Job Description P26612 Confidence 85.45% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 272 Aligned Residues 350 % Identity 15% Template c3ogrA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: complex structure of beta-galactosidase from trichoderma reesei with2 galactose Resolution 1.50 Å

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		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.		.	.			.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure																			.			.	.
Query SS confidence																			.			.	.
Query Sequence		A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	.	P	P	.	.	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V
Query Conservation																			.			.	.
Alig confidence																			.			.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		L	D	V	F	H	K	I	K	A	L	G	F	N	T	V	S	F	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	K	P	G	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	D	G	I	F	S	L	E	P	F	F	E	A	A	T	K	A	G	I	Y	L	L	A	.	.
Template Known Secondary structure											T	T															S	B	T	T	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G		S											T						.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	K	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G	G			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																														134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	T	D	A	P	D	Y	L	H	A	T	D	N	Y	V	A	H	I	A	S	I	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	V	I	L	Y	Q	P	E	N	E	Y	S	G	A	A	.	.	.	E	G	V	L	F	P	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S																							T	B	G	G	G	T	S	S							S	S					B		.	.	.	T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.
Template SS confidence
																									159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.				.	.	.	.	210	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P
Query Conservation
Alig confidence														.
Template Conservation														.
Template Sequence		K	P	Y	M	Q	Y	V	I	D	Q	A	R	.	N	A	G	I	I	V	P	L	I	N	N	D	A	F	P	G	G	T	G	A	P	G	T	G	L	G	S	V	D	I	Y	G	H	D	G	Y	P	L	G	F	D	C	A	H	P	S	A	W	P	D	N	G	L	P	T	T	W	R	Q	D	H	L	N	I	S	P	S
Template Known Secondary structure														.		T	T			S		B	B			B	S	S	S			T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	T		S			S		T	T				T	T		S													T	T
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		322	.	.	.	.	.							.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.				.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		F	H	A	V	T	L	.	.	.	.	.	.	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	.	.	.	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.																					.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																																									.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	F	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	F	G	G	W	G	F	E	Q	C	S	A	L	V	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	N	M	A	A	G	V	T	I	F	N	I	Y	M	T	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G	H	P	G	G	Y	T	S	Y	D	Y	G	A	S	I	R	E	D
Template Known Secondary structure		S									S	S					T	T	S										S	S														T	T		S											B			T	T		B		T	T	S		S	B			T	T		S	B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
					388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.									.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K
Query Conservation		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	I	D	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	Q	G	Q	F	L	K	V	S	P	G	Y	I	T	A	T	P	E	N	A	T	Q	G	V	Y	S	D	S	Q	N	I	V	I	T	P	L	L	A	K	E	S	G	.	.	D	F	F	V	V	R	H	A	N	Y	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	T	A
Template Known Secondary structure						S															T		T					S						B	S	S	S	S	S	S		S	S									S	S	S		.	.								S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.			.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.									.	.	440	.
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E
Query Conservation
Alig confidence																					.
Template Conservation																					.
Template Sequence		S	Y	T	V	K	L	P	T	S	A	G	D	L	T	I	P	Q	L	G	.	G	S	L	T	L	T	G	R	D	S	K	I	H	V	T	D
Template Known Secondary structure										T	T							T	T	S	.							T	T
Template Predicted Secondary structure																					.
Template SS confidence
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460		.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.