Job Description P26612 Confidence 98.52% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 116 Aligned Residues 353 % Identity 14% Template c2xn1B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: structure of alpha-galactosidase from lactobacillus acidophilus ncfm2 with tris Resolution 2.30 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V
Query Conservation
Alig confidence																																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		D	K	L	K	T	I	V	D	K	A	K	K	L	G	L	E	M	F	V	L	D	D	G	W	F	G	H	R	D	D	.	D	N	S	S	L	G	D	W	K	V	Y	K	K	K	F	P	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	H	F	A	D	Y	V	H	E	Q	G	L	K	F	G	L	.	.
Template Known Secondary structure															T								T	T	S	B	T	T		S	S	.	T	T	S		T	T			S	B		T	T	T		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T						.	.
Template Predicted Secondary structure																																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.													.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	F	E	P	E	M	I	S	Y	E	S	N	L	Y	K	E	H	P	D	Y	L	M	H	V	P	G	R	K	P	C	P	S	R	N	Q	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				S	S	S							G	G	G	B				T	T	S					B	T	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.																				.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	L	G	R	K	E	V	R	D	N	I	F	E	Q	M	V	K	I	L	D	S	K	K	I	D	Y	I	K	W	D	M	N	R	S	L	S	D	I	Y	E	S	D	L	P	A	D	Q	Q	G	E	A	Y	H	R	Y	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T	S																T	T	S											S				S				T	T	S		G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F
Query Conservation
Alig confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	Y	Y	D	L	L	N	K	L	V	T	R	Y	P	D	I	L	F	E	G	C	S	G	G	G	G	R	F	D	V	G	Q	A	Y	Y	T	P	Q	I	W	A	S	D	N	T	D	A	I	E	R	L	K	I	Q	Y	G	T	S	L	V	Y	P	Q	S	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																T	T	S						B	T	B	B	T	T		S					T	T		S					B	S															T	T	T	S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	M	T	S	H	V	S	V	S	P	N	E	Q	N	G	R	I	T	P	F	N	T	R	G	A	V	A	M	.	.	.	.	.	.	W	G	D	L	G	Y	E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	K	M	S	D	E	E	S	D	Q	V	V	K	Q	V	T	E	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.								S	S		T	T	T														T	.	.	.	.	.	.	T	S						S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.							.	.	.	.	.	.	.	.	610															.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.					.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.			.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.										.																								.	.	.																												.	.
Query SS confidence						.	.	.	.										.																								.	.	.																												.	.
Query Sequence		Q	R	F	A	.	.	.	.	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	.	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	.	.	.	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	.	.	Q	E	R	V	V	T	D
Query Conservation						.	.	.	.										.																								.	.	.																												.	.
Alig confidence						.	.	.	.										.																								.	.	.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	K	I	R	E	V	T	Q	F	G	T	L	Y	R	L	K	A	S	A	S	N	Q	C	A	W	M	M	V	D	S	N	K	N	E	A	V	V	T	V	V	N	V	M	A	H	A	Q	P	Y	C	T	K	T	K	L	A	G	L	D	P	D	K	R	Y	K	N	L	E	T	D	E	V	F	G	G	D	E	L	M	H
Template Known Secondary structure											S								G	G	G	T									T	T	S											S			S	S										S			T	T	S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	G	F	Y	D	P	I	E	R	G	D	F	K	A	K	M	Y	H	F	K	A	I
Template Known Secondary structure		T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.