Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 72 Aligned Residues 339 % Identity 22% Template d1wzla3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.00

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.
Template Sequence		K	E	A	V	I	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	P	P	G	T	E	Q	W	A	K	D	A	R	P	R	H	D	S	F	Y	G	G	D	L	K	G	V	I	D	R	L	P	Y	L	E	E	L	G	V	T	A	L	Y	F	T	P	I	F	A	S	P	S	.	.	.	H	H	K	Y	D
Template Known Secondary structure		G	G								G	G	G	T					G	G	G			T	T						T	T					T	T													T								T													S	S	.	.	.	S	S			S
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.	.	.
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Sequence		T	A	D	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	D	P	Q	F	G	D	L	P	T	F	R	R	L	V	D	E	A	H	R	R	G	I	K	I	I	L	D	A	V	F	N	H	A	G	.	.	D	Q	F	F	A	F	R	D	V	L	Q	K	G	E	Q	S	R	Y	K	D	W	F	F	I	E	D	F	P
Template Known Secondary structure			S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T															T	T	T										S	B			.	.	T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B		B	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210										.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.			.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	K	T	S	R	T	N	Y	E	T	F	A	V	Q	V	P	A	M	P	K	L	R	T	E	N	P	E	V	K	E	Y	L	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S			S	B		B	S	S	S	S		T	T		B	B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H
Query Conservation
Alig confidence									.																																	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation									.																																	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	A	R	F	W	M	.	E	Q	G	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	V	D	H	A	F	W	R	E	F	R	R	L	V	K	S	L	N	P	.	D	A	L	I	V	G	E	I	W	H	D	A	S	G	W	L	M	G	.	.	.	.	.	D	Q	F	D	S	V	M	N	Y	L	F	R	E	S	V	I
Template Known Secondary structure									.		T	T							T	T	G	G	G	S																	T	.	T								S	S			G	G	G		S	S	.	.	.	.	.	S	S		S			B
Template Predicted Secondary structure									.																																	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.		.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.						.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.						.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G
Query Conservation												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																																				.	.
Template Sequence		R	F	F	A	T	G	E	I	H	A	E	R	F	D	A	E	L	T	R	A	R	M	L	Y	P	E	Q	A	A	Q	G	L	W	N	L	L	D	S	H	D	T	E	R	F	L	T	S	C	G	G	.	.	N	E	A	K	F	R	L	A	V	L	F	Q	M	T	Y	L	G	T	P	L	I	Y	Y	G	D	E	I	G
Template Known Secondary structure					T	S			S														T	T	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T	.	.															S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.						390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.
Query Sequence		A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	.	.	.	.	.	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	A	G	A	T	D	P	D	C	L	R	P	M	I	W	E	E	K	E	Q	N	R	G	L	F	E	F	Y	K	E	L	I	R	L	R	H	R	L	A	S	L	T
Template Known Secondary structure						S	T	T	G	G	G							G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.