Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 423 % Identity 19% Template c2taaA_ PDB info PDB header:hydrolase (o-glycosyl) Chain: A: PDB Molecule:taka-amylase a; PDBTitle: structure and possible catalytic residues of taka-amylase a Resolution 3.00 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.						.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	.	.	.	.	.	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	S	Q	S	I	Y	F	L	L	T	D	R	F	A	R	T	D	G	S	T	T	A	T	C	N	T	A	D	Q	K	Y	C	G	G	T	W	Q	G	I	I	D	K	L	D	Y	I	Q	G	M	G	F	T	A	I	W	I	T	P	V	T	A	Q	L	P	Q	D	C	A	Y	G	D	A	Y	T	G	Y	W	Q	T	D
Template Known Secondary structure		G	G	S							B	T	T	B			T	T			T	T					G	G	G		S						G	G	G	G	G	T																			S				S	S			T	T				T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	N	E	N	Y	G	T	A	D	D	L	K	A	L	S	S	A	L	H	E	R	G	M	Y	L	M	V	D	V	V	A	N	H	M	G	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S	S	S			T	T													S									T	T	B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.										.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	G	S	S	V	D	Y	S	V	F	K	P	F	S	S	Q	D	Y	F	H	P	F	C	F	I	Q	N	Y	E	D	Q	T	Q	V	E	D	C	W	L	G	D	N	T	V	S	L	P	D	L	D	T	T	K	D	V	V	K	N	E	W	Y	D	W	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		G	G	G				S	S		T	T		S	S	S	T	T	B					B			S	G	G	G		S	S	T	T	T	S	B				T	T					B	B			S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Sequence		G	S	L	V	S	N	Y	S	I	D	G	L	R	I	D	T	V	K	H	V	Q	K	D	F	W	P	G	Y	N	K	A	A	G	.	.	.	.	.	.	V	Y	C	I	G	E	V	L	D	G	D	P	A	Y	T	C	P	Y	Q	.	.	.	N	V	M	D	G	V	L	N	Y	P	I	Y	Y	P	L	L	N	A	F
Template Known Secondary structure						T	T	T			S					T	T		S	T	T		T	T									S		.	.	.	.	.	.	S															T	G	G	G	.	.	.	T	T	T	S	B														S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.							.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.				.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		301	.	.	.	.	.	.				.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.
Query SS confidence									.	.	.
Query Sequence		R	M	G	R	D	Y	D	.	.	.	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D
Query Conservation									.	.	.
Alig confidence									.	.	.																																													.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.
Template Sequence		K	S	T	S	G	S	M	D	D	L	Y	N	M	I	N	T	V	K	S	D	C	P	D	S	T	L	L	G	T	F	V	E	N	H	D	N	P	R	F	A	S	Y	T	N	D	I	A	L	A	K	N	V	A	A	.	.	.	F	I	I	L	N	D	G	L	P	I	I	Y	A	G	Q	E	Q	H	Y	A	G	G	N
Template Known Secondary structure		S	S	T	T			T														B			T	T						S	S		T	T	S			G	G	G	S													.	.	.					S	S	S						T	T	T	T	T	T					S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.				.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.						390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.							.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	.	.	.	.	.	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	.	.	.	.	.	.	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T
Query Conservation														.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation																																																																		.	.
Template Sequence		D	P	A	N	R	E	A	T	W	L	S	G	Y	P	T	D	S	E	L	Y	K	L	I	A	S	A	N	A	I	R	N	Y	A	I	S	K	D	T	G	F	V	T	Y	K	N	P	Y	I	K	D	D	T	T	I	A	M	R	K	G	T	D	G	S	Q	.	.	I	V	T	I	L	S	N	K	G	A	S	G	D	S
Template Known Secondary structure		S	S	T	T				G	G	G	S	S			T	T	S																				S			T	T	T	S								S	S	S								S	T	T		.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Template SS confidence
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.			.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
		447	.	.					450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.
Query Sequence		I	H	L	.	.	.	.	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V	I
Query Conservation					.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																									.	.
Template Sequence		Y	T	L	S	L	S	G	A	S	Y	T	A	G	Q	Q	L	T	E	V	I	G	C	T	.	.	T	V	T	V	G	S	D	G	N	V	P	V	P	M	A	G	G	L	P	R	V	L	Y	P	T	E	K	L
Template Known Secondary structure							S	S					T	T						S	T	T			.	.						T	T	T							S	S	S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440			.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.