Job Description P26612 Confidence 88.59% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 254 Aligned Residues 342 % Identity 13% Template c2zq0B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-glucosidase (alpha-glucosidase susb); PDBTitle: crystal structure of susb complexed with acarbose Resolution 1.60 Å

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		9	10	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	F	H	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																																																																						.	.
Template Sequence		I	G	V	W	W	D	M	I	T	G	K	G	S	W	A	Y	T	D	E	L	T	S	V	K	L	G	E	T	D	Y	S	K	T	K	P	N	G	K	H	S	A	N	T	A	N	V	K	R	Y	I	D	F	A	A	A	H	G	F	D	A	V	L	V	E	G	W	N	E	.	.	G	W	E	D	W	F	G	N	S	K
Template Known Secondary structure					T						T	S	S	B	S		S	B	S	S		S				T	T	T			G	G	G	S		B		S		B																	T	T		S						S		B	T	.	.	T	G	G	G		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.			.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.								.	.	.	.																					.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.								.	.	.	.																					.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	V	F	D	F	.	.	.	.	.	.	V	T	P	Y	P	D	F	.	.	.	.	D	V	K	E	I	H	R	Y	A	A	R	K	G	I	K	M	M	M	H	H	.	.	.	E	T	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S				S	.	.	.	.	.	.	S		B		T	T		.	.	.	.												T	T								.	.	.			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.								.	.	.	.																					.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.							.	.	.	.	.	.	.					.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	R	N	Y	E	R	H	M	D	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																							443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.									.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.			.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Query Sequence		W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	.	.	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Alig confidence										.											.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation										.
Template Sequence		A	Y	Q	F	M	A	D	N	.	G	Y	N	S	V	K	S	G	Y	V	G	N	I	I	P	R	G	E	H	H	Y	G	Q	W	M	N	N	H	Y	L	Y	A	V	K	K	A	A	D	Y	K	I	M	V	N	A	H	E	A	T	R	P	T	G	I	C	R	T	Y	P	N	L	I	G	N	E	S	A	R	G	T	E
Template Known Secondary structure									T	.	T										S	S		B	S	T	T			T	T	S																	T	T						T	T	S					S	G	G	G	T		T	T							S			G	G
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.		.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	S	F	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	K	V	Y	H	T	T	I	L	P	F	T	R	L	V	G	G	P	M	D	Y	T	P	G	I	F	E	T	H	C	N	K	M	N	P	A	N	N	S	Q	V	R	S	T	I	A	R	Q	L	A	L	Y	V	T	.	.	.	.	M	Y	S	P	L	Q	M	A	A
Template Known Secondary structure		G	G	T	T	.	.	.	.	.	.	.	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	T	T	T	T	T	S		B							S			B	G	G	G	T		T	T				B		S	S												.	.	.	.	S			S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		533	.	.	.								.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.					.	.	.	.	.	.	.	600	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.				.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.
Query Sequence		D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	.	.	.	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K
Query Conservation																																																		.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	Y	E	R	F	M	D	A	F	Q	F	I	K	D	V	A	L	D	W	D	E	T	N	Y	L	E	A	E	P	G	E	Y	I	T	I	A	R	K	A	K	D	T	D	D	W	Y	V	G	C	T	A	G	E	N	G	H	T	S
Template Known Secondary structure		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T												S	S											T	T	T									T	T	S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		602	.	.																			.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.		460	.	.	.	.	.	.	.														.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	.	D	F	L	G	N	R	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V
Query Conservation																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	V	F	D	F	L	T	P	G	K	Q	Y	I	A	T	V	Y	A	D	A	K	D	A	D	W	K	E	N	P	Q	A	Y	T	I	K	K	G	I	L	T	N	K	S	K	L	N	L	H	A	A	N	G	G	G	Y	A	I	S	I	K	E	V
Template Known Secondary structure						T	T	S		T	T												T	T		B	T	T	T	B	T	T											T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		664	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.