Job Description P26612 Confidence 98.01% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 130 Aligned Residues 354 % Identity 14% Template c3mi6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of the alpha-galactosidase from lactobacillus2 brevis, northeast structural genomics consortium target lbr11. Resolution 2.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																																																.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		N	W	E	A	T	Y	F	D	F	N	E	A	K	L	X	T	I	V	N	Q	A	K	R	L	G	I	E	X	F	V	L	D	D	G	W	F	G	H	R	D	D	D	T	T	S	L	.	.	G	D	W	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	Q	R	K	F	P	D	.	.	G	I	E	H	F	S	Q	A	V
Template Known Secondary structure							T	T																		T								T	T		B	T	T		S	S	T	T	S		T	.	.	T			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T	T		T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.			.	.	.	.										.	.	.	.	390	.	.	.			.	.	.	.	.	.	400	.	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	Q	Q	G	X	K	F	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	F	E	P	E	X	V	S	V	D	S	D	L	Y	Q	Q	H	P	D	W	L	I	H	A	P	K	S	T	P	T	P	G	R	H	Q	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				S	S	S	S						G	G	G	B				T	T						S	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.															.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	X	A	R	P	E	V	V	D	Y	L	F	K	L	X	S	Q	X	I	E	S	A	N	L	D	Y	I	K	W	D	X	N	R	Y	A	T	E	X	F	S	S	R	L	T	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T																				T		S								S				S				S	S	S		G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																				449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
												242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	Q	L	E	L	P	H	R	Y	I	L	G	V	Y	Q	L	Y	A	R	L	T	Q	A	Y	P	.	N	V	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	C	A	S	G	G	G	R	F	D	L	G	X	X	Y	Y	A	P	Q	A	W	T	S	D	D	T	D	A	A	E	R	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G																					T	.	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	T	T	T	S	S		S							S	S						S
Template Predicted Secondary structure																												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.			320	.	.	.	.				.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.						.	.	.
Query SS confidence										.	.						.	.	.
Query Sequence		F	T	G	T	L	V	E	A	.	.	D	P	F	H	A	.	.	.	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P
Query Conservation										.	.						.	.	.
Alig confidence										.	.						.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	Q	F	G	T	S	Y	G	Y	P	Q	A	X	X	G	A	H	V	S	A	V	P	N	D	Q	X	G	R	I	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	T	R	G	A	V	A	F	F	.	G	D	L	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	D	I	T	K
Template Known Secondary structure								T	T	T	S		G	G	G								S	S		T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S	.	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.												590	.	.	.	.	.	.	.	.	.		600	.	.	.	.																.	.	.	.	.	610
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.					.	.	410	.	.	.	.	.					.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.									.	.	.	.																								.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.									.	.	.	.																								.	.	.
Query Sequence		I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	.	.	.	.	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	.	.	.	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N
Query Conservation																							.	.	.	.									.	.	.	.																								.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.									.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	A	P	T	E	L	D	Q	V	K	K	Q	V	A	F	Y	K	C	Y	R	Q	L	F	Q	F	G	K	F	Y	R	I	D	S	P	F	V	E	D	G	N	V	T	S	W	Q	V	V	S	D	D	Q	K	Q	A	I	A	A	R	Y	Q	L	L	N	H	P	N	A	P	Y	T	R	F	Y	F	K	G	L	R	P	N
Template Known Secondary structure																				T							S						S		T	T	S	T	T											T	T	S	S									S	S			S	S										S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.					.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.											.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	.	.	.	.	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V	I
Query Conservation																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.										.	.	.	.				.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		Q	R	Y	Q	I	.	.	.	N	D	D	P	S	T	Y	Y	G	D	E	L	X	N	A	G	.	.	.	Y	F	V	P	T	I	L	A	D	G	Q	E	S	K	D	F	Y	T	Q	L	F	V	V	T	A	I	L
Template Known Secondary structure							.	.	.	T	T			S										T		.	.	.										S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		691	.	.	.	.				.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.				.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.