Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 64 Aligned Residues 351 % Identity 13% Template d1hx0a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.38

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.						.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	.	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	.	.	.	.	.	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K
Query Conservation																												.																									.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.									.																									.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	T	S	I	V	H	L	F	E	W	R	.	.	.	.	.	.	.	W	V	D	I	A	L	E	C	E	R	Y	L	G	P	K	G	F	G	G	V	Q	V	S	P	P	N	E	N	I	V	V	T	N	P	S	R	P	W	W	E	R	Y	Q	P	V	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	C	T	R
Template Known Secondary structure									T	T			.	.	.	.	.	.	.											T	T	T	T	T	T										S		B	B			T	T	T	T	S		G	G	G	G	G	S	B	S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		B	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20								.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.											.	.	70	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	N	E	N	E	F	R	D	M	V	T	R	C	N	N	V	G	V	R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	C	G	S	G	A	A	A	G	T	G	T	T	C	G	S	Y	C	N	P	G	N	R	E	F	P	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	B															T	T										S					T	T				B	S		B	S	S				B	B	G	G	G	T	B	B	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	S	A	W	D	F	N	D	G	K	C	K	T	A	S	G	G	I	E	S	Y	N	D	P	Y	Q	V	R	D	C	Q	L	V	G	L	L	D	L	A	L	E	K	D	Y	V	R	S	M	I	A	D	Y	L	N	K	L	I	.	D	I	G	V	A	G	F	R	I	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B		G	G	G	B		T	T	T			S	T	T	S	B				T	T								S	B	G	G	G				B		T	T	S																.			T							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.
Template SS confidence
												130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.							.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	.	.	.	.	.	.	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																																																				.	.
Template Sequence		S	K	H	M	W	P	G	D	I	K	A	V	L	D	K	L	H	N	L	N	T	N	W	F	P	A	G	S	R	P	F	I	F	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	A	I	K	S	S	E	Y	F	.	.	G	N	G	R	V	T	E	F	K	Y	G	A	K	L	G	T	V	V	R	K	W	S	G	E	K	M	S	Y
Template Known Secondary structure		G	G	G	S										T	T						T	T	T	S		T	T													S	S	S	S	S		G	G	G	G	T	.	.	T	T	S																T	T		T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.			.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		311	.	.			.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.						.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																														.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																														.	.	.	.	.
Query Sequence		I	F	T	.	.	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	.	.	.	.	.	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q
Query Conservation					.	.																														.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	N	W	G	E	G	W	G	F	M	P	S	D	R	A	L	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	G	H	G	A	G	G	S	S	I	L	T	F	W	D	A	R	L	Y	K	I	A	V	G	F	M	L	A	H	P	Y	G	F	T	R	V	M	S	S	Y	R	W	A	R	N	F	V	N	G	E	D	V	N	D
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	G	G	G	T				G	G	G					S			T	T	G	G	G	T		S	S		G	G	G				G	G	G														S		S	S								B								T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		384	.																								.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	I	G	P	P	N	N	N	G	V	I	K	E	V	T	I	N	A	D	T	T	C	G	N	D	W	V	C	E	H	R	W	R	E	I	R	N	M	V	W	F	R	N	V	V	D
Template Known Secondary structure		T			S	S			T	T							B		T	T	S		B		T	T	B			G	G	G	S													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.