Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 54 Aligned Residues 400 % Identity 13% Template c3zt5D_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:putative glucanohydrolase pep1a; PDBTitle: glge isoform 1 from streptomyces coelicolor with maltose2 bound Resolution 2.09 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.				.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	.	.	.	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F
Query Conservation																.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	W	Y	E	F	F	P	R	S	E	G	T	P	H	T	P	H	G	T	F	R	T	A	A	R	R	L	P	A	I	A	A	M	G	F	D	V	V	Y	L	P	P	I	H	P	I	G	T	T	H	R	K	G	R	N	N	T	L	S	A	T	G	D	D	V	G	V	P	W	A	I	G	S	P	E	G	G	H	D
Template Known Secondary structure									G	G	G	S			S	S			S							G	G	G							T	T										S		B			T	T			B	G	G	G	B	S	S			T	T					T	T	S	B		B	T	T	B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	H	P	A	L	G	T	L	D	D	F	D	H	F	V	T	E	A	G	K	L	G	L	E	I	A	L	D	F	A	L	Q	C	S	P	.	.	.	D	H	P	W	V	H	K	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			G	G	G																T	T													T	.	.	.	T	S							G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.	330	.	.	.	.	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	F	H	H	R	P	D	G	T	I	A	H	A	E	N	P	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	Q	D	I	Y	P	I	A	F	D	A	D	P	D	G	L	A	T	E	T	V	R	I	L	R	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S				T	T	S								T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M
Query Conservation
Alig confidence				.																																	.																					.	.	.
Template Conservation				.																																	.																					.	.	.
Template Sequence		W	M	.	D	H	G	V	R	I	F	R	V	D	N	P	H	T	K	P	V	A	F	W	E	R	V	I	A	D	I	N	G	T	D	P	.	D	V	I	F	L	A	E	A	F	T	R	P	A	M	M	A	T	L	A	Q	.	.	.	I	G	F	Q	Q	S	Y	T	Y	F	T	W	R	N	T	K	Q	E	L	T	E
Template Known Secondary structure				.	T	T	T							S		G	G	G	S																	T	.	T									S											.	.	.		T		S					S	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure				.																																	.																					.	.	.
Template SS confidence
		383	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.				.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.																											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	Y	L	T	E	L	S	G	E	A	A	S	Y	M	R	P	N	F	F	A	N	T	P	D	I	L	H	A	Y	L	Q	H	G	G	R	P	A	F	E	V	R	A	V	.	.	.	L	A	A	T	L	S	P	T	W	G	I	Y	S	G	Y	E	L	C	E	N	T	P	L	R	E	G	S	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.							T	G	G	G	G	T							S		B	T	T	B																			.	.	.							S						T	T	T	T	T	T				B	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template SS confidence
									458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.				500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
										381	.	.	.	.	.	.							.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.			.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	.	.	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.																					.	.	.												.	.													.	.
Template Conservation																																																																							.	.
Template Sequence		E	Y	L	D	S	E	K	Y	Q	L	K	P	R	D	W	T	R	A	A	R	E	G	T	T	I	A	P	L	V	T	R	L	N	T	I	R	R	E	N	P	A	L	R	Q	L	R	D	L	H	F	H	P	T	D	K	E	E	V	I	A	Y	S	K	R	Q	G	S	N	T	.	.	V	L	V	V	V	N	L	D	P
Template Known Secondary structure		S	B	T	T		T	T	S	S													T																		G	G	G	G		S	S							B	S		T	T									T	T			.	.									S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Template SS confidence
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.			.	.	.	600	.	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.									.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																																						.	.
Template Sequence		R	H	T	Q	E	A	T	V	S	L	D	M	P	Q	L	G	L	D	W	H	E	S	V	P	V	R	D	E	L	T	G	E	T	Y	H	W	.	.	G	R	A	N	Y	V	R	L	E	P	G	R	T	P	A	H	V	C	T	V
Template Known Secondary structure		S	S										T	G	G	G	T			T	T								T	T	T	T						.	.		S								T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.
Template SS confidence
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.			.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.