Job Description P21888 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:38 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 305 % Identity 20% Template d1h3na3 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.0

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		2	.	.	.	.	.	.	.										10	.	.	.	.	.	.	.			.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.													.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.													.	.
Query Sequence		L	K	I	F	N	T	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	K	E	E	F	K	P	.	.	I	H	A	G	E	V	G	M	Y	V	C	G	.	.	I	T	V	Y	D	L	C	H	I	G	H	G	R	T	F	V	A	F	D	V	V	A	R	Y	L	R	F	L	G	Y	K	L	K	Y	V	R	N	I	T
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.													.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.													.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	E	K	Y	N	P	H	A	I	E	A	K	W	Q	R	F	W	E	E	K	G	F	M	K	A	K	D	L	P	G	G	R	G	K	Q	Y	V	L	V	M	F	P	Y	P	S	G	D	L	H	M	G	H	L	K	N	Y	T	M	G	D	V	L	A	R	F	R	R	M	Q	G	Y	E	V	L	H	P	M	G	W	D
Template Known Secondary structure								T	T													T	T	T				S	S			T	T												S	S	S			B																				T	T									B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.		.	110	.	.	.	.	.	.			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.									.	.
Query SS confidence																																										.									.	.
Query Sequence		D	I	D	D	K	I	I	K	R	A	N	E	N	G	E	S	F	V	A	M	V	D	R	M	I	A	E	M	H	K	D	F	D	A	L	N	I	L	R	P	.	D	M	E	P	R	A	T	H	.	.	H	I	A	E	I	I	E	L	T	E	Q	L	I	A	K	G	H	A	Y	V	A	D	N	G	D	V	M	F	D
Query Conservation																																										.									.	.
Alig confidence																																										.									.	.																												.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		A	F	G	L	P	A	E	N	A	A	L	K	F	G	V	H	P	K	D	W	T	Y	A	N	I	R	Q	A	K	E	S	L	R	L	M	G	I	L	Y	D	W	D	R	E	V	T	T	C	E	P	E	Y	Y	R	W	N	Q	W	I	F	L	K	M	W	E	K	G	L	A	Y	R	A	K	G	L	V	N	W	.	.
Template Known Secondary structure			S	S										T	T																					T	T					G	G	G			B	T	T	S																	T	T												.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	T	D	P	T	Y	G	V	.	L	S	R	Q	D	L	D	Q	L	Q	A	G	A	R	V	D	V	V	D	D	K	R	N	P	M	D	F	V	L	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	M	S	K	E	G	E	P	S	W	P
Query Conservation											.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.							.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	C	P	K	C	Q	T	V	L	A	N	E	Q	V	V	E	G	R	C	W	R	H	E	D	T	P	V	E	K	R	E	L	E	Q	W	Y	L	R	I	T	A	Y	A	E	R	L	L	K	D	L	E	G	L	N	W	P	E	K	V	K	A	M	Q	R	A	W	I	G	R	L	R	D	W	L	I	S	R	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.		T	T	T	T					G	G	G			T	T			S	S		T	T	S	B													G	G	G	G							T	T	T	T		B	S																							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	P	W	G	A	G	R	P	G	W	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	Y	W	G	T	P	I	P	M	V	H	C	E	A	C	G	V	V	P	V	P	E	E	E	L	P	V	L	L	P	D	L	K	D	V	E	D	I	R	P	K	G	K	S	P	L	E	A	H	P	E	F	Y	E	T	T	C	P	K	C	G	G	P	A	K	R	D	T	D	T	M	D	T	F	F	D	S	S	W	Y
Template Known Secondary structure			S	S	S									T	T	T							G	G	G															S		S	S	S		G	G	G	G										T	T	T		S															T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
														207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.				.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	C	S	A	M	N	C	K	Q	L	G	N	H	F	D	I	H	G	G	G	S	D	L	M	F	P	H	H	E	N	.	.	.	E	I	A	Q	S	T	C	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.
Template Sequence		Y	L	R	Y	T	D	P	H	N	D	R	L	P	F	D	P	E	K	A	N	A	W	M	P	.	.	V	D	Q	Y	I	G	G	V	E	H	A	V	L	H	L	L	Y	S	R	F	F	T	K	F	L	H	D	L	G	M	V	K	V	E	E	P	F	Q	G	L	F	T	Q	G	M	V	L	A	W	T	D	F	G	P
Template Known Secondary structure					T	T	S	T	T		S	S	S	S	S										S	.	.	B	S						G	G	G	T	T	T															T	T	S		S		S		S	B	S	B
Template Predicted Secondary structure																										.	.
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.			.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
																																		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	Y	V	N	Y	W	M	H	S	G	M	V	M	V	D	R	E	K	M	S	K	S	L	G	N	F	F	T	V	R	D	V	L	K	Y	Y	D	A	E	T	V	R	Y	F	L	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	V	E	G	S	V	V	R	L	P	E	P	T	R	I	R	L	E	I	P	E	S	A	L	S	L	E	D	V	R	K	M	G	A	E	L	R	P	H	E	D	G	T	L	H	L	W	K	P	A	V	M	S	K	S	K	G	N	G	V	M	V	G	P	F	V	K	E	Q	G	A	D	I	A	R	I	T	I	L
Template Known Secondary structure						T	T													T		S		S										T	T							T	T	S	S											T	T	T	T				B								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.
		295		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure			.
Query SS confidence			.
Query Sequence		S	.	G	H	Y	R	S	Q	L	N	Y	S	E	E	N	L	K	Q	A	R
Query Conservation			.
Alig confidence			.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	A	P	P	E	N	E	M	V	W	T	E	E	G	V	Q	G	A	W
Template Known Secondary structure				S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		666	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.