Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 97 Aligned Residues 350 % Identity 17% Template d1r7aa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.77

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K
Query Conservation
Alig confidence																.	.																																				.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.																																				.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	N	K	V	Q	L	I	T	Y	A	D	R	L	.	.	G	D	G	T	I	K	S	M	T	D	I	L	R	T	R	F	D	G	V	Y	D	G	V	H	I	L	P	F	F	T	P	F	D	G	A	.	D	A	G	F	D	P	I	D	H	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	D	E	R	L	G	S	W
Template Known Secondary structure				S	S							S	S	S	B	.	.	S	S	S	S												S	T	T	T													S	S	S	S	.	S	T	T	S	S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.																																				.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.			.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.										60	.	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.																.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.																.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	D	V	A	E	L	S	.	.	.	.	.	K	T	H	N	I	M	V	D	A	I	V	N	H	M	S	.	.	W	E	S	K	Q	F	Q	D	V	L	A	K	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	E	Y	Y	P	M	F	L	T	M	S	S	V
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	T	T	S									S				.	.	T	T	S										G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	T	T	G	G	G	B		B
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.																.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90			.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.
Template Conservation																																																																		.
Template Sequence		F	P	N	G	A	T	E	E	D	L	A	G	I	Y	R	P	R	P	G	L	P	F	T	H	Y	K	F	A	G	K	T	R	L	V	W	V	S	F	T	P	Q	Q	V	D	I	D	T	D	S	D	K	G	W	E	Y	L	M	S	I	F	D	Q	M	A	.	A	S	H	V	S	Y	I	R	L	D	A	V	G	Y	G
Template Known Secondary structure			T	T									T	S			S	S	S	S		S							T	T								S	S	S	T	T				B		T	T	S																.		T	T								T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																																		.
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		241														.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.																					.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.																					.	.	.	.
Template Sequence		A	K	E	A	G	T	S	C	F	M	T	P	K	T	F	K	L	I	S	R	L	R	E	E	G	V	.	.	.	K	R	G	L	E	I	L	I	E	V	H	S	Y	Y	K	K	Q	V	E	I	.	.	.	.	A	S	K	V	D	R	V	Y	D	F	A	L	P	P	L	L	L	H	A	L	S	T	G	H	V	E	P
Template Known Secondary structure					T	T	S		S	S	S																	.	.	.		T	T									S									.	.	.	.		T	T	S	S						S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.																					.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.				.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.					.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	H	W	T	D	I	R	.	.	.	.	.	P	N	N	A	V	T	V	L	D	T	H	D	G	I	G	V	I	D	I	G	S	D	Q	L	D	R	S	L	K	G	L	V	P	D	E	D	V	D	N	L	V	N	T	I	H	A	N	T	H	G	E	S	Q	A	A	T	G	A	A	A	S	N	L	D	L	Y	Q
Template Known Secondary structure									S	.	.	.	.	.		S	S					S			S	S		B		S	T	T	T	S			S	S		T	T	S			S	S																T	T	T						S	G	G	G	S	B		S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.						.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
														347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.										.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.								.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	.	.	.	.	.	.	.	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	S	T	Y	Y	S	A	L	G	N	D	Q	H	Y	I	A	A	R	A	V	Q	F	F	L	P	G	V	P	Q	V	Y	Y	V	G	A	L	A	G	K	N	D	M	E	L	L	R	K	T	N	N	G	R	D	I	N	R	H	Y	Y	S	T	A	E	I	D	E	N	L	K	R	P	V	V	K	A	L	N	A	L
Template Known Secondary structure		B		S						T																S	S	S										T	T													B	G	G	G	G	G				B									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	A	R	Q	R	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	K	F	R	N	E	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.