A	Q	I	Y	A	W	R	K	G	I	K	T	L	Y	Y	I	R	L	R	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	D	H	L	L	M	Q	D	A	F	Q	R	Y	V	D	N	N	I	S	K	T	I	N	M	P	Q	S	A	T	V	D	D	V	L	N	V	Y	L	E	A	L	R	T	N	V	R	G	I	T	V	Y	R	D	G	S
Template Known Secondary structure													T	T		S	S		B								T	T																S	S		S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.