Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 412 % Identity 20% Template c2z1kA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:(neo)pullulanase; PDBTitle: crystal structure of ttha1563 from thermus thermophilus hb8 Resolution 2.30 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.					10	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	N	P	T	L	L	Q	C	.	.	.	.	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G
Query Conservation											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.
Template Sequence		Y	E	G	A	F	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	F	R	A	G	P	P	G	R	P	A	P	A	G	P	F	E	P	W	E	A	P	P	T	L	R	G	F	K	G	G	T	L	W	G	V	A	E	K	L	P	Y	L	L	D	L	G	V	E	A	I	Y	L	N	P	V	F	A	S	T	A	.	.	.	N	H	R
Template Known Secondary structure		T	S	S								G	G	G	S				S				S	S				S					T	T	S				S	S													T								T													S	S	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.				.	.	80
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Sequence		Y	H	T	V	D	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	D	P	I	L	G	G	N	E	A	L	R	H	L	L	E	V	A	H	A	H	G	V	R	V	I	L	D	G	V	F	N	H	T	G	.	.	R	G	F	F	A	F	Q	H	L	X	E	N	G	E	Q	S	P	Y	R	D	W	Y	H	V	K	G
Template Known Secondary structure			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G	T															T	T										S	B			.	.	T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B		B		S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.										.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.			.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	Y	T	A	H	P	N	Y	E	A	W	W	G	N	P	E	L	P	K	L	K	V	E	T	P	A	V	R	E	Y
Template Known Secondary structure		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	S		S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		150	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.
Query SS confidence																												.
Query Sequence		I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M
Query Conservation																												.
Alig confidence											.																	.																	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation											.																																		.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	A	V	A	E	H	W	I	.	R	F	G	V	D	G	W	R	L	D	V	P	N	E	I	P	D	P	T	F	W	R	E	F	R	Q	R	V	K	G	A	N	P	.	E	A	Y	I	V	G	E	I	W	E	E	A	D	F	W	L	Q	G	.	.	.	.	.	D	X	F	D	A	V	X	N	Y	P	L	A	R
Template Known Secondary structure											.			T							S	S	G	G	G																			T	.	T								S	S			S	G	G	G	S	S	.	.	.	.	.	S	S		S			B
Template Predicted Secondary structure											.																																		.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.		.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.						.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation																																																																							.	.
Template Sequence		A	V	L	G	F	V	G	G	E	A	L	D	R	D	L	A	A	Q	T	G	L	G	R	I	E	P	L	Q	A	L	A	F	S	H	R	L	E	D	L	F	G	R	Y	R	P	E	V	V	R	A	Q	X	N	L	L	T	S	H	D	T	P	R	L	L	S	L	X	R	G	.	.	S	V	E	R	A	R	L	A	L
Template Known Secondary structure									G	G	G	S						T	T	S	T	T		S																	T	T	S	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.			.	.	.	.	330	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.						390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	.	.	.	.	.	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S
Query Conservation																																						.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.																			.	.	.																		.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		A	L	L	F	L	L	P	G	N	P	T	V	Y	Y	G	E	E	V	G	X	A	G	G	K	D	P	E	N	R	G	G	X	V	W	E	E	A	R	W	Q	K	D	L	R	E	T	V	K	R	L	A	R	L	R	K	E	H	P	A	L	R	T	A	P	Y	L	R	I	Y	A	Q	D	G	H	L	A	F	A	R	.
Template Known Secondary structure					T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	T	T	T								G	G	G	S																			T					S									T	T							.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.		.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.																									.
Query SS confidence																															.																									.
Query Sequence		G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	.	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	.	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W
Query Conservation																															.																									.
Alig confidence		.	.	.	.																										.																.	.	.							.
Template Conservation		.	.	.	.																																										.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	P	Y	L	A	V	V	N	A	S	P	H	P	F	R	Q	D	F	P	L	H	G	V	F	P	R	G	G	R	A	V	D	L	L	S	G	E	V	C	T	P	.	.	.	Q	G	G	R	L	C	G	P	V	L	P	P	F	S	L	A	L	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T	T								S	S	S						S	B		T	T	S		T	T							T	T	T							.	.	.	B	T	T	B								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																										.	.	.
Template SS confidence
						414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.				.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.