Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 411 % Identity 17% Template c3edeB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: structural base for cyclodextrin hydrolysis Resolution 1.71 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.		.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	.	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A
Query Conservation																																				.
Alig confidence																																				.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	D	I	R	G	T	I	D	H	L	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T	P	L	V	E	N	D	A	A	A	Y	S	Y	H	G	Y	A	A	T	D	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	D	P	R	Y	G	S	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	M	G
Template Known Secondary structure											T							T	T															S	S		G	G	G			S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.										190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K
Query Conservation
Alig confidence													.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	Q	D	V	V	L	S	H	I	G	.	.	K	H	H	W	W	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	.	.	.	.	.	.	G	K	F	V	P	T	Q	H	H
Template Known Secondary structure									S	B			.	.	T	T		G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	T	T	S	B	G	G	G	.	.	.	.	.	.	G	S			B
Template Predicted Secondary structure													.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.	230	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.							.	.	.	.	.	.	250	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	V	A	V	Q	D	P	Y	A	A	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	M	P	D	L	N	Q	T	N	P	L	V	A	N	Y	L	I	Q	N	N	I	W	W	I	E	Y	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	M	A	E	Y
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S		T	T												S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S																			T		S					S	S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.								.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.					.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Query Sequence		P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	.	.	.	.	.	.	.	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	.	.	.	.	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Alig confidence			.																								.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		P	.	R	L	N	M	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	H	L	P	S	L	M	D	F	P	L	V	D	A	M	R	N	A	L	S	K	T	G	E	E	N	G	L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	P	Q	N	L	V
Template Known Secondary structure		T	.	T										S							T	T	S	T	T				T	T										B															T	T	S	S		T	T									G	G	G	G	S	S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		333		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.					.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	.	.	.	.	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																		.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.												.																			.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.												.
Template Sequence		L	F	G	G	N	H	D	M	A	R	M	F	S	A	A	G	E	.	D	F	D	R	W	R	M	N	L	V	F	.	L	M	T	M	P	R	I	P	Q	F	Y	S	G	D	E	I	L	M	T	S	T	V	K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S	G	A	G
Template Known Secondary structure				S			T	T	S							T	T	T	.												.				S	S	S						T	T	G	G	G	T						S	S			G	G	G	G					T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																			.												.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.		.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.					.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																			.	.	.																																													.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																			.	.	.																																													.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	.	.	.	.	N	Y	G	N	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																			.	.	.																																													.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																			.	.	.																							.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.
Template Sequence		L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q	P	V	I	H	N	G	R	L	M	H	F	G	P	E	E	N	T	W	V	Y	F	R	Y	N	K	D	K	.	.	.	R	I	M	V	A	M	N	N	N	D	K	P	M	T	L	P	T	A	R	F	Q	E	M	L	K	G	A	P
Template Known Secondary structure																						T															B	T	T									S	S		.	.	.									S	S	S						G	G	G	G					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.				.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.			.	.	.
Template Conservation															.	.	.			.	.	.
Template Sequence		S	G	V	D	F	L	S	G	K	T	V	G	L	.	.	.	G	R	.	.	.	E	L	R	L	A	P	K	S	V	V	V	I	E	L
Template Known Secondary structure					B	T	T	T							.	.	.	S	S	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.			.	.	.
Template SS confidence
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.				580	.				.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.