Job Description P26612 Confidence 98.80% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 113 Aligned Residues 356 % Identity 10% Template c3cc1B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative alpha-n-acetylgalactosaminidase; PDBTitle: crystal structure of a putative alpha-n-acetylgalactosaminidase2 (bh1870) from bacillus halodurans c-125 at 2.00 a resolution Resolution 2.00 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30					.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	.	.	.	.	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I
Query Conservation																					.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																									.	.
Template Sequence		W	D	C	Y	G	A	S	V	T	E	E	E	V	L	G	N	A	E	Y	X	A	N	H	L	K	K	Y	G	W	E	Y	I	V	V	D	I	Q	W	Y	.	.	E	P	T	A	N	N	P	F	A	P	L	C	X	D	E	Y	G	R	L	L	P	A	T	N	R	F	P	S	A	K	N	G	A	G	F	K	P	L	S
Template Known Secondary structure						T	T																		T	G	G	G	T								S		T	T	.	.		T	T				T	T					B		T	T	S		B				T	T	T		G	G	G	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.
Template SS confidence
		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.			.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	I	H	D	L	G	L	K	F	G	I	H	I	X	R	G	I	P	R	Q	A	V	Y	E	N	S	P	V	L	G	S	T	K	T	A	R	E	I	A	H	T	N	S	I	C	P	W	N	T	D	X	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T									S	S									T		B		T	T	S	S		B							T	T			B	T	T	B		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	V	D	P	T	K	E	G	A	Q	S	Y	Y	N	S	L	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.						.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.
Query Sequence		R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	.	.	.	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K
Query Conservation																							.	.	.	.	.
Alig confidence					.																		.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation					.																																															.	.
Template Sequence		E	L	Y	.	A	Q	W	G	V	D	F	V	K	V	D	D	I	A	A	S	R	L	Y	D	T	H	L	E	E	I	K	X	I	Q	R	A	I	Q	A	C	G	R	P	X	V	L	S	L	S	P	.	.	G	P	A	P	I	K	W	R	I	T	D	D	F	W	D	D	W	S	L	L	Y	Q	X	F	E	R	C	E
Template Known Secondary structure					.			T	T								S		S		B	T	T	B																T	S	S	S									.	.		S						T	T	S		S			S
Template Predicted Secondary structure					.																																															.	.
Template SS confidence
		170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.			.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	W	E	K	H	I	G	T	G	H	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	C	G	X	L	P	L	G	H	I	G	I	R	S	V	D	G	P	G	G	D	R	W	T	R	F	T	K	D	E	Q	L	T	X	X	N	L	W	A	I	C	.	.	H	S	P	L	X	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	S	S			S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						B			S				S	S		S	S	S	S	S	S	S					S																.	.	T							S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.											.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310			.	.	.	.	.	.	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.																						.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	L	R	D	N	D	E	W	T	L	S	L	L	T	N	E	G	I	L	S	I	N	Q	K	S	V	L	N	R	F	V	Y	R	E	E	D	K	V	A	W	A	A	N	G	R	N	G	E	.	.	A	Y	V	A	L	F	N	L	H	D	Q	Q	K	T	L	Q	F	R	L	D	X	V	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.		G	G	G																															T	T									S	S	S		.	.									S	S	S								G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Template SS confidence
									319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.			.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																					.
Template Conservation																								.
Template Sequence		I	X	E	T	V	Q	L	F	N	V	W	D	R	S	F	L	Q	S	L	A	P	S	.	E	S	F	Q	I	E	L	K	P	H	Q	S	X	X	L	K	L
Template Known Secondary structure				S							T	T	T									T	T	.									T	T
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.		.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.