Job Description P75919 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:16:03 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 288 % Identity 18% Template c1xdoB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:polyphosphate kinase; PDBTitle: crystal structure of escherichia coli polyphosphate kinase Resolution 3.00 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.						.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.			.	.	.	90	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																													.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.																																													.	.
Query Sequence		F	P	L	E	K	S	L	D	A	F	A	A	R	Y	R	L	A	E	M	A	E	.	.	.	.	.	H	T	L	D	V	Q	Y	Y	I	W	Q	D	D	M	S	G	R	L	L	F	S	A	L	L	A	A	A	K	R	G	V	R	V	R	L	L	L	D	D	N	N	T	P	G	.	.	L	D	D	I	L	R	L	L
Query Conservation																							.	.	.	.	.																																													.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.														.	.	.																													.	.
Template Conservation																																									.	.	.
Template Sequence		V	L	L	Y	Y	P	Y	H	T	F	E	H	V	L	E	L	L	R	Q	A	S	F	D	P	S	V	L	A	I	K	I	N	I	Y	R	V	A	K	D	.	.	.	S	R	I	I	D	S	M	I	H	A	A	H	N	G	K	K	V	T	V	V	V	E	L	Q	A	R	F	D	E	E	A	N	I	H	W	A	K	R
Template Known Secondary structure						T	T	T	B		T											T	T		T	T									S	S			S	S	.	.	.													T										S			S	S			G	G	G	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.				380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140								.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	H	P	R	I	E	V	R	L	F	N	P	F	S	F	R	L	L	R	P	L	G	Y	I	T	D	F	S	R	L	N	R	R	M	H	N	K	S	F	T	V	D	G	V	V	.	.	.	.	.	.	.	T	L	V	G	G	R	N	I	G	D	A	Y	F	G	A	G	E	E	P	L	F	S	D	L	D	V	M
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	E	A	G	V	H	V	I	F	S	A	P	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	H	A	K	L	F	L	I	S	R	K	E	N	G	E	V	V	R	Y	A	H	I	G	T	G	N	F	N	E	K	T	A	.	.	.	.	.	R	L	Y	T	D	Y	S	L	L
Template Known Secondary structure						T								T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B												T	T										S	S		S		T	T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.						.	.	.	.	470	.	.	.	.
		168	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		A	I	G	P	.	V	V	E	D	V	A	D	D	F	A	R	Y	W	Y	C	K	S	V	S	P	L	Q	Q	V	L	D	V	P	E	G	E	M	A	D	R	I	E	L	P	A	S	W	H	N	D	A	M	T	H	R	Y	L	R	K	M	E	S	S	P	F	I	N	H	L	V	D	G	T	L	P	L	I	W	A	K
Query Conservation						.
Alig confidence						.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	D	A	R	I	T	N	E	V	R	R	V	F	N	F	I	E	N	P	Y	R	P	V	T	F	D	Y	L	M	V	S	P	Q	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																					T	T	S					S	S					T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280				.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.											.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	L	L	S	D	D	P	A	K	G	E	G	K	A	K	R	H	S	L	L	P	Q	R	L	F	D	I	M	G	S	P	S	E	.	.	.	R	I	D	I	I	S	S	Y	F	V	P	T	R	A	G	V	A	Q	L	L	R	M	V	R	K	G	V	K	I	A	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Query Conservation																																				.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	R	L	L	Y	E	M	V	D	R	E	I	A	N	A	Q	Q	G	L	P	S	G	I	T	L	K	L	N	N	L	V	D	K	G	L	V	D	R	L	Y	A	A	S	S	S	G	V	P	V	N	L	L	V	R	G	M	C	S	L	I	P	N	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																T	T	T										S		B															T	T								S	S		B				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.				.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.
Query Sequence		N	S	L	A	A	N	D	V	A	V	V	H	A	G	Y	A	R	W	R	K	K	L	L	R	Y	G	V	E	L	Y	E	L	K	P	T	R	E	Q	S	S	T	L	H	D	R	G	I	T	G	N	S	G	A	S	L	H	A	K	T	F	S	I	.	.	.	D	G	K	T	V	F	I	G	S	F	N	F	D	P	R
Query Conservation																																																																.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	I	S	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	A	I	S	I	V	D	R	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	D	R	V	Y	I	F	E	N	G	G	D	K	K	V	Y	L	S	S	A	D	W	M	T	R
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	S							S			B	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		574	.	.	.	.	.																					580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	L	L	N	T	E	M	G	F	V	I	E	S	E	T	L	A	Q	L	I	D	K	R	F	I	Q	S	Q	Y	D	A	A	W	Q	L	R	L	D	R	W	G	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	I	D	Y	R	I	E	V	A	T	P	L	L	D	P	R	L	K	Q	R	V	L	D	I	I	D	I	L	F	S	D	T	V	K	A	R	Y	I	D	K	E	L	S
Template Known Secondary structure					T	S	B								S																T		S	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		617	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.