Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 56 Aligned Residues 439 % Identity 19% Template c2ze0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-glucosidase; PDBTitle: alpha-glucosidase gsj Resolution 2.00 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10					.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.
Query Sequence		M	R	N	P	T	L	L	Q	C	F	.	.	.	.	H	W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K
Query Conservation												.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.																																					.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	E	G	V	A	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	D	A	N	G	D	G	I	G	D	L	R	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	V	E	L	G	V	D	I	V	W	I	C	P	I	Y	R	.	.	S	P	N	A	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	M	D	E
Template Known Secondary structure												G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T												.	.				T	T	T	T		S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.										70	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	T	M	D	D	F	D	E	L	L	A	Q	A	H	R	R	G	L	K	V	I	L	D	L	V	I	N	H	T	S	.	.	D	E	H	P	W	F	I	E	S	R	S	S	R	D	N	P	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure		G																T	T										S	B			.	.	T	T	S										S	S	S	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.			.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.																													.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.																																																												.
Template Conservation								.	.	.																																																												.
Template Sequence		W	Y	I	W	R	D	.	.	.	G	K	D	G	R	E	P	N	N	W	E	S	I	F	G	G	S	A	W	Q	Y	D	E	R	T	G	Q	Y	Y	L	H	I	F	D	V	K	Q	P	D	L	N	W	E	N	S	E	V	R	Q	A	L	Y	E	M	V	N	W	W	L	.	D	K	G	I	D	G	F	R	I	D	A
Template Known Secondary structure		G	B					.	.	.		B	T	T	B		S	S					T	T	S	S	B	S					T	T	T	T						S	S		T	T			B	B		T	T																	.			T								S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.																																																												.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130				.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		237	.	.	240	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.		.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query Sequence		V	K	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	.	E	G	K	T	M	L	F	D	A
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.																							.
Template Conservation																																																.	.
Template Sequence		I	S	H	I	K	K	K	P	G	L	P	D	L	P	L	K	Y	V	P	S	F	A	G	H	M	N	Q	P	G	I	M	E	Y	L	R	E	L	K	E	Q	T	F	A	R	Y	D	.	.	I	M	T	V	G	E	A	N	G	V	T	V	D	E	A	E	Q	W	V	G	E	E	N	G	V	F	N	M	I	F	Q	F
Template Known Secondary structure		G	G	G	S	S			T	T								S								S	S		T	T												T	G	G	G	S	S	.	.								T	T			T	T	T	T						S	S	S		S		S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.			.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.			.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.
Query SS confidence																																																										.	.
Query Sequence		P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	.	.	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P
Query Conservation																																																										.	.
Alig confidence																																																										.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	L	G	L	W	E	R	R	A	S	I	D	V	R	R	L	K	R	T	L	T	K	W	Q	K	G	L	E	N	R	G	W	N	A	L	F	L	E	N	H	D	L	P	R	S	V	S	T	W	G	N	D	R	D	Y	W	A	E	S	A	K	A	L	G	A	L	Y	F	F	M	Q	G	T	P	F	I	Y	Q	G
Template Known Secondary structure		T	T																											T	T	T			B				S			T	T	S							T	S		S	S	S	S														T	S	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380																					.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	T	Y	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	P	I	I	E	Q	L	D
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	I	G	M	T	N	V	R	F	D	D	I	R	D	Y	R	D	V	S	A	L	R	I	I	W	K	T	G	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	G	A	S	N	A	G	F	T	T	G	T	P	W	I	K	V	N	E	N	Y	R	T	I	N	V	E	A	E	R	R	D	P	N	S	V	W	S	F	Y	R
Template Known Secondary structure		G	G	G	T							S	S	G	G	G			S												G	G	G	G	T	S						S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.											.
Query SS confidence													.	.	.											.
Query Sequence		E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	.	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D
Query Conservation													.	.	.											.
Alig confidence													.	.	.											.													.	.	.																									.													.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.																									.													.	.	.
Template Sequence		Q	M	I	Q	L	R	K	A	N	E	L	F	V	Y	G	T	Y	D	L	L	L	E	N	H	P	S	I	Y	A	Y	T	R	T	L	G	R	D	.	.	.	R	A	L	V	V	V	N	L	S	D	R	P	S	L	Y	R	Y	D	G	F	R	L	Q	S	.	S	D	L	A	L	S	N	Y	P	V	R	P	.	.	.
Template Known Secondary structure											T					S						S	T	T		S	S									T	T		.	.	.									S	S	S							T	T	S		B		G	.	G	G					S	S					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.																									.													.	.	.
Template SS confidence
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.				.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.		.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		H	K	N	A	T	R	F	K	L	K	P	Y	E	A	R	V	Y	I	W	K	E
Template Known Secondary structure			S	S	B	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.