Job Description P26612 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 412 % Identity 18% Template c2e8yA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:amyx protein; PDBTitle: crystal structure of pullulanase type i from bacillus subtilis str.2 168 Resolution 2.11 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.				.	20	.	.	.	.	.	.	.												.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.								50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	T	L	L	Q	C	F	H	W	Y	Y	P	E	G	G	.	.	.	K	L	W	P	E	L	A	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	.	.	.	.	.	.	.	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F
Query Conservation																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	T	H	L	R	D	F	S	I	H	E	N	S	G	M	I	N	K	G	K	Y	L	A	L	T	E	T	D	T	Q	T	A	N	G	S	S	S	G	L	A	Y	V	K	E	L	G	V	T	H	V	E	L	L	P	V	N	D	F	A	G	V	D	E	E	K	P	L	D	A	Y	N	W	G	Y	N	P	L	H	F	F
Template Known Secondary structure											S	T	T	S			S	S	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T		B		T	T	S		B										T		S					S						S	S	S		T	T	S	G	G	G							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.									80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	E	G	S	Y	A	S	N	P	H	D	P	Q	T	R	K	T	E	L	K	Q	M	I	N	T	L	H	Q	H	G	L	R	V	I	L	D	V	V	F	N	H	V	Y	K	R	E	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	T	T	S	S		S	S	S																		T	T									T	T			S	S	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	E	K	T	V	P	G	Y	F	F	R	H	D	E	C	G	K	P	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	G	V	G	N	D	I	A	S	E	R	R	M	A	R	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	T	T	T	S	B		B		T	T	S	S	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	.	.	.	.	.	M	L	F	D
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.
Alig confidence																																													.																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.
Template Sequence		F	I	A	D	C	V	V	Y	W	L	E	E	Y	N	V	D	G	F	R	F	D	L	L	G	I	L	D	I	D	T	V	L	Y	M	K	E	K	A	T	K	A	K	P	.	G	I	L	L	F	G	E	G	W	D	L	A	T	P	L	P	H	E	Q	K	A	A	L	A	N	A	P	R	M	P	G	I	G	F	F	N
Template Known Secondary structure																						T	T	G	G	G	S	B															S	T	.	T													S	S		G	G	G	B			G	G	G	G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure																																													.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.		.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		290	.	.	.	.	.	.	.	.									.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.											.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	L	Q	M	K	F	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	M	F	R	D	A	V	K	G	N	T	F	H	L	K	A	T	G	F	A	L	G	N	G	E	S	A	Q	A	V	M	H	G	I	A	G	S	S	G	W	K	A	L	A	P	I	V	P	E	P	S	Q	S	I	N	Y	V	E	S	H	D	N	H	T	F	W	D	K	M	S	F	A	L	P	Q	E	N	D	S	R
Template Known Secondary structure												S	S	S	T	T				G	G	G	T		G	G	G									B	T	T	S		B	T	T	B			S	S	S	S	G	G	G					S			S	S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
			346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.												.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Query SS confidence		.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Query Sequence		.	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	.	.	.	.
Query Conservation		.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Alig confidence		.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	S	R	Q	R	L	A	V	A	I	I	L	L	A	Q	G	V	P	F	I	H	S	G	Q	E	F	F	R	T	K	Q	G	V	E	N	S	Y	Q	S	S	D	S	I	N	Q	L	D	W	D	R	R	E	T	F	K	E	D	V	H	Y	I	R	R	L	I	S	L	R	K	A	H	P	A	F	R	L	R	S	A
Template Known Secondary structure															T	S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T							S									T																		G	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
								410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.			.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	.	.	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	T	W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																								.	.																		.	.	.																									.
Template Conservation																																																		.	.	.																									.
Template Sequence		A	D	I	Q	R	H	L	E	C	L	T	L	K	E	H	L	I	A	Y	R	L	Y	D	L	D	E	V	D	E	W	K	D	I	I	V	I	H	H	A	S	P	D	S	V	E	W	R	L	.	.	.	P	N	D	I	P	Y	R	L	L	C	D	P	S	G	F	Q	E	D	P	T	E	I	K	K	.	T	V	A	V
Template Known Secondary structure															S	S										T	T	T		S	S	S									S	S	S							.	.	.	S	S		S								T	T											S	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.																									.
Template SS confidence
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.				.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.		.	.	.	700
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	G	I	G	T	V	I	L	Y	L	A	S
Template Known Secondary structure			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.