Job Description P26612 Confidence 98.14% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 127 Aligned Residues 321 % Identity 11% Template c1zy9A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase (ec 3.2.1.22) (melibiase)2 (tm1192) from thermotoga maritima at 2.34 a resolution Resolution 2.34 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A	I	D	A	L	K
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Sequence		W	Y	H	Y	F	L	D	L	T	W	E	E	T	L	K	N	L	K	L	A	K	N	F	P	F	E	V	F	Q	I	D	D	A	Y	E	K	D	I	G	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	T	R	G	D	F	P	.	.	.	S	V	E	E	X	A	K	V	I	A
Template Known Secondary structure						G	G	G													G	G	G	T	T		S						T	T	S				T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230																			.	.	.	.	.	.	.	.				.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I	E	N	P	D	E
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	G	F	I	P	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	T	A	P	F	S	V	S	E	T	S	D	V	F	N	E	H	P	D	W	V	V	K	E	N	G	E	P	K	X	A
Template Known Secondary structure			T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				T	T								G	G	G	B				T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.												240
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		Y	R	N	W	N	K	K	I	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	L	S	K	D	E	V	L	N	W	L	F	D	L	F	S	S	L	.	R	K	X	G	Y	R	Y	F	K	I	D	F	L	F	A	G	A	V	P	G	E	R	K	K	N	I	T
Template Known Secondary structure					T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T																.			T	T									G	G	G	G	G		S	S	B		S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.		.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.
Query SS confidence																																		.
Query Sequence		P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	.	K	L	Q	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I	F	T	G	T	L	V	E	A
Query Conservation																																		.
Alig confidence																																		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	Q	A	F	R	K	G	I	E	T	I	R	K	A	V	G	E	D	S	F	I	L	G	C	G	S	P	L	L	P	A	V	G	C	V	D	G	X	R	I	G	P	D	T	A	P	F	W	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	I	E	D	N	G	A	P	A	A	R	W	A	L	R	N	A	I	T	R
Template Known Secondary structure																			T	T	S						S		B	S	G	G	G	T	T	T		S					S	S				S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		S	S	S	S	S												T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.										.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I	I	E	Q	L	D	E	L	I
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	F	X	H	D	R	F	W	L	N	D	P	D	C	L	I	L	R	E	E	K	T	D	L	T	Q	K	E	K	E	L	Y	S	Y	T	C	G	V	L	.	.	D	N	X	I	I	E	S	D	D	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	R	D	H	G	K	K	V	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	B	T	T	T	B							B				S	S	S																		T	.	.	T							S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.			.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	E	T	L	E	L	L	G	G	R	P	R	V	Q	N	I	X	S	E	D	L	R	Y	E	I	V	S	S	G	T	L	S	G	N	V	K	I	V	V	D	L	N	S	R	E	Y	H	L
Template Known Secondary structure						T	T		S	S					T	T	T	T		S	S	S										T	T									T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.