Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 81 Aligned Residues 352 % Identity 18% Template d1h3ga3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.1

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		2	.	.	.	.	.	.	.					10	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query SS confidence										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query Sequence		R	N	P	T	L	L	Q	C	.	.	.	.	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	.	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D
Query Conservation										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Alig confidence										.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	D	A	I	Y	Q	I	X	P	D	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	N	V	A	G	X	R	E	Q	A	D	R	R	H	G	G	G	R	H	G	G	D	I	R	G	T	I	D	H	L	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T	P	L	V	E	N	D	A	A	A	Y	S	Y	H	G	Y	A
Template Known Secondary structure		T	T														S		G	G	G	S	S		T	T		S	S				T	T	S	T	T	S												T								T															S	S		G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.																										.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.																										.	.	.
Template Sequence		A	T	D	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	D	P	R	Y	G	S	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	X	G	L	I	Q	D	V	V	L	S	H	I	G	.	.	K	H	H	W	W	X	K	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	G	K	F	V	P	T	Q	.	.	.
Template Known Secondary structure			S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T																T	T										S	B			.	.	T	T	S	G	G	G	G	S		S	S	T	T	S	B	S			S	S			B			.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		185	.	.	.	.										190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	H	R	V	A	V	Q	D	P	Y	A	A	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	X	P	D	L	N	Q	T	N	P	L	V	A	N	Y	L	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G	G	S		T	T												S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																							251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.								.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	.	.	.	.	.	.	.	T	M	L	F	D	A
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		Q	N	N	I	W	W	I	E	Y	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	X	A	E	Y	P	.	R	L	N	X	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	H	L	P	S	L	X	D	F
Template Known Secondary structure												T		S					T	T	G	G	G	S																	T	.	T										S							T	T	S	T	T				T	T										B
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.					.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.
Query Sequence		P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F
Query Conservation																			.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																																										.	.
Template Sequence		P	L	V	D	A	X	R	N	A	L	S	K	T	G	E	E	N	G	L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	P	Q	N	L	V	L	F	G	G	N	H	D	X	A	R	X	F	S	A	A	G	E	.	.	D	F	D	R	W	R	X	N	L	V	F	L	X	T	X	P	R	I	P	Q	F	Y
Template Known Secondary structure														T	T		S	S	T	T									G	G	G	G	S	S	S	G	G	G	S				S			T	T	S							T	T	S	.	.															S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.
Template SS confidence
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.			.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	D	E	I	L	X	T	S	T	V	K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S	G	A	G	L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q	P	V
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	T						S	S	S		G	G	G	G	S				T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T		T	T																				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.