Job Description P26612 Confidence 98.08% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 128 Aligned Residues 311 % Identity 15% Template d1tz7a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.15

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.																																																										.	.	.	.
Query SS confidence																				.																																																										.	.	.	.
Query Sequence		P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	.	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	.	.	.	.
Query Conservation																				.																																																										.	.	.	.
Alig confidence																				.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	L	L	H	V	T	S	L	P	S	P	Y	G	I	G	D	L	G	K	E	A	Y	R	F	L	D	F	L	K	E	C	G	F	S	L	W	Q	V	L	P	L	N	P	T	S	L	E	A	G	N	S	P	Y	S	S	N	S	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	N	Y	V	L	I	D	P	E	E
Template Known Secondary structure							G	G	G	S			S	S	S	S			S	S														T										S				G	G	G	T	T		T	T	S		S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			G	G	G	S		T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.										.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	E	E	D	L	I	K	E	R	D	L	K	R	F	P	L	G	E	A	L	Y	E	V	V	Y	E	Y	K	K	E	L	L	E	K	A	F	K	N	F	R	R	F	E	L	L	E	D	F	L	K	E	H	S	Y	W	L	R	D	Y	A	L	Y	M	A	I	K	E	E	E	G	K	E	W	Y	E	W	D	E	E
Template Known Secondary structure					T	T	S	S		G	G	G						S		S																				T														T																			S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
																															79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	R	R	E	K	E	A	L	K	R	V	L	N	K	L	K	G	R	F	Y	F	H	V	F	V	Q	F	V	F	F	K	Q	W	E	K	L	R	R	Y	A	R	E	R	G	I	S	I	V	G	D	L	P	M	Y	P	S	Y	S	S	A	D	V	W	T	N	P	E	L	F	K	L	D	G	D	L	K	P	L	F
Template Known Secondary structure				T	T												T																												T	T									S	S			S	S	S							G	G	G	B		B		T	T	S		B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
				125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	G	V	P	P	D	F	F	S	K	T	G	Q	L	W	G	N	P	V	Y	N	W	E	E	H	E	K	E	G	F	R	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S	S	S	S	S									B								T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																																	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	I	R	R	V	L	H	N	L	K	.	.	L	F	D	F	L	R	L	D	H	F	R	G	F	E	A	Y	W	E	V	P	Y	G	E	E	T	A	V	N	G	R	W	V	K	A	P	G	K	T	L	F	K	K	L	L	S	Y	F	P	.	K	N	P	F	I	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	.	.	T		S					T	T	G	G	G	G	T							T	T		S	S	S	T	T																			S	T	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																																	.
Template SS confidence
															269	270	.	.	.	.	.	.	.	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.		.	.	.	330	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	L	G	F	I	T	D	E	V	R	Y	L	R	E	T	F	K	I	P	G	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	E	F	A	F	Y	D	K	E	.	.	.	.	.	.	S	E	H	L	P	H	N	V	E	E	N	N	V	Y	Y	T	S	T	H	D	L	P	P	I	R	G	W	F	E	N	L	G
Template Known Secondary structure					S	S												T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	T	T	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.		T	T	S	G	G	G			S	S					S			T	T	S									T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.										.	.	.	.	360	.	.	.	.	.							.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
												339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.								.	.	.	370	.			.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.						.	.																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.						.	.																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	D	L	Y	.	.	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	.	P	I	I	E	Q	L	D	E	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.						.	.																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.						.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		E	E	S	R	K	R	L	F	E	Y	L	G	R	E	I	K	E	E	K	V	N	E	E	L	I	R	L	V	L	I	S	R	A	K	F	A	I	I	Q	M	Q	D	L	L	N	L	G	N	E	A	R	M	N	Y	P	G	R	P	F	G	N	W	R	W	R	I	K	E	D	Y	T	Q	K	K	E	F	I	K	K	L
Template Known Secondary structure													T	S				G	G	G												S			S										T	T			G	G	G					T	T			S	S		S						S		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
		399	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	G	I
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		478	.	480