Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 60 Aligned Residues 352 % Identity 17% Template d3bmva4 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.60

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	.	.	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	T	D	V	I	Y	Q	I	V	T	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	T	G	D	L	Y	D	P	T	H	T	S	L	K	K	Y	F	G	G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	P	Q	P	V	E	N	I	Y	A	V	L	P	D	S	T	F
Template Known Secondary structure		T	T								G	G	G	T					G	G	G	S			G	G	G	B		T	T	S		S	T	T	S	B														T	S	T	T	G	G	G	T																				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
				50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Sequence		G	G	S	T	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	N	P	Y	F	G	S	F	T	D	F	Q	N	L	I	N	T	A	H	A	H	N	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	.	.	P	A	S	E	T	D	P	T	Y	A	E	N	G	R	L	Y	D	N
Template Known Secondary structure						S	T	T	S		S						.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T																T	T									T	T				.	.				S	S		T	T	S	T	T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.										.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.			.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	L	L	G	G	Y	T	N	D	T	N	G	Y	F	H	H	Y	G	G	T	D	F	S	S	Y	E	D	G	I	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	F	D	L	A	D	L	N	Q
Template Known Secondary structure		T						S	T	T		T	T			B			S		B				S	S							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S	T	T				B		T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270		.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.
Query SS confidence																																																																	.
Query Sequence		R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	.	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M
Query Conservation																																																																	.
Alig confidence																			.																																	.	.												.
Template Conservation																			.																																	.	.
Template Sequence		Q	N	S	T	I	D	S	Y	L	K	S	A	I	K	V	W	L	.	D	M	G	I	D	G	I	R	L	D	A	V	K	H	M	P	F	G	W	Q	K	N	F	M	D	S	I	L	S	Y	R	P	.	.	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	T	N	E	I	D	V	N	N	T	Y	F	A	N	E	S	G	M	S
Template Known Secondary structure		T	S																.		T	T							S		G	G	G	S																S		.	.											T	T													S	S	S
Template Predicted Secondary structure																			.																																	.	.
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.			.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.				.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.
Query Sequence		L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P
Query Conservation																							.	.	.
Alig confidence																							.	.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.
Template Sequence		L	L	D	F	R	F	S	Q	K	V	R	Q	V	F	R	D	N	T	D	T	M	Y	G	L	D	S	M	I	Q	S	T	A	S	D	Y	N	F	I	N	D	M	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D	R	F	Y	N	G	G	S	T	.	.	.	.	R	P	V	E	Q	A	L	A	F	T	L	T	S	R	G	V	P
Template Known Secondary structure			B													T	S		S	S																	T	T	G	G	G					S			S	S	S			S			S	S		S	.	.	.	.													S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.					340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.				.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.
Query Sequence		S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V
Query Conservation																										.	.	.
Alig confidence																										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	G	N	G	D	P	Y	N	R	A	M	M	T	S	F	N	T	S	T	T	A	Y	N	V	I	K	K	L	A	P	L	R	K	S	N	P	A	I	A
Template Known Secondary structure					T	T	G	G	G	T					S	T	T	G	G	G								T	T	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.