Job Description P26612 Confidence 65.40% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 373 Aligned Residues 342 % Identity 12% Template c3a23A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative secreted alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of beta-l-arabinopyranosidase complexed with d-2 galactose Resolution 1.90 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.						30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	.	.	.	.	.	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A
Query Conservation																				.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.																								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Conservation																																																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Sequence		W	N	S	F	A	A	K	I	D	Y	S	V	I	K	K	Q	V	D	A	F	V	A	A	G	L	P	A	A	G	Y	T	Y	I	N	I	D	E	G	W	W	Q	G	T	R	D	S	.	A	G	N	I	T	V	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	W	P	G	.	.	G	M	S	A	I
Template Known Secondary structure						T	T																	T	T					T								T	T	S			S		B		T	.	T	S		B				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.		.	110	.	.	.	.	.	.														.	.	.	120	.			.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	Y	I	H	S	K	G	L	K	A	G	I	Y	T	D	A	G	K	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T									S	S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.															.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	G	Y	Y	Y	P	T	G	R	P	A	A	P	G	S	G	S	E	G	H	Y	D	Q	D	M	L	Q	F	S	T	W	.	G	F	D	F	V	K	V	D	W	C	G	G	D	A	E	G	L	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S		S	S	S				T	T		S		T	T													.	T		S													T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template SS confidence
																															148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
						242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																															.
Query SS confidence		.	.	.	.																															.
Query Sequence		.	.	.	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	.	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L
Query Conservation		.	.	.	.																															.
Alig confidence		.	.	.	.																															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	T	Y	K	S	I	S	D	A	V	G	R	A	A	A	T	T	G	R	P	L	T	L	S	I	C	N	W	G	Y	Q	N	P	W	N	W	A	A	G	Q	A	P	L	W	R	T	S	T	D	I	I	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	Q	P	S	M	T	S	L	L	S	N	F	D	Q
Template Known Secondary structure																				S										T	T	T	T		G	G	G	T		T	T	T		S					S	S		S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.												.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																										.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																																										.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	H	P	T	A	Q	H	T	G	Y	Y	N	D	P	D	M	L	M	V	G	M	D	G	F	T	A	A	Q	N	R	T	H	M	N	L	W	A	I	S	.	.	.	.	G	A	P	L	L	A	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	T	T	M	T	S	E	T	A	G	I	L	K
Template Known Secondary structure					T	T	T		B	T	T	B						S			T	T		T	T																	.	.	.	.	T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G										T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.					.	.	.	310	.	.	.	.															.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
			396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.						450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																						.																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																						.																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	.	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	.	.	.	.	.	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R
Query Conservation		.																						.																																		.	.	.	.	.
Alig confidence		.																						.																		.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		N	P	E	V	I	A	V	D	Q	D	S	R	G	L	Q	G	V	K	V	A	E	D	T	T	G	L	Q	A	Y	G	K	V	L	S	G	T	G	N	R	A	.	V	V	L	L	N	R	T	S	A	A	H	D	I	T	V	R	W	S	D	L	G	L	T	N	A	S	A	T	V	R	D	L	W	A	R	Q	N	V	G
Template Known Secondary structure										T		T	T												T	T									S	S	S	S				.							S	S	S								T	T	T	T	T	B		S	S							T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.
Template Conservation			.	.	.
Template Sequence		T	.	.	.	S	A	T	G	Y	T	A	S	V	P	A	G	G	S	V	M	L	T	V
Template Known Secondary structure			.	.	.		S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.
Template SS confidence
		408				.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.