Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 89 Aligned Residues 350 % Identity 19% Template d1lwha2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.60

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	Y	V	R	S	F	R	D	G	N	L	D	G	V	G	D	F	R	G	L	K	N	A	V	S	Y	L	K	E	L	G	I	D	F	V	W	L	M	P	V	F	S	S	I	S	.	.	.	F	H	G	Y	D	V	V	D	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	K	A	E	Y	G	S	E	R	E	F
Template Known Secondary structure					G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T							T	T		S											S	S	.	.	.	S	S			S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50				.	.	.	.	.	.	.	.	.	60										.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I
Query Conservation
Alig confidence																										.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	M	I	E	A	F	H	D	S	G	I	K	V	V	L	D	L	P	I	H	H	T	G	.	.	F	L	H	T	W	F	Q	K	A	L	K	G	D	P	H	Y	R	D	Y	Y	V	W	A	N	K	E	T	D	L	D	E	R	R	E	W	D	G	E	K	I	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T									T	T	B			.	.	T	T	S								T	T						T	T	B		B			T	T			T	T		B		S	S	S			B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.			.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	L	E	D	G	R	F	Y	R	G	L	F	G	P	F	S	P	D	L	N	Y	D	N	P	Q	V	F	D	E	M	K	R	L	V	L	H	L	L	.	D	M	G	V	D	G	F	R	F	D	A	A	K	H	M	R	D	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S						T	T		T	T	S		B	B		T	T	S																.			T							T	T	G	G	G	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template SS confidence
																								138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.																																						.
Template Conservation																																			.	.	.	.																																						.
Template Sequence		I	E	Q	N	V	R	F	W	K	Y	F	L	S	D	L	K	G	I	F	L	A	E	I	W	A	E	A	R	M	V	D	E	H	.	.	.	.	G	R	I	F	G	Y	M	L	N	F	D	T	S	H	C	I	K	E	A	V	W	K	E	N	T	R	V	L	I	E	S	I	E	R	A	V	I	.	A	K	D	Y	L
Template Known Secondary structure														T	T			S								S		S	S	S					.	.	.	.																							T		T											T	S	.	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.					.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.					.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	.	.	.	.	G	Q	T	Y	P	I	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.																											.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		P	V	N	F	T	S	N	H	D	M	S	R	L	A	S	F	E	G	G	F	S	K	E	K	I	K	L	S	I	S	I	.	L	F	T	L	P	G	V	P	L	V	F	Y	G	D	E	L	G	M	K	G	V	Y	Q	K	P	N	T	E	V	V	L	D	P	F	P	W	N	E	S	M	C	V	E	G	Q	T	F	W
Template Known Secondary structure						S			T	T	S			G	G	G	G	G	G														.		T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S		G	G	G	G	S					S	S	T	T	S		S	T	T				S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
																								390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	W	P	A	Y	N	G	P	F	S	G	I	S	V	E	Y	Q	K	R	D	P	D	S	I	L	S	H	T	L	G	W	T	R	F	R	K	E	N	Q	W	I	D
Template Known Secondary structure		S			S	S			S	S	S	S		S					T	T		T	T	S														T		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390