Job Description P26612 Confidence 97.95% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 131 Aligned Residues 275 % Identity 19% Template d1eswa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.90

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.																																																										.	.	.	.
Query SS confidence																				.																																																										.	.	.	.
Query Sequence		P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	.	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	.	.	.	.
Query Conservation																				.																																																										.	.	.	.
Alig confidence																				.																										.	.																															.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.
Template Sequence		G	L	L	L	H	P	T	S	L	P	G	P	Y	G	V	G	V	L	G	R	E	A	R	D	F	L	R	F	L	K	E	A	G	G	R	Y	W	Q	V	L	P	L	G	P	.	.	T	G	Y	G	D	S	P	Y	Q	S	F	S	A	F	A	G	N	P	Y	L	I	D	L	R	P	L	A	E	R	G	Y	V	R	L
Template Known Secondary structure							G	G	G	S			S	S	S	S			S	S													T	T										S		.	.	B		T	T			T	T	S	B	S		S	S				G	G	G			S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.			.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	D	P	G	F	P	Q	G	R	V	D	Y	G	L	L	Y	A	W	K	W	P	A	L	K	E	A	F	R	G	F	K	E	K	A	S	P	E	E	R	E	A	F	A	A	F	R	E	R	E	A	W	W	L	E	D	Y	A	L	F	M	A	L	K	G	A	H	G	G	L	P	W	N	R	W	P	L	P	L	R	K
Template Known Secondary structure								S	S	B																																																									T	T	T			G	G	G	S						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
																												79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.								.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	.	.	.	.	.	.	.	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	E	K	A	L	R	E	A	K	S	A	L	A	E	E	V	A	F	H	A	F	T	Q	W	L	F	F	R	Q	W	G	A	L	K	A	E	A	E	A	L	G	I	R	I	I	G	D	M	P	I	F	V	A	E	D	S	A	E	V	W	A	H	P	E	W	F	H	L	D	E	E	G	R	P	T	V	V	A	G
Template Known Secondary structure		T												T																												T	T									S	S			S	S	S							G	G	G	B		B		T	T	S		B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	P	P	D	Y	F	S	E	T	G	Q	R	W	G	N	P	L	Y	R	W	D	V	L	E	R	E	G	F	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	S		S	S									B								T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																																	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	I	R	R	L	E	K	A	L	E	.	.	L	F	H	L	V	R	I	D	H	F	R	G	F	E	A	Y	W	E	I	P	A	S	C	P	T	A	V	E	G	R	W	V	K	A	P	G	E	K	L	F	Q	K	I	Q	E	V	F	G	.	E	V	P	V	L	A	E	D	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.			S						T	G	G	G	G	T							T	T		S	S	S	T	T																				S	.	S								T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																																																	.
Template SS confidence
												276	.	.	.	280	.	.	.	.	.			.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Sequence		G	V	I	T	P	E	V	E	A	L	R	D	R	F	G	L	P	G	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	Q	F	A	F	D	D	G	M	E	N	P	F	L	P	H	N	Y	P	A	.	.	.	H	G	R	V	V	V	Y	T	G	T	H	D	N	D	T	T	L	G	W	Y	R	T	A	T	P	H	E
Template Known Secondary structure		T													T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	S	S	S	S		T	T		T	T	S	G	G	G	S		T	.	.	.	T							S			T	T	S										S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.										.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.				.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		348	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	P	L	A	Y	A	L	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	A	F	M	A	R	Y	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.