Job Description P26612 Confidence 80.13% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 302 Aligned Residues 321 % Identity 14% Template c3a24A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of bt1871 retaining glycosidase Resolution 2.30 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Sequence		G	V	N	N	P	T	Y	K	A	Y	I	D	F	A	S	A	N	G	I	E	Y	V	I	L	D	.	.	.	.	.	E	G	W	A	V	N	L	Q	A	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Q	V	V	K	E	I	.	.	.	.	D	L	K	E	L	V	D	Y	A	A	S	K	N	V	G	I
Template Known Secondary structure		S	S	S														T	T								.	.	.	.	.	T	T	S	B		T	T	S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		B		T	T		.	.	.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350						.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.													.	.	.	.	.	.	.					.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	W	A	G	Y	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	R	D	M	E	N	V	C	R	H	Y	A	E	M	.	G	V	K	G	F	K	V	D	F	M	D	R	D	D	Q	E	M	T	A	F	N	Y	R	A	A	E	M	C	A	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	S												.	T													S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template SS confidence
																																				393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.		.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		258	.	260	.			.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.
Query SS confidence						.	.
Query Sequence		K	P	L	F	.	.	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P
Query Conservation						.	.
Alig confidence						.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	L	I	L	D	L	H	G	T	H	K	P	A	G	L	N	R	T	Y	P	N	V	L	N	F	E	G	V	N	G	L	E	Q	M	K	W	S	S	P	S	V	D	Q	V	K	Y	D	V	M	I	P	F	I	R	Q	V	S	G	P	M	D	Y	T	Q	G	A	M	R	N	A	S	K	G	N	Y	Y	P	C	Y
Template Known Secondary structure		T	T							S					T	T						T	T							S			G	G	G	G	G	T			T	T	S							T	T	G	G	G	T					S									S	S				T	T						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	P	M	S	Q	G	T	R	C	R	Q	L	A	L	Y	.	.	.	V	V	F	E	S	.	P	F	N	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	D	T	P	S	N	Y	M	R	E	P	E	S	T	A	F	I	A	E	.	.	.	.	.	.	.	I	P	T	V	W	D	E	S	I	V	L
Template Known Secondary structure		S	S					S										.	.	.			S			.	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							T											.	.	.	.	.	.	.	S		S	S		S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.				.	.	.	.	.		.	540	.	.	.														.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.								.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
		416				.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.												.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	.	.	.	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C
Query Conservation			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.													.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.
Template Sequence		D	G	K	M	G	E	Y	I	V	T	A	R	R	K	G	D	.	.	V	W	Y	V	G	G	I	T	D	W	S	A	R	D	I	E	V	D	C	S	F	L	G	D	K	S	Y	H	A	T	L	F	K	D	G	V	N	A	H	R	A	G	R	D	Y	K	C	E	S	F	P	I	K	K	D	G	K	L	K	V	H	L
Template Known Secondary structure					T	T	T									T	T	.	.										S	S									T	T	S		S	S											T	T	T	T	T		T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.
Template SS confidence
		574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.			590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	P	G	G	G	F	A	L	K	I	K
Template Known Secondary structure			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		652	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.