Job Description P26612 Confidence 98.04% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 129 Aligned Residues 315 % Identity 15% Template c2yfnA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase-sucrose kinase agask; PDBTitle: galactosidase domain of alpha-galactosidase-sucrose kinase,2 agask Resolution 1.45 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.					.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.
Query Sequence		P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	.	.	.	.	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V
Query Conservation																																																																.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	I	V	D	L	A	K	E	A	A	S	L	G	I	D	M	V	V	M	D	D	G	W	F	G	K	R	N	D	D	N	S	S	L	G	.	.	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	N	E	T	K	L	G	G	S	L	A	E	L	I	T	R	V	H	E	Q	G	M	K	F
Template Known Secondary structure													T	T	T								S	S	S	B	T	T		S	S	T	T	S		T	T	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B						T	S												T	T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.			.	.																.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	I	E	P	E	M	I	N	E	D	S	D	L	Y	R	A	H	P	D	W	A	I	R	I	Q	G	K	K	P	V	R	S	R	N	Q	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				S	S	S							G	G	G	B				T	T	S					B	T	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		409	410															.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.												.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	F	Y	K
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	F	S	R	K	E	V	R	D	C	V	F	D	Q	I	C	V	V	L	D	Q	G	K	I	D	Y	V	K	W	D	M	N	R	S	M	A	D	V	Y	A	G	N	L	S	Y	D	Y	V	L	G	V	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T																	T	T	S											S				S			S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	F	M	E	R	L	C	S	R	Y	P	D	L	L	L	E	G	C	S	G	G	G	G	R	F	D	A	G	M	L	Y	Y	S	P	Q	I	W	C	S	D	N	T	D	A	I	N	R	T	R	I	Q	Y	G	T	S	F	F	Y	P	V	S	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	H	V	S
Template Known Secondary structure												T	T							B	T	B	B	T	T		S					T	T		S					B	S															T	T	T	S		G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.													.	.	.	.	.
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	P	N	H	Q	T	G	R	V	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	H	T	R	G	V	T	A	M	A	G	T	F	G	Y	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	A	L	L	S	D	E	E	K	Q	Q	I	R	E	Q	I	K	T	Y	K	K	Y	E
Template Known Secondary structure			S	S		T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	T	T					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580										.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
		407					.	.	410	.	.	.	.	.			.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure			.	.	.	.									.	.																								.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.									.	.																								.	.	.
Query Sequence		H	.	.	.	.	G	V	Q	T	L	F	F	D	.	.	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	.	.	.	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D
Query Conservation			.	.	.	.									.	.																								.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.									.	.																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	I	N	E	G	T	Y	W	R	L	S	D	P	F	T	D	E	I	A	A	W	M	S	V	S	E	E	Q	D	H	A	L	V	S	V	V	R	L	M	A	E	A	N	Q	A	T	V	Y	V	R	L	R	G	L	K	P	D	A	V	Y	L	E
Template Known Secondary structure							S						S		T	T	T	S	S									T	T	S	S													S	S										S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.